确认CD30L两种同种型在细胞中的表达
验证健康供体PBMC中是否表达两种CD30L同种型,以及不同刺激条件下的表达差异。
从六名健康供体分离PBMC,分别用免疫复合物、PMA/离子霉素、抗CD3/CD28磁珠和LPS刺激6小时和24小时,通过qPCR检测两种同种型的mRNA表达。
The Opposite Functions of CD30 Ligand Isoforms.
包含体外细胞模型(HEK转染、共培养)、分子结合实验(plate-based binding assay、免疫共沉淀/免疫印迹)、报告基因实验(NFkB-Luc)及原代细胞(PBMC)表达验证等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
HEK(Flp-In™ 293 T-REx)细胞 K299细胞系(NFkB-Luc报告基因克隆) 健康供体外周血单个核细胞(PBMCs)
CD30L两种同种型(Iso1和Iso2)在PBMC中mRNA表达水平及刺激条件 Iso1与Iso2是否能与CD30形成复合物 Iso1和Iso2共表达对K299 NFkB-Luc报告基因激活的抑制程度(约20%) Iso2是否阻断Iso1与CD30的结合(pull-down实验验证) 细胞因子(IL-6等)产生的变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证健康供体PBMC中是否表达两种CD30L同种型,以及不同刺激条件下的表达差异。
从六名健康供体分离PBMC,分别用免疫复合物、PMA/离子霉素、抗CD3/CD28磁珠和LPS刺激6小时和24小时,通过qPCR检测两种同种型的mRNA表达。
在HEK细胞中表达Iso1和Iso2,用于后续功能实验。
将Iso1和Iso2(带或不带FLAG标签)的ORF克隆至pcDNA5/FRT/TO载体,转染HEK细胞,用多西环素诱导表达48小时。通过流式细胞术验证细胞表面表达。
比较Iso1和Iso2与CD30的结合能力。
将HEK细胞裂解液或上清加入包被有重组CD30蛋白的板子中,用抗FLAG抗体检测结合情况。
确定Iso1和Iso2是否能形成复合物。
使用Iso1特异性抗体捕获,抗FLAG检测,进行plate-based binding assay。
评估Iso1和Iso2是否诱导CD30+细胞中的炎性信号。
将表达CD30L同种型的HEK细胞与K299细胞(或K299 NFkB-Luc报告细胞)共培养,检测NFkB报告基因活性和细胞因子产生。
测试Iso2是否阻断Iso1介导的信号传导。
在HEK细胞中共同转染Iso1和Iso2(或Iso2-FLAG),共培养K299 NFkB-Luc,检测报告活性和IL-6产生。
确定Iso2是否通过阻断Iso1与CD30的结合来抑制信号。
使用plate-based binding assay和pull-down实验,在存在或不存在Iso2的情况下检测Iso1与CD30的结合量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| PBMC分离 | 淋巴细胞分离液 | Corning | 25-072-CV |
| PBMC培养 | 含Glutamax的RPMI培养基 | ThermoFisher | 72-400-120 |
| 胎牛血清 | Omega Scientific | FB-02 | |
| 青霉素-链霉素溶液 | -- | -- | |
| PBMC刺激 | 人IgG | Jackson ImmunoResearch Labs | 009-000-002 |
| 小鼠抗人IgG | Jackson ImmunoResearch Labs | 209-005-098 | |
| 包被抗CD3和抗CD28抗体的Dynabeads磁珠 | ThermoFisher | 11131D | |
| 佛波醇-12-豆蔻酸酯-13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | P1585 | |
| 离子霉素 | Sigma-Aldrich | I3909 | |
| 脂多糖 | Millipore | LPS25 | |
| RNA提取 | QIAshredder柱 | Qiagen | 79656 |
| RNeasy试剂盒 | Qiagen | 74104 | |
| cDNA合成 | ProtoScript® II试剂盒 | New England BioLabs | M0368X |
| qPCR | SsoAdvanced™ Universal SYBR® Green Supermix | Bio-Rad | 1725271 |
| CFX Opus实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞培养 | Flp-In™ 293 T-REx细胞 | ThermoFisher | R78007 |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 含Glutamax的RPMI培养基 | ThermoFisher | 61870036 | |
| 细胞转导 | Cignal Lenti NFkB报告基因(慢病毒) | Qiagen | CLS-013L-1 |
| 溴化己二甲铵(聚凝胺) | Sigma-Aldrich | H9268-5G | |
| 细胞分选 | BD FACSAria™ III分选仪 | BD Biosciences | -- |
| 重组蛋白 | CD30L-Fc重组蛋白 | Sino Biological | 10040-H01H |
| 流式细胞术 | 活/死细胞染色试剂 | ThermoFisher | L34964 |
| eBioscience™流式染色缓冲液 | ThermoFisher | 00-4222-26 | |
