鉴定FBXW2与Moesin的相互作用
确定Moesin是否为FBXW2的直接靶标。
通过免疫沉淀从MCF7细胞中获取FBXW2相互作用蛋白,经SDS-PAGE和质谱分析鉴定候选蛋白;通过外源性和内源性免疫共沉淀及体外重组蛋白pull-down验证FBXW2与Moesin的直接相互作用。
FBXW2 suppresses breast tumorigenesis by targeting AKT-Moesin-SKP2 axis.
包含体外细胞实验、动物模型、患者样本及组学分析等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
MCF7细胞系 MDA-MB-231细胞系 4T1小鼠乳腺癌细胞系 NOD-SCID小鼠原位移植瘤模型
MCF7和MDA-MB-231细胞中FBXW2与Moesin的相互作用 FBXW2和Moesin在乳腺癌细胞系及患者样本中的表达相关性 FBXW2介导的Moesin K48-连接多泛素化及蛋白酶体降解 AKT对Moesin T558位点的磷酸化及其对FBXW2-Moesin相互作用的影响 4T1细胞原位注射至NOD-SCID小鼠乳腺脂肪垫的肿瘤生长
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Moesin是否为FBXW2的直接靶标。
通过免疫沉淀从MCF7细胞中获取FBXW2相互作用蛋白,经SDS-PAGE和质谱分析鉴定候选蛋白;通过外源性和内源性免疫共沉淀及体外重组蛋白pull-down验证FBXW2与Moesin的直接相互作用。
评估FBXW2与Moesin在乳腺癌中的表达水平及其与患者预后的关系。
通过免疫印迹检测正常乳腺上皮细胞系和多种乳腺癌细胞系中FBXW2和Moesin的表达;通过免疫组化检测乳腺癌患者组织样本中的表达;使用TCGA数据集和GSE3494数据集进行Kaplan-Meier生存分析。
确定FBXW2是否通过调控Moesin影响乳腺癌细胞的增殖、迁移、侵袭和体内肿瘤生长。
通过慢病毒shRNA稳定敲低FBXW2和/或Moesin,进行台盼蓝计数、集落形成、软琼脂、划痕迁移和侵袭实验;将4T1细胞原位注射至NOD-SCID小鼠乳腺脂肪垫,监测肿瘤生长。
确定FBXW2是否通过蛋白酶体途径和泛素化修饰调控Moesin的水平。
通过过表达FLAG-FBXW2检测Moesin蛋白和mRNA水平;使用MG132和放线菌酮处理;进行体内外泛素化实验检测Moesin的K48-连接多泛素化;通过F-box结构域缺失突变体验证SCF复合物的形成。
验证Moesin是否通过抑制FBXW2介导的降解来稳定SKP2,以及SKP2是否通过K63-连接泛素化稳定Moesin。
通过过表达或敲低Moesin检测SKP2蛋白和mRNA水平;通过免疫共沉淀检测Moesin与SKP2的相互作用;进行体内外泛素化实验检测SKP2的K48-连接泛素化及Moesin的K63-连接泛素化;通过敲低SKP2回补FBXW2敲低细胞的表型。
确定AKT是否通过磷酸化Moesin T558来阻断FBXW2介导的降解。
使用AKT抑制剂处理或敲低AKT,检测Moesin蛋白水平和K48-连接泛素化;通过免疫共沉淀检测AKT抑制后FBXW2与Moesin的相互作用;构建Moesin T558D磷酸化模拟突变体,检测其与FBXW2的相互作用和泛素化水平;通过IHC评估乳腺癌患者样本中FBXW2、pAKT、Moesin和SKP2的表达相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 12800017 |
| RPMI培养基 | Gibco | 31800022 | |
| 胎牛血清 | Himedia | RM9955 | |
| 青霉素-链霉素 | Life Technologies, Inc. | 15140-122 | |
| 马血清 | Gibco | 16050-122 | |
| 药物处理 | MG132 | Calbiochem | 474790 |
| AKT抑制剂 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 聚凝胺 | Sigma | TR-1003 |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 转染 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences | 23966-1 |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA琼脂糖珠 | Sigma | 5893801001 |
| 谷胱甘肽 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | PVDF膜 | -- | -- |
| 化学发光底物试剂盒 | Pierce | West Pico-34578和West Femto-34096 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白G琼脂糖珠 | Pierce | 15920-010 |
| 质谱分析 | Orbitrap Fusion质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
| Easy-spray PEPMAP RSLC C18色谱柱 | Thermo Scientific | -- | |
| Gel Code Blue染色液 | Pierce | 24590 | |
| Millipore Zip Tip C18 | Millipore | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 10296028 |
