临床样本分析
评估GBP2在ccRCC组织中的表达及其与M2巨噬细胞标志物的相关性。
对12对ccRCC肿瘤及癌旁组织进行RNA-seq、免疫组化、Western blot,验证GBP2和CD163表达及相关性,并使用TIMER2.0和GEPIA2.0数据库分析相关性及预后。
Crosstalk between GBP2 and M2 macrophage promotes the ccRCC progression.
包含体外细胞实验(迁移、侵袭、western blot)、共培养、临床样本分析与数据库挖掘,但缺乏体内实验验证。
786-O细胞 CAKI-1细胞 THP-1诱导的M2巨噬细胞 ccRCC患者组织样本
GBP2在ccRCC组织中的表达上调 GBP2与M2巨噬细胞标志物正相关 GBP2敲低抑制迁移侵袭,过表达促进 M2 CM通过IL-10/TGF-β上调GBP2/p-STAT3/p-ERK GBP2通过IL-18促进M2极化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估GBP2在ccRCC组织中的表达及其与M2巨噬细胞标志物的相关性。
对12对ccRCC肿瘤及癌旁组织进行RNA-seq、免疫组化、Western blot,验证GBP2和CD163表达及相关性,并使用TIMER2.0和GEPIA2.0数据库分析相关性及预后。
验证GBP2对ccRCC细胞迁移和侵袭能力的影响。
在786-O和CAKI-1细胞中敲低或过表达GBP2,进行划痕愈合和Transwell迁移/侵袭实验。
确定GBP2影响细胞迁移侵袭的信号通路。
通过Western blot检测GBP2敲低/过表达后STAT3、ERK、p38磷酸化水平变化。
评估M2巨噬细胞对GBP2表达及肿瘤细胞行为的影响。
用M2巨噬细胞的条件培养基(CM)处理肿瘤细胞,观察迁移侵袭变化;共培养体系中加入IL-10/TGF-β中和抗体,检测GBP2/p-STAT3/p-ERK变化。
验证GBP2通过IL-18影响巨噬细胞M2极化。
将肿瘤细胞与M0巨噬细胞共培养,检测巨噬细胞M1/M2标志物;ELISA检测IL-18分泌;加入重组IL-18或IL-18中和抗体观察极化变化;siSTAT3和siERK抑制通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| McCoy's 5A培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Invigentech | A6901FBS-500 | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 巨噬细胞极化 | 佛波酯 | Macklin | P849986 |
| 白细胞介素-4 | Proteintech | HZ-1004 | |
| 白细胞介素-13 | Sino Biological | 10369-HNAC | |
| 中和抗体处理 | IL-10中和抗体 | R&D | MAB217-SP |
| TGF-β中和抗体 | R&D | MAB1835-SP | |
| IL-18中和抗体 | Selleck | A2448 | |
| 同型IgG | Abmart | B30013 | |
| 免疫组化 | GBP2抗体 | Proteintech Group | 27299-1-AP |
| CD163抗体 | Proteintech Group | 66868-1-lg | |
| MaxVision HRP聚合物抗鼠/兔免疫组化试剂盒 | Fuzhou Maixin Biotech | 5010 | |
| DAB显色液 | Proteintech Group | PR30010 | |
| 显微镜观察 | VS200显微镜 | Olympus | -- |
| qPCR | TRIzol试剂 | Vazyme | R401-01a |
| Hifair®V一步法RT-gDNA消化qPCR超级混合液 | Yeasen | 11141ES60 | |
| StepOne实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 硝酸纤维素膜 | Pall Life Sciences | 66485 | |
| STAT3抗体 | ZEN-BioScience | R22785 | |
| p-STAT3抗体 | ZEN-BioScience | R381152 | |
| p38抗体 | ZEN-BioScience | R25239 | |
| p-p38抗体 | ZEN-BioScience | 310091 | |
| ERK抗体 | ZEN-BioScience | R24246 | |
| p-ERK抗体 | ZEN-BioScience | R380698 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 山羊抗小鼠IgG (H+L)-HRP | Biosharp | BL001A | |
| 山羊抗大鼠IgG (H+L)-HRP | Biosharp | BL003A | |
| 增强型化学发光试剂 | ZEN-BioScience | 17046 | |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | 17001402 | |
| 迁移/侵袭实验 | Transwell小室 | LABSELECT | -- |
| Matrigel基质胶 | ABW | 082724 | |
| ELISA | IL-18 ELISA试剂盒 | Wuhan Colorful Gene Biological Technology | JYM0139Hu |
| siRNA转染 | siSTAT3 | RiboBio | -- |
| siERK | RiboBio | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 786-O和CAKI-1细胞的培养基,THP-1细胞的培养基,FBS浓度和青霉素/链霉素浓度,培养条件(37°C,5% CO2)。 阅读提示:Materials and Methods 2.1 |
| 巨噬细胞极化 | PMA浓度100 ng/mL处理48小时,IL-4和IL-13浓度各20 ng/mL处理48小时。 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |
| 中和抗体处理 | IL-10中和抗体浓度2 μg/mL,TGF-β中和抗体浓度1.25 μg/mL,IL-18中和抗体浓度2 μg/mL。 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |
| 迁移/侵袭实验 | transwell小室规格(8 μm),细胞数量3×10^4,迁移孵育12小时,侵袭孵育24小时,下室含10% FBS的培养基。 阅读提示:Materials and Methods 2.8 |
| 共培养实验 | 共培养时间48小时,肿瘤细胞与M0巨噬细胞共培养,重组IL-18浓度60 ng/mL。 阅读提示:Materials and Methods 2.3, 2.10; Results 3.4 |
| 临床样本分析 | RNA-seq三生物学重复,IHC评分方法,Western blot样本对数量。 阅读提示:Materials and Methods 2.2, 2.4; Results 3.1 |