在人类脑干核团中检测到SARS-CoV-2病毒蛋白和基因组序列

Detection of SARS-CoV-2 viral proteins and genomic sequences in human brainstem nuclei.

作者信息Aron Emmi, Stefania Rizzo, Luisa Barzon, Michele Sandre, Elisa Carturan, Alessandro Sinigaglia, Silvia Riccetti, Mila Della Barbera, Rafael Boscolo-Berto, Patrizia Cocco, Veronica Macchi, Angelo Antonini, Monica De Gaspari, Cristina Basso, Raffaele De Caro, Andrea Porzionato
PMID36781876
发布时间2023-02-13
DOI10.1038/s41531-023-00467-3

实验完整度

中

包含患者样本的病理学分析、免疫组化、免疫荧光、RT-PCR及小胶质细胞定量,但缺乏功能验证和机制验证。

主要模型

人类脑干组织样本(延髓、中脑) COVID-19患者尸检队列 肺炎/呼吸衰竭对照尸检队列

重点核对

检测SARS-CoV-2 S和N蛋白的抗体(Sino Biologicals) 用于RNA检测的RT-PCR方法 用于小胶质细胞定量的TMEM119染色 神经病理学评估的半定量量表 免疫组化/免疫荧光的抗原修复条件

摘要

神经系统表现是COVID-19(由SARS-CoV-2引起的疾病)中的常见表现。尽管有报道在COVID-19患者的脑和脑脊液中检测到SARS-CoV-2,但病毒是否能感染中枢神经系统,以及哪些神经病理学改变可归因于病毒嗜性,而非免疫介导机制,仍不清楚。在此,我们评估了24名COVID-19患者和18名匹配的因肺炎/呼吸衰竭死亡的对照者的神经病理学改变。除了广泛的神经病理学改变外,在5名COVID-19受试者的延髓背侧和黑质中检测到SARS-CoV-2免疫反应性神经元。通过实时RT-PCR也检测到病毒RNA。反应性小胶质细胞的定量显示,在受影响的脑干区域内,炎症呈解剖学分离模式,且高于对照。虽然本研究结果支持SARS-CoV-2的神经侵袭潜力,并表征了脑干炎症在COVID-19中的作用,但其对神经退行性变(尤其是帕金森病)的潜在影响需要进一步研究。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
SARS-CoV-2是否能感染中枢神经系统,尤其是脑干,并引起特定的神经病理学改变?
核心机制
SARS-CoV-2可能通过直接侵袭或免疫介导机制引起脑干炎症,表现为特定区域的微胶质细胞增多,但直接病毒损伤的证据不足。
主要证据
在5名COVID-19患者的延髓和黑质中检测到病毒蛋白和RNA,且脑干特定区域的微胶质密度显著高于对照。
研究意义
作者提出病毒可能入侵中枢神经系统,并可能对神经退行性疾病(尤其是帕金森病)的发病或加重有潜在影响,但需要进一步研究。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

病例收集与神经病理学评估

评估COVID-19患者和对照组脑的病理学改变。

对24名COVID-19患者和18名对照组进行尸检,采样脑干等区域,进行HE染色和神经病理学评估。

2

病毒蛋白检测

检测SARS-CoV-2病毒蛋白在脑组织中的存在和定位。

使用抗S和N蛋白的抗体进行免疫组织化学和免疫荧光染色。

3

病毒RNA检测

确认病毒基因组在脑组织中的存在。

从FFPE组织切片中提取RNA,进行实时RT-PCR检测SARS-CoV-2 N基因和亚基因组RNA。

4

小胶质细胞定量分析

量化脑干各区域的小胶质细胞密度和活化状态。

使用TMEM119免疫过氧化物酶染色和TMEM119/CD68双重免疫荧光染色,在延髓、脑桥和中脑选定区域进行细胞计数。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
抗SARS-CoV-2核衣壳抗体Sino Biologicals40143-R001
抗SARS-CoV-2刺突亚基1抗体Sino Biological40150-R007
抗TMEM119抗体Abcamab185333
抗GFAP抗体Dako OmnisGA524
抗CD61抗体Dako OmnisM0753
抗CD68抗体Dako OmnisM0756
HLA-DR抗体Invitrogen, Thermo Fisher Scientific--
抗Ki-67抗体Spring BioscienceM3060
Alexa-Fluor plus 488山羊抗小鼠二抗--A32723
Alexa-Fluor plus 568抗兔二抗--A-11011
Hoechst 33258Invitrogen--
Mowiol 4-88试剂MerckMillipore475904-100GM
RecoverAll™总核酸提取试剂盒Thermo Fisher Scientific--
ABI 7900HT序列检测系统Thermo Fisher Scientific--
徕卡SP5激光扫描共聚焦显微镜Leica--
Dako EnVision自动染色仪Dako--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
病例收集
COVID-19确诊方式(鼻咽拭子RT-PCR)、样本质量(PMI≤5天)、纳入标准
阅读提示:Methods:Hospitalized patients... Inclusion criteria
组织处理
固定液(4%缓冲福尔马林)、固定时间(2-3周)、脱水处理
阅读提示:Methods:Sampling and fixation procedures
病毒蛋白检测
一抗类型、克隆号、稀释度、抗原修复条件、阳性/阴性对照
阅读提示:Methods:Histochemical and immunoperoxidase staining
RT-PCR
引物/探针信息、RNA提取方法、仪器型号
阅读提示:Methods:RT-PCR analyses
小胶质细胞定量
计数区域定义、视野数量、细胞计数标准、统计分析
阅读提示:Methods:Quantification of activated microglia, Figure legends