转基因鸡的构建与验证
验证截短轻链转基因能否整合并表达。
将tLC或tLCi构建体通过phiC31整合酶插入L链敲除等位基因,通过PCR和RT-PCR验证插入和转录。
Chickens with a Truncated Light Chain Transgene Express Single-Domain H Chain-Only Antibodies.
包含转基因构建、细胞培养、流式、ELISA、Western blot、RT-PCR、免疫、NGS、SPR、中和实验等多层级验证。
转基因鸡(Gallus gallus) 鸡原始生殖细胞系229-92 Expi293细胞表达系统 SARS-CoV-2假病毒中和模型
转基因鸡基因型:tLC/IgL KO或tLCi/IgL KO 免疫原及剂量:100 μg PGRN或SARS-CoV-2刺突蛋白,初始免疫用弗氏完全佐剂,加强用弗氏不完全佐剂 免疫程序:初次免疫后2周开始每两周肌注100 μg蛋白加佐剂,处死前4天静脉注射100 μg蛋白 单B细胞筛选:GEM法,使用5 μm醛乳胶珠包被链霉亲和素和生物素化抗原 中和实验:8点剂量反应稀释系列,范围0.003-50 μg/ml
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证截短轻链转基因能否整合并表达。
将tLC或tLCi构建体通过phiC31整合酶插入L链敲除等位基因,通过PCR和RT-PCR验证插入和转录。
评估tLC转基因对B细胞发育和抗体表达的影响。
通过流式细胞术分析PBMC中B细胞比例,ELISA检测血清IgM和IgY水平,Western blot和RT-PCR分析Ig重链结构。
验证转基因鸡能否产生特异性免疫应答。
用PGRN或SARS-CoV-2刺突蛋白免疫,ELISA检测血清滴度。
筛选并分析抗原特异性sdAb序列。
使用GEM法筛选单B细胞,RT-PCR扩增VH,克隆到表达载体,测序并分析突变。
评估重组sdAb的生物物理性质。
在Expi293细胞中表达sdAb-hFc,SEC分析单体性,DSF分析热稳定性。
测定sdAb的亲和力和表位多样性。
使用SPR平台(Carterra LSA)测定动力学和进行表位分箱。
评估sdAb对SARS-CoV-2变体的中和能力。
用假病毒中和实验检测,计算IC50。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | KO-DMEM培养基 | Thermo Fisher | 10829018 |
| 胎牛血清 | Hyclone | SH30088.03 | |
| 鸡血清 | Thermo Fisher | 16110082 | |
| GlutaMAX添加剂 | Thermo Fisher | 35050-061 | |
| 非必需氨基酸 | Thermo Fisher | 11140-050 | |
| 重组小鼠干细胞因子 | R&D Systems | 455-MC | |
| 重组人碱性成纤维细胞生长因子 | R&D Systems | 234-FSE | |
| 转染 | Nucleofector V缓冲液 | Lonza | VCA-1003 |
| BTX ECM830方波电穿孔仪 | BTX | -- | |
| 细胞培养 | G418 | Teknova | G5005 |
| PBMC分离 | Histopaque-1077 | Sigma-Aldrich | -- |
| 流式细胞术 | 抗鸡Bu1抗体 | SouthernBiotech | 8395-01 |
| 抗IgM CH1单克隆抗体 | SouthernBiotech | 8310-01 | |
| 抗IgL单克隆抗体 | SouthernBiotech | 8340-01 | |
| 抗TCR1 (TCRδγ)抗体 | SouthernBiotech | 8230-01 | |
| 抗TCR2 (TCRαβ/Vβ1)抗体 | SouthernBiotech | 8240-01 | |
| 抗TCR3 (TCRαβ/Vβ2)抗体 | SouthernBiotech | 8250-01 | |
| 多克隆山羊抗IgM抗体 | Bethyl Laboratories | A30-102A | |
| Alexa Fluor 647标记驴抗小鼠抗体 | Thermo Fisher | A31571 | |
| Alexa Fluor 647标记驴抗山羊抗体 | Abcam | AB150131 | |
| Western blot | NuPage SDS-PAGE凝胶 | Thermo Fisher | NP0321 |
| iBlot2干转系统 | Thermo Fisher | -- | |
