活体成像观察分裂沟定位
观察centralspindlin和RhoGEF在分裂神经母细胞中的定位动态,确定其与分裂沟形成的关系。
表达RacGAP-GFP或RhoGEF-EGFP的果蝇神经母细胞进行活体成像,记录分裂过程中蛋白定位和膜内陷。
Centralspindlin-mediated transport of RhoGEF positions the cleavage plane for cytokinesis.
体外实验(微管滑动、转运、滞留)结合活体神经母细胞成像及模拟,包含功能与机制验证。
果蝇Sf9细胞(蛋白表达) 果蝇神经母细胞(活体成像) 体外重构系统(稳定微管)
RhoGEF-Venus与centralspindlin的浓度比例和预孵育时间 ATP浓度(4 mM)及AMP-PNP对照 微管制备中taxol浓度(10 μM) 活体成像中RacGAP-GFP和RhoGEF-EGFP的定位时序 滞留时间阈值(100秒)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察centralspindlin和RhoGEF在分裂神经母细胞中的定位动态,确定其与分裂沟形成的关系。
表达RacGAP-GFP或RhoGEF-EGFP的果蝇神经母细胞进行活体成像,记录分裂过程中蛋白定位和膜内陷。
获得有活性的全长centralspindlin和RhoGEF-Venus用于体外实验。
使用杆状病毒表达系统在Sf9细胞中表达并纯化centralspindlin(kinesin-6 + RacGAP)、kinesin-6单独、RhoGEF-Venus,并通过微管滑动实验验证centralspindlin活性。
检测centralspindlin是否直接将RhoGEF作为货物沿微管转运。
将taxol稳定的rhodamine标记微管固定在盖玻片上,流加centralspindlin和RhoGEF-Venus混合物,使用转盘共聚焦显微镜追踪RhoGEF-Venus的运动。
确定转运方向是否为微管正端导向。
制备极性标记的微管(负端较亮),观察RhoGEF-Venus的移动方向。
评估RhoGEF和centralspindlin在微管正端的滞留行为。
追踪转运后的RhoGEF-Venus和centralspindlin-GFP在微管上的滞留时间,并统计滞留百分比。
探究RhoGEF结合是否调节centralspindlin的马达活性。
比较无货物centralspindlin与RhoGEF结合centralspindlin的速度、运行长度和运行时间。
评估不同centralspindlin行为对RhoGEF在微管正端定位的贡献。
使用R进行模拟,改变centralspindlin保留、转运和速度参数,模拟RhoGEF沿微管的分布。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质表达 | pDonR221载体 | Invitrogen | 12536017 |
| pDEST8载体 | Invitrogen | 11804010 | |
| Max Efficiency DH10Bac感受态大肠杆菌细胞 | Gibco | 10361012 | |
| Sf9细胞 | Millipore Sigma | 71104-3 | |
| Cellfectin II转染试剂 | Invitrogen | 10362100 | |
| 蛋白质纯化 | Ni-NTA亲和树脂 | Qiagen | 30210 |
| 微管制备 | 微管蛋白 | Cytoskeleton | T240 |
| 罗丹明标记微管蛋白 | Cytoskeleton | TL590M | |
| 生物素标记微管蛋白 | Cytoskeleton | T333P | |
| GMPCPP | Jena Bioscience | NU-405S | |
| 微管滑动与转运实验 | 生物素化牛血清白蛋白 | ThermoFisher Scientific | 29130 |
| 链霉亲和素 | ThermoFisher Scientific | 21125 | |
| 普朗尼克F127 | Millipore Sigma | P2443 | |
| 蛋白质纯化 | QuikChange Lightning多位点定向突变试剂盒 | Agilent | 210515 |
| QuikChange Lightning定点突变试剂盒 | Agilent | 210518 | |
| 转运实验对照 | 重组GFP | Sino Biological | 13105-S07E |
| 活体成像 | RacGAP-GFP果蝇品系 | Bloomington Drosophila Stock Center | 76264 |
| RhoGEF-EGFP果蝇品系 | Bloomington Drosophila Stock Center | 76257 | |
| 成像 | Leica DM16000B倒置宽场显微镜 | Leica | -- |
| 滨松EMCCD相机(ORCA 9100-02) | Hamamatsu | -- | |
| 尼康Eclipse TE2000-E倒置转盘共聚焦显微镜 | Nikon | -- | |
| 滨松EMCCD相机(ImageEM X2) | Hamamatsu | -- | |
| 100x 1.4 NA Plan-Apochromat物镜 | -- | -- | |
| 100x 1.4 NA油浸物镜 | -- | -- | |
| 数据分析 | ImageJ | -- | -- |
| R | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蛋白质表达与纯化 | 杆状病毒表达系统;Sf9细胞培养条件;Ni-NTA纯化步骤;蛋白浓度 阅读提示:Materials and Methods: Protein purification |
| 微管制备 | tubulin:rhodamine-tubulin:biotin-tubulin比例;GTP浓度;taxol浓度;聚合温度和时间;极性标记微管制备细节 阅读提示:Materials and Methods: Preparation of fluorescently-labeled microtubules |
| 体外转运和行走实验 | 缓冲液组成(Tris, KCl, MgATP, Pluronic F127, taxol);centralspindlin与RhoGEF-Venus比例;孵育时间;成像参数(时间间隔) 阅读提示:Materials and Methods: Transport and walking assays |
| 活体神经母细胞成像 | 果蝇品系(RacGAP-GFP, RhoGEF-EGFP);幼虫饲养温度;解剖和压片方法;成像时间间隔 阅读提示:Materials and Methods: Drosophila stocks; Larval neuroblast dissections |