病例收集与神经病理学评估
评估COVID-19患者和对照组脑的病理学改变。
对24名COVID-19患者和18名对照组进行尸检,采样脑干等区域,进行HE染色和神经病理学评估。
Detection of SARS-CoV-2 viral proteins and genomic sequences in human brainstem nuclei.
包含患者样本的病理学分析、免疫组化、免疫荧光、RT-PCR及小胶质细胞定量,但缺乏功能验证和机制验证。
人类脑干组织样本(延髓、中脑) COVID-19患者尸检队列 肺炎/呼吸衰竭对照尸检队列
检测SARS-CoV-2 S和N蛋白的抗体(Sino Biologicals) 用于RNA检测的RT-PCR方法 用于小胶质细胞定量的TMEM119染色 神经病理学评估的半定量量表 免疫组化/免疫荧光的抗原修复条件
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估COVID-19患者和对照组脑的病理学改变。
对24名COVID-19患者和18名对照组进行尸检,采样脑干等区域,进行HE染色和神经病理学评估。
检测SARS-CoV-2病毒蛋白在脑组织中的存在和定位。
使用抗S和N蛋白的抗体进行免疫组织化学和免疫荧光染色。
确认病毒基因组在脑组织中的存在。
从FFPE组织切片中提取RNA,进行实时RT-PCR检测SARS-CoV-2 N基因和亚基因组RNA。
量化脑干各区域的小胶质细胞密度和活化状态。
使用TMEM119免疫过氧化物酶染色和TMEM119/CD68双重免疫荧光染色,在延髓、脑桥和中脑选定区域进行细胞计数。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 抗SARS-CoV-2核衣壳抗体 | Sino Biologicals | 40143-R001 |
| 抗SARS-CoV-2刺突亚基1抗体 | Sino Biological | 40150-R007 | |
| 抗TMEM119抗体 | Abcam | ab185333 | |
| 抗GFAP抗体 | Dako Omnis | GA524 | |
| 抗CD61抗体 | Dako Omnis | M0753 | |
| 抗CD68抗体 | Dako Omnis | M0756 | |
| HLA-DR抗体 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗Ki-67抗体 | Spring Bioscience | M3060 | |
| 免疫荧光 | Alexa-Fluor plus 488山羊抗小鼠二抗 | -- | A32723 |
| Alexa-Fluor plus 568抗兔二抗 | -- | A-11011 | |
| Hoechst 33258 | Invitrogen | -- | |
| Mowiol 4-88试剂 | MerckMillipore | 475904-100GM | |
| RT-PCR | RecoverAll™总核酸提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| ABI 7900HT序列检测系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫荧光 | 徕卡SP5激光扫描共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 免疫组织化学 | Dako EnVision自动染色仪 | Dako | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 病例收集 | COVID-19确诊方式(鼻咽拭子RT-PCR)、样本质量(PMI≤5天)、纳入标准 阅读提示:Methods:Hospitalized patients... Inclusion criteria |
| 组织处理 | 固定液(4%缓冲福尔马林)、固定时间(2-3周)、脱水处理 阅读提示:Methods:Sampling and fixation procedures |
| 病毒蛋白检测 | 一抗类型、克隆号、稀释度、抗原修复条件、阳性/阴性对照 阅读提示:Methods:Histochemical and immunoperoxidase staining |
| RT-PCR | 引物/探针信息、RNA提取方法、仪器型号 阅读提示:Methods:RT-PCR analyses |
| 小胶质细胞定量 | 计数区域定义、视野数量、细胞计数标准、统计分析 阅读提示:Methods:Quantification of activated microglia, Figure legends |