建立CRS体外模型
建立模拟CAR T细胞、肿瘤细胞和单核细胞相互作用的体外系统,以评估CRS相关细胞因子释放。
将CD19靶向CAR T细胞、Raji(或K562)细胞和单核细胞按1:1:1比例共培养,或使用transwell插入物分离单核细胞,检测IL-6等细胞因子水平。
Cell-Based Models of 'Cytokine Release Syndrome' Endorse CD40L and Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Knockout in Chimeric Antigen Receptor T Cells as Mitigation Strategy.
包含体外共培养模型、CRISPR-Cas9基因敲除、功能验证(细胞毒性和细胞因子释放)及CAST-Seq基因组完整性评估,多层次验证。
Raji细胞(CD19+白血病B细胞系) 原代单核细胞(健康供者) CD19-靶向CAR T细胞(健康供者来源原代T细胞)
CAR T细胞和单核细胞来自同一供者 效应细胞(CAR T细胞)与靶细胞(Raji)比例1:1 共培养时间72小时(IL-6检测) CD40L和GM-CSF敲除效率(>70%降低)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立模拟CAR T细胞、肿瘤细胞和单核细胞相互作用的体外系统,以评估CRS相关细胞因子释放。
将CD19靶向CAR T细胞、Raji(或K562)细胞和单核细胞按1:1:1比例共培养,或使用transwell插入物分离单核细胞,检测IL-6等细胞因子水平。
评估CD40L和GM-CSF阻断抗体对IL-6释放的影响。
在共培养中添加中和抗体,通过Cytometric Bead Array检测IL-6浓度。
使用CRISPR-Cas9双切口策略破坏CD40L和CSF2基因,并验证敲除效率。
通过核转染递送Cas9 RNPs,8天后用流式细胞术和DECODR分析敲除效率。
评估CD40L和/或GM-CSF敲除CAR T细胞对旁观单核细胞IL-6释放的影响。
将基因编辑的CAR T细胞与Raji和单核细胞共培养,检测IL-6水平。
确认基因敲除不影响CAR T细胞的细胞毒性。
将编辑的CAR T细胞与CFSE标记的Raji细胞共培养,通过流式细胞术检测CFSE+细胞的耗竭。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | GIBCO, Life Technologies | 11875093 |
| DMEM高糖GlutaMAX培养基 | GIBCO, Life Technologies | 61965-026 | |
| 胎牛血清 | PAN-Biotech | P40-47500 | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma-Aldrich | P0781 | |
| HEPES | Sigma-Aldrich | H3375 | |
| 白细胞介素-2 | ImmunoTool | 11340027 | |
| 白细胞介素-7 | Miltenyi Biotec | 130-095-361 | |
| 白细胞介素-15 | Miltenyi Biotec | 130-095-762 | |
| Ficoll-Paque | -- | -- | |
| CAR T细胞制备 | ImmunoCult人CD3/CD28/CD2试剂 | STEMCELL | 10970 |
| 硫酸鱼精蛋白 | -- | -- | |
| 基因编辑 | 4D-Nucleofector电转仪 | Lonza | V4XP-3032 |
| SpCas9蛋白 | IDT | 1081059 | |
| 引导RNA | Biolegio | -- | |
| CAR T细胞富集 | CD271微珠试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-099-023 |
| CAR T细胞激活 | 佛波醇-12-肉豆蔻酸酯-13-乙酸酯 | Sigma-Aldrich | P8139 |
| 离子霉素 | Sigma-Aldrich | 407952 | |
| 流式细胞术 | CD19CAR检测试剂 | Miltenyi Biotec | 130-115-965 |
| 抗生物素-PE抗体 | Miltenyi Biotec | 130-110-951 | |
| 抗生物素-FITC抗体 | Miltenyi Biotec | 130-090-857 | |
| 抗人CD3-APC抗体 | Miltenyi Biotec | 130-113-125 | |
| 抗人CD14-FITC抗体 | Beckman-Coulter | B36297 | |
| 抗人CD19-FITC抗体 | BioLegend | 302206 | |
| 抗人CD25-PE抗体 | Miltenyi Biotec | 130-113-282 | |
| 抗人CD25-APC抗体 | Miltenyi Biotec | 130-113-280 | |
| 抗人CD69-PE抗体 | BD | 555531 | |
| 抗人CD40-PE抗体 | Sino Biological | 10774-MM17-P | |
| 抗CD154(CD40L)-FITC抗体 | Invitrogen | 11-1548-42 | |
| 抗CD271(LNGFR)-APC抗体 | Miltenyi Biotec | 130-116-497 | |
| 抗人GM-CSF-PE抗体 | BD | 554507 | |
| 抗人Fcγ阻断剂 | BD | 564220 | |
| 抗人小鼠IgG2a-FITC抗体 | BD | 555573 | |
| 抗人小鼠IgG1,k-PE抗体 | BD | 556650 | |
| 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | P4170 | |
| Dulbecco磷酸盐缓冲盐水 | Thermo Fisher Scientific | 14190250 | |
| 流式分析 | Accuri C6流式细胞仪 | BD | 4650 |
| 数据 | FlowJo V10软件 | BD | -- |
| CRS体外模型 | EasySep人CD14阳性选择试剂盒II | STEMCELL | 17858 |
| Transwell插入物(0.4 μm孔径) | Corning | 3470 | |
| 24孔板 | Sarstedt | -- | |
| 中和抗体 | 抗人CD40L中和抗体 | InvivoGen | mabg-h40l-3 |
| 抗人GM-CSF中和抗体 | BD | 554502 | |
| 细胞因子检测 | 流式微球阵列(CBA) | BD | 560111, |
| BD FACSCanto II流式细胞仪 | BD | -- | |
| 统计 | GraphPad 8.4.3软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CRS体外模型 | CAR T细胞与单核细胞来自同一供者;效应细胞与靶细胞比例1:1;共培养时间72小时;靶细胞为Raji细胞(CD19+)或K562(CD19-)作为对照。 阅读提示:Methods 2.6节 |
| 基因编辑 | 电穿孔程序;RNP剂量(单敲除:18.3 pmol Cas9 + 55 pmol gRNA;双敲除:每种9.15 pmol Cas9 + 28 pmol gRNA);敲除效率评估时间(8天后)。 阅读提示:Methods 2.2节 |
| 细胞毒性实验 | E:T比例1:1和2.5:1;共培养时间48小时;靶细胞CFSE标记。 阅读提示:Methods 2.5节 |
| 细胞因子检测 | CBA试剂盒种类;上清收集时间(72小时) 阅读提示:Methods 2.7节 |