蛋白设计与表达纯化
获得水溶性膜受体(CXCR4QTY-Fc)和S层蛋白融合(rSbpA-ZZ)并验证其结构。
利用QTY code设计CXCR4QTY,与IgG-Fc融合,在E. coli中表达纯化;rSbpA-ZZ按先前方法表达。通过CD、MST等验证结构。
Scalable biomimetic sensing system with membrane receptor dual-monolayer probe and graphene transistor arrays.
包含蛋白设计、表达纯化、结构预测、MST、QCM、AFM、TEM、GFET阵列检测及血清验证等多层级功能与机制验证。
CXCR4QTY-Fc/rSbpA-ZZ双单层构建体 GFET阵列(>200个传感器) 人血清样品
rSbpA-ZZ和CXCR4QTY-Fc的序贯包被及缓冲液条件 CXCL12和CCL5浓度梯度(10^-10至10^-5 M) HIV gp41-120浓度梯度 pH 3.0甘氨酸缓冲液再生处理时间(1小时) 100%人血清中检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得水溶性膜受体(CXCR4QTY-Fc)和S层蛋白融合(rSbpA-ZZ)并验证其结构。
利用QTY code设计CXCR4QTY,与IgG-Fc融合,在E. coli中表达纯化;rSbpA-ZZ按先前方法表达。通过CD、MST等验证结构。
验证rSbpA-ZZ和CXCR4QTY-Fc的顺序组装及可逆性。
在硅片和QCM芯片上依次包被rSbpA-ZZ和CXCR4QTY-Fc,通过QCM、AFM、TEM观察。
验证CXCR4QTY-Fc的配体结合能力和特异性。
MST测定与CXCL12的结合;OCV测试评估结合引起的电位变化;QCM阻抗测试验证检测灵敏度和特异性。
评估双单层修饰的GFET阵列对CXCL12和gp41-120的检测性能。
在GFET阵列上依次包被rSbpA-ZZ和CXCR4QTY-Fc,测量I-V曲线,提取狄拉克点位移,进行浓度梯度检测。
验证系统在复杂生物流体中的稳定性和抗非特异性吸附能力。
将完全构建的阵列孵育在人血清中,测量DP位移;在100%人血清中进行CXCL12和gp41-120梯度检测。
验证酸性缓冲液处理可恢复传感器基线。
将经过配体检测的芯片浸入pH 3.0甘氨酸缓冲液,监测DP恢复。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白表达 | pET20b | -- | -- |
| IPTG | -- | -- | |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA琼脂糖珠 | QIAGEN | -- |
| ÄKTA纯化系统 | GE Healthcare | -- | |
| Superdex 200凝胶过滤柱 | GE Healthcare | -- | |
| MST | Monolith NT蛋白标记试剂盒RED-NHS | NanoTemper Technologies | -- |
| Monolith NT.115 pico仪器 | NanoTemper Technologies | -- | |
| AFM | Asylum Cypher ES原子力显微镜 | Asylum Research | -- |
| Pyrex-Nitride三角AFM探针 | NanoWorld | -- | |
| TEM | FEI Tecnai T20透射电子显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| CD | JASCO J-1500圆二色谱仪 | JASCO | -- |
| OCV | Slide-A-Lyzer MINI透析管 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 34401A万用表 | Hewlett Packard | -- | |
| QCM | QSense E4石英晶体微天平 | Biolin Scientific | -- |
| QSX 301金涂层石英传感器 | QSense | -- | |
| QCM-І阻抗分析仪 | Gamry | -- | |
| GFET制造 | Corning willow玻璃晶圆 | Corning | -- |
| Trivial Transfer Graphene石墨烯 | ACS Materials | -- | |
| GFET测试 | CXCL12重组蛋白 | Sino Biological | 13511-HNCE |
| CCL5重组蛋白 | Sino Biological | 10900-HNAE | |
| 胰岛素 | MilliporeSigma | 91077C | |
| HIV gp41-120重组蛋白 | Prospec | HIV-158 | |
| 人血清 | MilliporeSigma | H5667 | |
| 蛋白表达 | B-PER蛋白提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蛋白表达与纯化 | E. coli菌株、诱导条件、裂解和纯化方法 阅读提示:Materials and Methods: E. coli synthesis of CXCR4QTY-Fc and rSbpA-ZZ |
| 双单层构建体组装 | 包被顺序、缓冲液pH(9.0)、CaCl2浓度、孵育时间和温度 阅读提示:Materials and Methods: Dual-monolayer coating on graphene-based sensor array; Atomic force microscopy |
| 配体检测 | 配体浓度范围、溶解缓冲液、孵育时间、洗涤步骤 阅读提示:Materials and Methods: Graphene-based sensor array measurement; Figure 3 |
| 血清实验 | 血清来源、100%人血清、孵育时间 阅读提示:Results: Analyte detection in serum and antifouling test; Figure 4 |
| 再生实验 | 甘氨酸缓冲液pH 3.0、浸泡时间(1小时) 阅读提示:Materials and Methods: Graphene-based sensor array measurement; Figure 4D |