免疫羊驼与抗血清制备
通过CD4-rFc免疫羊驼,获得高滴度抗血清,评估其抗HIV-1中和活性。
羊驼免疫4次,收集抗血清,ELISA测滴度,假病毒中和实验评估广谱性。
Highly potent and broadly neutralizing anti-CD4 trimeric nanobodies inhibit HIV-1 infection by inducing CD4 conformational alteration.
研究涵盖体外中和实验、结构解析、分子动力学模拟、人源化小鼠模型等多个独立证据层级,并包含功能与机制验证。
293F细胞表达体系 GHOST(3)-X4R5细胞 TZM-bl细胞 人源化NDG-HuPBL小鼠模型
中和实验使用200 TCID50假病毒或活病毒,在GHOST(3)-X4R5或TZM-bl细胞中检测 活病毒中和实验覆盖5株HIV-1毒株(BAL、CH058、THRO、CH042、CH198) 体内实验使用HIV-1CH058攻击,剂量10 ng P24,治疗组400 μg/只给药 治疗组采用腹腔注射和皮下注射,感染后1、3、5、7天共4次给药 病毒载量通过qRT-PCR检测,检测限为1000拷贝/ml
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过CD4-rFc免疫羊驼,获得高滴度抗血清,评估其抗HIV-1中和活性。
羊驼免疫4次,收集抗血清,ELISA测滴度,假病毒中和实验评估广谱性。
分离识别CD4的纳米抗体,并鉴定具有中和活性的克隆。
从免疫羊驼PBMC构建VHH噬菌体文库,经三轮淘选富集,挑选阳性克隆进行ELISA和中和活性测试。
测定纳米抗体的CD4结合亲和力及对多种HIV-1假病毒的中和广谱性和效力。
表达Nb-Fc融合蛋白,用BLI测亲和力,用35株假病毒进行中和实验,并与Ibalizumab比较。
解析Nb457与CD4的复合物结构,阐明中和机制。
通过X射线晶体学获得Nb457-D1D2复合物结构,并通过BLI实验验证对gp120结合的干扰。
通过构建三聚体形式增强中和活性,实现完全抑制。
构建Nb457-NbHSA-Nb457三聚体,评估其对5株活HIV-1的中和活性。
解释三聚体纳米抗体实现完全抑制的结构基础。
对CD4-gp120、Nb457-Fc+CD4-gp120和Nb457-NbHSA-Nb457+CD4-gp120三个系统进行MD模拟,分析氢键和RMSF。
评估Nb457对CD4+ T细胞功能的影响。
检测Nb457对CD4与MHC-II结合的影响,以及T细胞增殖、活化和细胞因子产生。
评估Nb457在人源化小鼠模型中的抗HIV-1疗效。
HIV-1CH058攻击NDG-HuPBL小鼠,给予Nb457-Fc、三聚体或Ibalizumab治疗,监测病毒载量和脾脏感染细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫 | 弗氏完全佐剂 | Sigma | F5881-10ML |
| 弗氏不完全佐剂 | Sigma | F5506-10ML | |
| 细胞表达 | FreeStyle 293-F细胞 | Thermo Scientific | R79007 |
| 蛋白纯化 | 蛋白A琼脂糖凝胶 | Thermo Scientific | 20334 |
| 镍离子亲和层析 | Thermo Scientific | R901100 | |
| Western blot | IRDye 800CW | Rockland | 926-32232 |
| ELISA | ELISA板 | Corning | 9018 |
| 山羊抗人IgG-HRP | Jackson ImmunoResearch | 109-035-088 | |
| 山羊抗羊驼IgG (H+L)二抗-HRP | Novus | NB7242 | |
| Infinite 200酶标仪 | Tecan | -- | |
| 文库构建 | 淋巴细胞分离液 | GE | 17-1140-02 |
| M13KO7辅助噬菌体 | Invitrogen | 18311019 | |
| 噬菌体筛选 | 抗M13噬菌体抗体-HRP | Sino Biological | 11973-MM05T-H |
| 蛋白纯化 | 蛋白G | Thermo Scientific | 20399 |
| 镍离子亲和层析 | Thermo Fisher Scientific | R901100 | |
| 亲和力测定 | 抗人Fc生物传感器 | ForteBio | 18-5060 |
| 中和实验 | GHOST(3)-X4R5细胞 | NIH AIDS Reagent Program | 3942 |
| TZM-bl细胞 | NIH AIDS Reagent Program | 8129 | |
| 病毒载量检测 | QIAamp病毒RNA迷你试剂盒 | Qiagen | -- |
| RT-PCR Prime Script试剂盒 | Takara | -- | |
| TaqMan通用PCR预混液 | Life Technologies | -- | |
| 流式分析 | 抗人CD3-Pacific Blue抗体 | Biolegend | 300442/UCHT1 |
| 抗人CD4-PerCP-Cy5.5抗体 | Biolegend | 317428/OKT4 | |
| 抗人CD8-PE抗体 | Biolegend | 344706/SK1 | |
| 抗人CD45 PE/Cy7抗体 | Biolegend | 304016/H130 | |
| NovoCyte流式细胞仪 | Agilent | -- | |
| 免疫荧光 | 抗P24纳米抗体兔Fc融合蛋白 | Abrev | AR0358 |
| FV3000共聚焦显微镜 | Olympus | -- | |
| 蛋白表达 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 蛋白纯化 | 镍离子亲和树脂 | GE Healthcare | -- |
| Superdex 200凝胶层析 | GE Healthcare | -- | |
| 结晶 | 三水合乙酸钠 | -- | -- |
| 安全性评估 | 通用核酸酶 | Yeasen | 20156ES25 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Life Technologies | -- |
| 细胞刺激 | 植物血凝素 | Ebioscience | 00-4977-93 |
| 细胞因子分析 | 布雷菲德菌素A | BioGems | 2031560 |
| 流式分析 | 可固定活性染料 | Ebioscience | 65-0866-14 |
| BD Cytofix/Cytoperm固定破膜液 | BD Biosciences | 554714 | |
| 抗TNFα BV786抗体 | Biolegend | Mab11 | |
| 抗IL-2 APC抗体 | BD | MQ1-17H12 | |
| 抗IFN-γ FITC抗体 | BD | 4S.B7 | |
| 抗Ki67 Pacific blue抗体 | Biolegend | RUO |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 免疫 | 羊驼年龄、性别、免疫剂量、佐剂类型 阅读提示:Methods: Alpaca immunization |
| 中和实验 | 细胞系、病毒接种量、稀释倍数 阅读提示:Methods: HIV-1 neutralization assay |
| 结构解析 | 蛋白浓度、结晶条件、数据收集波长 阅读提示:Methods: Crystallization, structural determination and data acquisition |
| 体内实验 | 小鼠品系、性别、数量、HIV-1毒株和剂量、给药方案 阅读提示:Methods: In vivo evaluation of Nbs inhibition of HIV infection in NDG-HuPBL mice |
| 分子动力学模拟 | 力场、水模型、模拟时长、盐浓度 阅读提示:Methods: Molecular dynamics simulations |