预测接受新辅助放化疗的局部晚期直肠癌治疗反应和预后的新型生物标志物

目的：确定与接受新辅助放化疗（NCRT）的局部晚期直肠癌（LARC）患者治疗反应和预后相关的基因。方法：在我们的队列中，检测并生成了NCRT前64份肿瘤活检样本的基因表达谱。进行加权基因共表达网络分析以识别基因模块。外部验证数据集包括GSE3493、GSE119409和GSE133057。使用免疫组织化学（IHC）评估候选基因的表达。使用TIMER评估免疫浸润。结果：我们使用我们的数据和外部验证数据集识别并验证了CCT5和ELF1预测治疗反应的能力。GSE133057数据集中候选基因的生存差异趋势与我们的队列相似。CCT5和ELF1的高表达与NCRT耐药和不良预后相关。此外，还通过IHC方法评估了117例LARC患者样本中CCT5和ELF1的表达。基于IHC结果和Cox分析，构建了包含CCT5和ELF1的风险评分模型，且表现良好。该风险评分是LARC患者无进展生存期和总生存期的独立预后因素，并用于构建列线图模型。使用基因集富集分析探讨了CCT5和ELF1的潜在机制。潜在通路包括凋亡、细胞周期等。CCT5和ELF1的表达与免疫细胞浸润显著相关。结论：CCT5和ELF1被确定为LARC患者治疗反应和预后的生物标志物。风险评分模型和列线图有助于预测接受NCRT的LARC患者的治疗反应和生存结果。