| Human TruStain FcX™ Fc受体阻断液 | BioLegend | 422302 | |
| 抗人CD30配体抗体 | R&D Systems | FAB1028G | |
| 抗FLAG M2-FITC抗体 | Sigma-Aldrich | F4049 | |
| 抗人CD30抗体 | BD Biosciences | 550041 | |
| 抗人CD14抗体 | BD Biosciences | B555397 | |
| 抗人CD19抗体 | BD Biosciences | 555413 | |
| 抗人CD3抗体 | BD Biosciences | 555342 | |
| AbC全抗体补偿微球试剂盒 | ThermoFisher | A10497 | |
| ArC胺反应性补偿微球试剂盒 | ThermoFisher | A10346 | |
| Attune NxT流式细胞仪和自动进样器 | ThermoFisher | -- | |
| 载体构建 | CD30L同种型开放阅读框 | Origene | RC211276, RC231923 |
| pcDNA5/FRT/TO载体 | ThermoFisher | V652020 | |
| 转染 | 聚乙烯亚胺 | -- | -- |
| 诱导表达 | 多西环素 | -- | -- |
| 结合实验 | MSD 96孔板 | Meso Scale Diagnostics | L15XA-3 |
| 可溶性重组CD30蛋白 | R&D Systems | 813-CD-100 | |
| 重组CD30-Fc蛋白 | R&D Systems | 6126-CD-100 | |
| Iso1特异性抗CD30L抗体 | R&D Systems | MAB1028 | |
| pan抗CD30L抗体 | LSBio | C293348 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma-Aldrich | F3165 | |
| Stabilcoat封闭液 | Sigma-Aldrich | S0950-1L | |
| 裂解缓冲液 | 蛋白酶抑制剂 | ThermoFisher | 78442 |
| 结合实验 | 兔抗FLAG抗体 | Cell Signaling Technology | 14793S |
| 山羊抗兔SULFO标记二抗 | Meso Scale Diagnostics | R32AB | |
| 山羊抗小鼠SULFO标记二抗 | Meso Scale Diagnostics | R32AC | |
| MSD读板缓冲液 | Meso Scale Diagnostics | R92TC | |
| MESO QuickPlex SQ 120MM仪器 | Meso Scale Diagnostics | -- | |
| 细胞因子检测 | MSD V-PLEX炎症因子Panel 1人试剂盒 | Meso Scale Diagnostics | K15049D |
| 共培养 | Corning® BioCoat™多聚-D-赖氨酸96孔微孔板 | Corning | 354461 |
| 报告基因检测 | 荧光素酶检测系统 | Promega | E1501 |
| 裂解缓冲液 | Promega | E3971 | |
| BioTek Cytation 5酶标仪 | BioTek | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G磁珠 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2003 |
| 重组CD30-Fc蛋白 | R&D Systems | 813-CD-100 | |
| pan抗CD30L抗体 | R&D Systems | BAF1028 | |
| 抗CD30抗体 | Abcam | ab23766 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma-Aldrich | F3165 | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32233 | |
| 抗小鼠IgG HRP偶联二抗 | Cell Signaling Technology | 7076S | |
| 抗生物素HRP偶联二抗 | Cell Signaling Technology | 7075S | |
| SuperSignal™ West Pico PLUS化学发光底物 | ThermoFisher | 34577 | |
| SuperSignal™ West Atto超敏化学发光底物 | ThermoFisher | A38554 | |
| AlphaImager凝胶成像系统 | Alpha Innotech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PBMC分离和刺激 | 健康供体数量(n=6)、刺激条件(IC、P/I、CD3/CD28、LPS)及浓度、刺激时间(6h/24h) 阅读提示:见Methods 2.3节,图2图注 |
| CD30L同种型表达和结合实验 | 细胞系、转染质粒量、FLAG标签、CD30包被浓度、检测抗体种类 阅读提示:见Methods 2.7、2.8节,图3图注 |
| 共培养刺激和报告基因实验 | HEK细胞种子数量、转染时间、共培养比例、K299 NFkB-Luc克隆、刺激时间、检测方法 阅读提示:见Methods 2.9节,图4、5图注 |
| 免疫共沉淀和Western blot | 转染质粒量、CD30-Fc用量、蛋白A/G珠用量、抗体浓度 阅读提示:见Methods 2.10节,图6图注 |