样本收集与队列构建
收集SOTR和HCW的疫苗接种后血浆样本,以评估体液免疫应答。
招募20名HCW和64名SOTR(肾30、肝10、肺13、心8),采集第二剂和第三剂疫苗后的血浆样本。
Humoral immune responses against SARS-CoV-2 Spike variants after mRNA vaccination in solid organ transplant recipients.
包含前瞻性队列样本、ELISA、流式结合、ADCC、中和及亲和力检测,但缺乏动物模型和机制验证。
实体器官移植受者队列(肾、肝、肺、心脏) SARS-CoV-2未感染医护人员队列
不同实体器官移植类型(肾、肝、肺、心脏)样本量 接种剂量及时间点(第二剂后中位26天,第三剂后中位35天) 免疫抑制药物及日剂量 中和方法(假病毒D614G、Delta、Omicron) 对照HCW队列接种间隔(16周)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
收集SOTR和HCW的疫苗接种后血浆样本,以评估体液免疫应答。
招募20名HCW和64名SOTR(肾30、肝10、肺13、心8),采集第二剂和第三剂疫苗后的血浆样本。
定量检测疫苗诱导的针对Spike RBD的IgG抗体水平。
使用ELISA检测血浆中抗RBD IgG水平,以CR3022抗体为阳性对照。
评估疫苗诱导抗体对SARS-CoV-2不同变体和HKU1的Spike蛋白的结合能力。
293T细胞表达全长Spike,用流式细胞术检测血浆与D614G、Delta、Omicron及HKU1 Spike的结合。
评估疫苗诱导抗体介导的ADCC活性。
使用CEM.NKr靶细胞和PBMC效应细胞进行FACS-based ADCC实验。
测定疫苗诱导抗体对SARS-CoV-2假病毒(D614G、Delta、Omicron)的中和能力。
假病毒与血浆系列稀释孵育后感染293T-ACE2细胞,计算ID50。
通过亲合力指数评估抗体成熟程度。
ELISA中平行使用8M尿素洗涤和常规洗涤,计算RBD avidity index。
评估免疫抑制药物日剂量对疫苗诱导IgG水平的影响。
按药物日剂量分组,比较抗RBD IgG水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ELISA | 重组SARS-CoV-2 S RBD蛋白 | -- | -- |
| CR3022单克隆抗体 | Dr M. Gordon Joyce | RRID: | |
| HRP标记抗人IgG二抗 | Invitrogen | 31413; | |
| Western Lightning Plus-ECL增强化学发光底物 | Perkin Elmer Life Sciences | NEL105001EA | |
| TriStar LB942微板读取器 | Berthold Technologies | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | A7638 | |
| 吐温20 | Sigma | P9416-100ML | |
| Flow cytometry | CV3-25抗体 | -- | -- |
| Alexa Fluor 647标记的羊抗人IgA+IgG+IgM二抗 | Jackson ImmunoResearch | 109-605-064; | |
| LIVE-DEAD Fixable AquaVivid细胞染料 | Thermo Fisher Scientific | P34957 | |
| BD LSRII流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| ADCC assay | 细胞增殖染料eFluor 670 | Thermo Fisher Scientific | 65-0840-85 |
| 细胞增殖染料eFluor450 | Thermo Fisher Scientific | 65-0842-85 | |
| 37%甲醛 | Thermo Fisher Scientific | F79-500 | |
| 中和实验 | 荧光素缓冲液 | -- | -- |
| D-荧光素钾盐 | Thermo Fisher Scientific | L2916 | |
| 被动裂解缓冲液 | Promega | E1941 | |
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Wisent | 319-005-CL |
| 洛斯维尔公园纪念研究所培养基 | Thermo Fischer Scientific | 61870036 | |
| 胎牛血清 | VWR | 97068-085 | |
| 青霉素/链霉素 | Wisent | 450-201-EL | |
| 磷酸盐缓冲液 | ThermoFischer Scientific | 10010023 | |
| 蛋白质纯化 | ExpiFectamine 293转染试剂 | ThermoFisher Scientific | A14525 |
| Freestyle 293F表达培养基 | Thermo Fischer Scientific | A14525 | |
| Ni-NTA琼脂糖 | Invitrogen | -- | |
| 质粒构建 | pCG1-SARS-CoV-2 D614G-Spike质粒 | -- | -- |
| pCMV3-HCoV-HKU1-Spike质粒 | Sino Biological | VG40021-UT | |
| pCAGGS-SARS-CoV-2-B.1.617.2-Spike (Delta)质粒 | -- | -- | |
| pCAGGS-SARS-CoV-2-B.1.1.529-Spike (Omicron)质粒 | -- | -- | |
| 中和实验 | pNL4.3 R-E- Luc质粒 | NIH AIDS reagent program | 3418 |
| 质粒构建 | pIRES2-EGFP质粒 | Clontech | 6029–1 |
| 细胞系 | HEK293T细胞 | ATCC | CRL-3216; |
| FreeStyle 293F细胞 | ThermoFischer Scientific | R79007; |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本采集 | HCW和SOTR的纳入标准(SOTR移植后>1个月,且抗N抗体阴性) 阅读提示:STAR★Methods: Human subjects |
| 疫苗方案 | HCW第一二剂间隔(16周),SOTR第一二剂间隔(中位36天)及第二三剂间隔(中位110天) 阅读提示:Table 1 |
| ELISA检测 | 重组RBD蛋白浓度(2.5 μg/mL),血浆稀释度(1/250),封闭和洗涤条件 阅读提示:STAR★Methods: Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) |
| Spike结合检测 | 293T细胞转染的Spike质粒类型(D614G、Delta、Omicron、HKU1),血浆稀释度(1/250) 阅读提示:STAR★Methods: Cell surface staining and flow cytometry analysis |
| ADCC实验 | 靶细胞与效应细胞比例(1:10),血浆稀释度(1/500),孵育时间(5小时) 阅读提示:STAR★Methods: ADCC assay |
| 中和实验 | 血浆稀释系列(1/50至1/31250),假病毒与血浆孵育时间(1小时),感染时间(48小时) 阅读提示:STAR★Methods: Virus neutralization assay |
| 抗RBD亲和力 | 尿素浓度(8M),血浆稀释度(1/250) 阅读提示:STAR★Methods: Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and RBD avidity index |
| 免疫抑制药物影响 | 免疫抑制药物日剂量分组(泼尼松≤5 vs >5 mg/天,他克莫司<5 vs ≥5 mg/天,霉酚酸酯<1000 vs ≥1000 mg/天) 阅读提示:Figure 5 |