| PrimeScript 第一链cDNA合成试剂盒 | Takara | 6210A | |
| SYBR荧光定量试剂 | Takara | RR820 | |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | -- | -- |
| 侵袭实验 | 甲醇 | -- | -- |
| 免疫组化 | Mayer苏木素 | -- | Merck |
| DPX封片剂 | -- | Merck | |
| 柠檬酸盐缓冲液 | -- | -- | |
| 蛋白表达 | 异丙基硫代半乳糖苷 | -- | -- |
| 溶菌酶 | -- | -- | |
| 抗体 | 抗FBXW2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-160326 |
| 抗FBXW2抗体 | Protein Tech | 11499-1-AP | |
| 抗Moesin抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-34666 | |
| 抗SKP2 p45抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7164 | |
| 抗pAKT (S473)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-293125 | |
| 抗pAKT (T308)抗体 | Cell Signaling Technology | 9275 | |
| 抗pAKT (S473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4058 | |
| 抗泛素K48抗体 | Cell Signaling Technology | 8081 | |
| 抗Cullin1抗体 | Cell Signaling Technology | 4995 | |
| HRP标记抗小鼠二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma | F1804 | |
| 抗Tubulin抗体 | Sigma | T5168 | |
| 抗β-Actin抗体 | Sigma | A2228 | |
| 抗Myc抗体 | Roche | 11667149001 | |
| 抗GST抗体 | Bio Bharati | BB-AB0020 | |
| HRP标记抗兔二抗 | Bio-Rad | 1706515 | |
| 抗pAKT (T308)抗体 | Cell Signaling Technology | 13038 | |
| 仪器 | AMERSHAM ImageQuant 800成像系统 | GE Healthcare | -- |
| 显微镜 | 倒置相差显微镜 | Olympus IX71 | -- |
| Nikon ECLIPSE Ti2显微镜 | Nikon | -- | |
| Leica DM750光学显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源、培养基成分、FBS浓度、培养条件(如温度、CO2水平) 阅读提示:Materials and methods: Cell lines |
| 基因敲低 | shRNA序列、病毒包装、感染条件(如polybrene浓度)、筛选药物(嘌呤霉素浓度) 阅读提示:Materials and methods: Generation of stable knockdown cells |
| 药物处理 | MG132浓度、处理时间;AKT抑制剂浓度、处理时间;放线菌酮浓度、处理时间 阅读提示:Materials and methods: Transfection、Cycloheximide pulse-chase assay;图3、图6图注 |
| 蛋白相互作用分析 | IP抗体、蛋白上样量、孵育时间、洗涤条件 阅读提示:Materials and methods: Immunoprecipitation (IP) |
| 泛素化分析 | 泛素突变体类型(K48/K63)、MG132处理、变性条件、pull-down方法 阅读提示:Materials and methods: In vivo polyubiquitination assay |
| 体外蛋白实验 | 重组蛋白系统、诱导条件(IPTG浓度)、纯化方法、缓冲液成分 阅读提示:Materials and methods: Protein purification、In vitro pull-down assay、In vitro polyubiquitination assay |
| 细胞功能实验 | 细胞接种密度、培养时间、染色方法、计数方法 阅读提示:Materials and methods: Trypan blue exclusion cell counting assay、Colony formation assay、Soft agar colony formation assay、Wound healing migration assay、Invasion assay |
| 动物实验 | 小鼠品系、年龄、性别、注射细胞数量、注射部位、肿瘤测量方法、每组动物数 阅读提示:Materials and methods: Orthotropic mice model |
| 免疫组化分析 | 组织固定、切片厚度、抗原修复方法、一抗稀释度、二抗孵育时间、显色方法 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry (IHC) |
| 数据分析 | 统计方法、显著性水平、数据展示形式(均值±标准差) 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |