网络药理学分析
预测HGWD活性成分、作用靶点及信号通路
通过TCMSP数据库和文献挖掘收集HGWD中5种药材的活性成分(OB>30%,DL>0.18),利用SwissTargetPrediction预测靶点,与GeneCards和OMIM获取的IS相关靶点取交集,构建PPI网络、GO和KEGG富集分析,并构建网络图
The mechanisms of Huangqi Guizhi Wuwu decoction in treating ischaemic stroke based on network pharmacology and experiment verification.
包含网络药理学预测、分子对接、MCAO大鼠模型体内实验、组织病理学、ELISA、Western blot等多层级验证,并明确机制通路。
MCAO大鼠模型 SD大鼠
HGWD给药剂量:低剂量5 g/kg、高剂量20 g/kg,灌胃,每日一次,连续7天 MCAO模型建立:线栓法阻塞右侧大脑中动脉1.5小时后恢复血流 对照药物:尼莫地平20 mg/kg灌胃 神经功能评分采用Longa标准,24小时后评分,排除0分和4分大鼠 Western blot检测PI3K/AKT和HIF-1通路蛋白表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
预测HGWD活性成分、作用靶点及信号通路
通过TCMSP数据库和文献挖掘收集HGWD中5种药材的活性成分(OB>30%,DL>0.18),利用SwissTargetPrediction预测靶点,与GeneCards和OMIM获取的IS相关靶点取交集,构建PPI网络、GO和KEGG富集分析,并构建网络图
验证关键活性成分与核心靶点的结合亲和力
选取排名前10的活性成分与12个关键靶点进行分子对接,使用AutoDock Vina计算结合能,并绘制热图展示结果
制备HGWD并确保其质量一致性
按1:1:1:2:1比例混合五种药材,水提两次,浓缩至2.5 g/mL,采用HPLC检测特征成分含量
建立缺血性中风大鼠模型并进行药物干预
采用线栓法建立MCAO模型,大鼠分为假手术、模型、低剂量、高剂量和尼莫地平组,连续灌胃给药7天
评估HGWD对神经功能缺损和脑梗死的影响
神经功能评分采用Longa标准评分,TTC染色检测脑梗死体积,HE和尼氏染色观察神经病理变化
检测HGWD对氧化应激和炎症反应的影响
使用生化试剂盒检测脑组织中LDH、MDA、SOD水平,ELISA检测血清TNF-α、IL-6、IL-1β水平
验证HGWD对细胞凋亡及相关信号通路的影响
TUNEL染色检测凋亡神经元,Western blot检测PI3K/AKT和HIF-1通路蛋白表达
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药材来源 | 黄芪 | 广州至信药业股份有限公司 | -- |
| 桂枝 | 广州至信药业股份有限公司 | -- | |
| 白芍 | 广州至信药业股份有限公司 | -- | |
| 生姜 | 广州至信药业股份有限公司 | -- | |
| 大枣 | 广州至信药业股份有限公司 | -- | |
| 动物实验 | SD大鼠 | 北京华阜康生物科技股份有限公司 | -- |
| 药物处理 | 尼莫地平 | -- | -- |
| Western blot | AKT1一抗 | Affinity | AF0836 |
| 磷酸化AKT1一抗 | Affinity | AF0016 | |
| MAPK1一抗 | Affinity | BF0412 | |
| 磷酸化MAPK1一抗 | Affinity | AF1015 | |
| c-Jun一抗 | Affinity | AF6090 | |
| 磷酸化c-Jun一抗 | Affinity | AF3095 | |
| 磷酸化PI3K一抗 | Affinity | AF3242 | |
| PI3K一抗 | Affinity | AF6242 | |
| Bcl-2一抗 | Affinity | AF6139 | |
| Bax一抗 | Affinity | AF0120 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Affinity | T0022 | |
| β-微管蛋白抗体 | Affinity | T0023 | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Affinity | S0001 | |
| VEGFA抗体 | Proteintech | 66828-1-Ig | |
| HIF-1A抗体 | Proteintech | 66730-1-Ig | |
| caspase-3抗体 | Cell Signalling Technologies | 9662s | |
| 二抗 | Sino Biological, Inc. | -- | |
| 生化指标检测 | LDH检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A020-2-2 |
| MDA检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A003-1-2 | |
| SOD检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A001-3-2 | |
| ELISA | TNF-α ELISA试剂盒 | 江苏酶免实业有限公司 | MM-0180R1 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | 江苏酶免实业有限公司 | MM-0190R1 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | 江苏酶免实业有限公司 | MM-0047R1 | |
| TUNEL染色 | TUNEL试剂盒 | 凯基生物 | -- |
| HPLC | 沃特世C18色谱柱 | Waters | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 成像系统 | Tanon 5200成像系统 | 天能科学技术有限公司 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| HGWD制备 | 药材来源、比例、提取方法(10倍水浸泡0.5小时,煎煮2次各1小时,浓缩至2.5 g/mL) 阅读提示:Chemicals and reagents部分 |
| MCAO模型建立 | 线栓直径、插入深度、阻塞时间(1.5小时)、麻醉方式(2%戊巴比妥钠40 mg/kg腹腔注射) 阅读提示:Animal experiment部分 |
| 分组与给药 | 动物随机分组、给药剂量(HGWD低/高剂量5/20 g/kg、尼莫地平20 mg/kg)、给药频次(每日一次,连续7天)、给药方式(灌胃) 阅读提示:Establishment of MCAO model and experimental design部分 |
| 神经功能评分 | 评分时间(术后24小时)、评分标准(Longa分级)、排除标准(评分0或4分排除) 阅读提示:Neurological deficit evaluation部分 |
| 脑梗死体积检测 | TTC染色浓度(1%)、时间(20分钟)、温度(37℃避光)、切片厚度(2mm) 阅读提示:TTC staining部分 |
| Western blot | 抗体稀释比(一抗1:1000,二抗1:2000)、封闭条件(5%脱脂牛奶1小时)、孵育条件(一抗4℃过夜,二抗4℃1小时) 阅读提示:Western blotting部分 |