临床样本分析
分析黑色素瘤患者和对照组淋巴液来源EVs中CD36的表达差异。
收集黑色素瘤患者和对照的淋巴液,通过尺寸排阻色谱法分离LEVs,使用纳米流式细胞术检测CD36阳性EVs的百分比。
Melanoma-Derived Extracellular Vesicles Induce CD36-Mediated Pre-Metastatic Niche.
包含临床样本分析、体外细胞实验、功能验证(siRNA敲低)和空间MxIF分析,但缺乏动物模型或类器官等体内验证。
人黑色素瘤细胞系SKMEL28和C32TG 人单核细胞系THP1 人淋巴内皮细胞(HLEC) 黑色素瘤患者和对照的淋巴结组织及淋巴液
黑色素瘤患者LEVs中CD36阳性EVs的百分比显著高于对照组 SKMEL28和C32TG来源EVs处理后THP1和HLEC细胞中CD36表达上调约2-5倍 CD36 siRNA敲低SKMEL28细胞后,EVs处理THP1细胞中CD36阳性细胞比例从36%降至约22.5%,且M2巨噬细胞标记物CD163和CD206表达降低 空间分析中,SLN(+)中CD36表达高于SLN(−)和正常LN,但差异无统计学意义 SLN(−)中CD36与CD209和CD163的共定位高于对照组,但未达到统计学显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析黑色素瘤患者和对照组淋巴液来源EVs中CD36的表达差异。
收集黑色素瘤患者和对照的淋巴液,通过尺寸排阻色谱法分离LEVs,使用纳米流式细胞术检测CD36阳性EVs的百分比。
评估黑色素瘤来源EVs对单核细胞和内皮细胞CD36表达的影响。
从黑色素瘤细胞系SKMEL28和C32TG中收集EVs(缺氧条件下培养,使用去除外泌体的FBS),处理THP1和HLEC细胞24或48小时,通过流式细胞术、Western blot和实时PCR检测CD36表达。
验证黑色素瘤EVs是否通过CD36诱导M2巨噬细胞样特征。
PMA诱导THP1细胞分化为M0巨噬细胞,用黑色素瘤EVs处理48小时,使用流式细胞术检测CD36、HLA-DR、CD163和CD206表达。
确定EVs中CD36是否介导M2巨噬细胞极化。
使用CD36 siRNA转染SKMEL28细胞,收集EVs,处理THP1细胞,通过流式细胞术检测CD36表达和M2标志物。
评估黑色素瘤患者淋巴结中CD36的表达及与免疫细胞的共定位。
对正常LN、SLN(−)和SLN(+)组织进行多重免疫荧光染色,使用InCell分析仪成像,通过空间回归模型分析CD36表达和共定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | -- | -- |
| 去除外泌体的胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine转染试剂 | Invitrogen by Life Technologies | -- |
| 细胞外囊泡分离 | qEV1尺寸排阻柱(70 nm) | IZON | -- |
| XPN-90超速离心机 | Beckman Coulter | -- | |
| 细胞外囊泡标记 | CFSE染料 | -- | -- |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| Trans-blot转印系统 | Bio-Rad | -- | |
| CD36抗体(18836-1-AP) | Proteintech | 18836-1-AP | |
| β-actin抗体(20536-1-AP) | Proteintech | 20536-1-AP | |
| 重组人CD36蛋白 | Sino Biological | 10752-H08H | |
| 流式细胞术 | 抗CD36抗体(Cat#336202) | Bio Legend | 336202 |
| Alexa Fluor 647标记试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | A20186 | |
| A60-MicroPlus纳米流式细胞仪 | Apogee Flow Systems Inc. | -- | |
| Rosetta校准微球混合物 | Exometry Inc. | -- | |
| Apogee微球混合物#1493 | Apogee Flow Systems | 1493 | |
| BD LSRFortessa细胞分析仪 | BD | -- | |
| 成像流式 | ImageStream MKII成像流式细胞仪 | Amnis | -- |
| 实时PCR | Qiagen RNeasy Plus试剂盒 | Qiagen | -- |
| 逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 | |
| QuantStudio 3实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Taqman 2× Universal PCR预混液 | Applied Biosystems | 4444963 | |
| TaqMan基因表达探针 | Thermo Fisher Scientific | GAPDH: | |
| 空间MxIF | InCell成像仪 | GE HealthCare | -- |
| INCell Analyzer 2500HS | GE Healthcare | -- | |
| 细胞外囊泡培养 | Petaka G3低氧转移培养瓶 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 淋巴液样本来自黑色素瘤患者(n=5)和对照(n=5),对照为非恶性术后液;需确认伦理批件和知情同意,但未提供知情同意细节。 阅读提示:Materials and Methods 2.1 Clinical Specimens |
| 细胞培养与EVs收集 | 黑色素瘤细胞系SKMEL28和C32TG在缺氧条件下培养;使用去除外泌体的FBS;EVs收集通过超速离心(100,000×g,3小时,10°C);需确认缺氧条件的具体氧气浓度。 阅读提示:Materials and Methods 2.2, 2.3 |
| EVs处理细胞 | EVs与细胞比例约10^4 EVs/细胞;处理时间24或48小时;THP1细胞需PMA诱导为M0巨噬细胞。 阅读提示:Materials and Methods 2.4 |
| CD36敲低 | 使用20 μM CD36 siRNA(三条duplex)转染SKMEL28细胞,对照为NTC siRNA;转染试剂为Lipofectamine;需确认转染效率和敲低效率。 阅读提示:Materials and Methods 2.2, Results 3.3 |
| 巨噬细胞极化分析 | M0巨噬细胞用EVs处理48小时;阳性对照:M1(LPS+IFN-γ)、M2(IL4);检测标记:CD36、HLA-DR、CD163、CD206。 阅读提示:Materials and Methods 2.4, Results 3.3 |
| 空间MxIF | 组织样本:正常LN、SLN(−)、SLN(+)(每组2例);每个淋巴结选取15-25个FOV;分析36个FOV;标记物包括CD36等;空间回归模型用于分析;需确认具体染色协议和图像分析参数。 阅读提示:Materials and Methods 2.9, Results 3.4 |