细胞刺激与S100A15表达检测
验证LPS、LTA及热灭活细菌能否诱导GF和KB细胞表达S100A15。
用LPS(100 ng/mL)、LTA(50 ng/mL)或热灭活P. gingivalis和S. sanguinis(2×10^4 cells/mL)刺激GF和KB细胞,不同时间点收样,提取RNA,进行RT-PCR和qRT-PCR检测S100A15 mRNA,并用ELISA检测蛋白。
Induction of Antimicrobial Protein S100A15 Expression by Oral Microbial Pathogens Is Toll-like Receptors-Dependent Activation of c-Jun-N-Terminal Kinase (JNK), p38, and NF-κB Pathways.
包含细胞系刺激实验、TLR中和抗体实验、激酶通路抑制剂实验、临床牙龈组织免疫组化和唾液PCR检测,多层次功能与机制验证。
人牙龈成纤维细胞(GF) 人口腔表皮样癌细胞(KB) 炎症牙龈患者组织样本
细胞系:GF和KB细胞系 刺激物及浓度:LPS(100 ng/mL)、LTA(50 ng/mL)、热灭活P. gingivalis和S. sanguinis(2×10^4 cells/mL) 刺激时间:48小时 抑制剂处理:SP600125、SB-203580、Bay11-7082、硫氧还蛋白预处理1小时 TLR中和抗体:抗TLR2、抗TLR4抗体预处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证LPS、LTA及热灭活细菌能否诱导GF和KB细胞表达S100A15。
用LPS(100 ng/mL)、LTA(50 ng/mL)或热灭活P. gingivalis和S. sanguinis(2×10^4 cells/mL)刺激GF和KB细胞,不同时间点收样,提取RNA,进行RT-PCR和qRT-PCR检测S100A15 mRNA,并用ELISA检测蛋白。
确定S100A15诱导是否依赖TLR4或TLR2。
GF和KB细胞先用抗TLR2、抗TLR4或对照IgG预处理,再刺激以热灭活菌或LPS/LTA,48小时后提取RNA,qRT-PCR检测S100A15表达。
验证细菌刺激是否激活TRAF6、ASK1、JNK、p38、NF-κB及其下游转录因子。
GF和KB细胞经细菌刺激48小时后,制备总蛋白和核提取物,用Western blot检测TRAF6表达和ASK1、JNK、p38磷酸化,用EMSA检测转录因子AP-1、ATF-2、NF-κB的DNA结合活性,用激酶实验检测IKK活性及IκBα降解。
验证ASK1-JNK、ASK1-p38和NF-κB通路在S100A15诱导中的必要性。
GF和KB细胞分别用ASK1抑制剂(硫氧还蛋白)、JNK抑制剂SP600125、p38抑制剂SB-203580、NF-κB抑制剂Bay11-7082单独或联合预处理,再刺激细菌,检测S100A15表达及信号通路变化。
验证S100A15在炎症牙龈中的表达及病原菌的存在。
收集健康个体和炎症牙龈患者的牙龈组织活检,进行免疫组化检测S100A15;收集患者唾液,用PCR检测P. gingivalis和S. sanguinis的特异性基因片段。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细菌培养 | LB培养基 | -- | -- |
| 刺激处理 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| RT-PCR | High-Capacity RNA-to-cDNA™ 试剂盒 | Applied Biosystems™ | 4387406 |
| qRT-PCR | SYBR Green 预混液 | Applied Bioscience | 4385616 |
| Western blot | 抗ASK1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-7931 |
| 抗JNK抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-474 | |
| 抗p38抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-535 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-1615 | |
| 抗TRAF6抗体 | Abcam | ab33915 | |
| 抗S100A15抗体 | Sino Biological | 50226-RP01 | |
| ELISA | S100A15 ELISA试剂盒 | BioMatik corporation | EKN48277 |
| EMSA | T4多核苷酸激酶 | Genecraft | -- |
| [γ-32P] dATP | Hartmann Analytika | -- | |
| 激酶实验 | GST-IκBα(1-317)蛋白 | Santa Cruz | SC-4094 |
| 抗IKKα(C-6)抗体 | Santa Cruz | SC-166231 | |
| 免疫组化 | S100A15抗体 | -- | -- |
| 酶修复仪 | Biogenex | -- | |
| 正常猪血清 | Dako A/S | lot | |
| Leica DMRB光学显微镜 | Leica | -- | |
| PCR | Taq DNA聚合酶 | Genecraft | -- |
| 1-kb DNA分子量标准 | Genecraft | -- | |
| 热循环仪 | BioRad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞刺激 | 细胞系:GF和KB细胞;刺激物及浓度:LPS 100 ng/mL、LTA 50 ng/mL、热灭活P. gingivalis和S. sanguinis 2×10^4 cells/mL;刺激时间:48小时 阅读提示:见图1和图2及4.1节 |
| TLR中和实验 | 抗TLR2、抗TLR4抗体浓度及预处理时间(1小时);细胞刺激时间(48小时) 阅读提示:见图2及补充材料图S2 |
| 信号通路检测 | 细胞刺激时间(48小时);抗体稀释度;核提取物用量 阅读提示:见图3、图4、图5及4.3、4.4、4.6、4.7节 |
| 抑制剂实验 | 抑制剂种类及浓度(SP600125、SB-203580、Bay11-7082、硫氧还蛋白);预处理时间(1小时);刺激时间(48小时) 阅读提示:见图6及补充材料图S3、S4 |
| 临床样本 | 样本量(健康n=3、炎症牙龈n=3);组织处理;免疫组化抗体浓度;PCR引物及条件 阅读提示:见图7及4.8、4.9、4.10节 |