| 辣根过氧化物酶标记抗IgY抗体 | Sigma-Aldrich | A90406 | |
| 辣根过氧化物酶标记抗IgM抗体 | Bethyl Laboratories | A30-102P | |
| West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Fisher | 34580 | |
| Bio-Rad ChemiDoc XRS+凝胶成像仪 | Bio-Rad | -- | |
| ELISA | 高结合力ELISA板 | Greiner Bio-One | 655061 |
| 辣根过氧化物酶标记山羊抗鸡IgM抗体 | Bethyl | A30-120P | |
| TMB底物 | Thermo Fisher | 002023 | |
| BioTek Synergy H1酶标仪 | BioTek | -- | |
| RT-PCR | Qiagen RNeasy Plus试剂盒 | Qiagen | 74034 |
| Qiagen一步法RT-PCR试剂盒 | Qiagen | 210212 | |
| 免疫 | 弗氏完全佐剂 | Thermo Fisher | 77140 |
| 弗氏不完全佐剂 | Thermo Fisher | 77145 | |
| 重组人PGRN蛋白 | Sino Biological | 10826-H08H | |
| 重组SARS-CoV-2 S1蛋白 | Acro Biosystems | S1N-C5256 | |
| 重组SARS-CoV-2刺突三聚体(Alpha) | Acro Biosystems | SPN-C52H6 | |
| 重组SARS-CoV-2刺突三聚体(Beta) | Acro Biosystems | SPN-C52Hk | |
| 重组SARS-CoV-2刺突三聚体(Delta) | Acro Biosystems | SPN-C52He | |
| 生物素化Delta三聚体 | Acro Biosystems | SPN-C82Ec | |
| 生物素化RBD | Acro Biosystems | SPD-C82E4 | |
| 单B细胞筛选 | 醛乳胶珠 | Thermo Fisher | A37306 |
| Alexa Fluor 594标记抗鸡IgY抗体 | Thermo Fisher | A11042 | |
| FITC标记抗IgM抗体 | Bethyl Laboratories | A30-102F | |
| 克隆 | InFusion克隆试剂盒 | Takeda Bio | 638911 |
| 蛋白表达 | Expi293表达系统 | Thermo Fisher | A14525 |
| SEC | Superdex 200 Increase 10/300 GL | -- | -- |
| DSF/DLS | Unchained Labs Uncle仪器 | Unchained Labs | -- |
| SPR | Carterra LSA平台 | Carterra | -- |
| HC-200M传感器芯片 | Carterra | -- | |
| HC30M芯片 | Carterra | -- | |
| 兔抗人IgG Fc多克隆抗体 | Rockland | -- | |
| 中和实验 | ACE2-Fc蛋白 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 转基因鸡构建 | 原始生殖细胞系229-92,电穿孔参数(350 V, 100 μs, 8脉冲),G418筛选浓度300 μg/ml 阅读提示:Materials and Methods, Transgenic design and development |
| B细胞分析 | 11周龄,PBMC分离方法,流式抗体浓度,10,000细胞/样本 阅读提示:Materials and Methods, Flow cytometry |
| 免疫 | 免疫原和剂量(100 μg PGRN或刺突蛋白),佐剂类型,免疫间隔(2周),加强次数,静脉注射剂量100 μg 阅读提示:Materials and Methods, Immunization program |
| sdAb发现 | GEM法:5 μm醛乳胶珠,包被链霉亲和素和生物素化抗原,孵育3小时 阅读提示:Materials and Methods, mAb recovery |
| 亲和力测定 | SPR捕获法,3倍稀释系列,浓度范围76.2 pM-500 nM,注射5分钟,解离10分钟 阅读提示:Materials and Methods, SPR epitope binning and kinetics |