构建条件性敲除小鼠模型
研究Pofut2在肢体间充质中的功能,避免早期胚胎致死。
使用Prrx1-Cre重组酶与Pofut2-floxed等位基因杂交,生成Prrx1-Pofut2条件性敲除小鼠。
O-fucosylation of thrombospondin type 1 repeats is essential for ECM remodeling and signaling during bone development.
包含条件性基因敲除小鼠模型、组织学分析、免疫荧光、RNAscope、质谱糖蛋白组学、细胞分泌实验等多层级验证,并进行了功能与机制验证。
Prrx1-Pofut2条件性敲除小鼠 POFUT2缺失的HEK293T细胞 野生型HEK293T细胞
Pofut2条件性敲除小鼠模型(Prrx1-Cre) E14.5胚胎肢体样本 ADAMTS6、ADAMTS10和CCN2的质谱糖蛋白组学分析 HEK293T细胞分泌实验(野生型与POFUT2缺失) TGF-β和BMP信号通路检测(pSMAD2和pSMAD1/5/9)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究Pofut2在肢体间充质中的功能,避免早期胚胎致死。
使用Prrx1-Cre重组酶与Pofut2-floxed等位基因杂交,生成Prrx1-Pofut2条件性敲除小鼠。
评估Pofut2缺失对骨骼发育的影响。
通过骨骼制备、组织学染色和Micro-CT分析肢体长度、生长板结构和骨参数。
分析ECM成分和信号通路变化。
通过免疫荧光检测FBN2、FBN1、pSMAD2、pSMAD1/5/9、COL-II、COL-X、RUNX2;通过RNAscope检测Pofut2和Ptch1 mRNA。
验证O-岩藻糖基化对底物分泌的影响。
在野生型和POFUT2缺失的HEK293T细胞中表达ADAMTS6、ADAMTS10和CCN2,通过Western blot检测分泌水平。
确定ADAMTS6、ADAMTS10和CCN2上O-岩藻糖修饰的位点。
纯化蛋白、酶切、质谱分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养和转染 | 聚乙烯亚胺 | -- | -- |
| Lipofectamine 2000 | Thermo Fisher | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI Fluoromount-G | SouthernBiotech | 0100-20 |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA柱 | VWR | -- |
| 质谱分析 | Q-Exactive质谱仪 | -- | -- |
| RNAscope | RNAscope 2.5 HD检测试剂盒 | Advanced Cell Diagnostics | -- |
| EdU检测 | Click-iT EdU Alexa Fluor 594成像试剂盒 | Thermo Fisher | C10339 |
| RNA提取 | RNeasy微型试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| cDNA合成 | SuperScript VILO cDNA合成试剂盒 | Invitrogen | 11754050 |
| RT-qPCR | PowerTrack SYBR Green预混液 | Thermo Fisher | A46109 |
| iQ SYBR Green | Bio-Rad | 1708880 | |
| 骨骼制备 | 阿尔辛蓝 | Sigma | A3157 |
| 茜素红 | Sigma | A5533 | |
| Zeiss Discovery V8显微镜 | Zeiss | -- | |
| 免疫印迹 | Odyssey CLx系统 | LI-COR | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | Pofut2条件性敲除小鼠的基因型:Pofut2-Flox/+;Prrx1-Cre/+和Pofut2-Flox/Δ;Prrx1-Cre/+ 阅读提示:Methods: Mice and genotyping |
| 胚胎取材 | 胚胎日龄:E14.5,样本数:至少3个胚胎/基因型 阅读提示:Figure legends: Fig. 2, Fig. 3 |
| 免疫荧光 | 一抗和二抗的稀释比例、固定方法(4% PFA或5%乙酸乙醇) 阅读提示:Methods: Histology and immunohistochemistry; Supplementary Table S3 |
| 细胞分泌实验 | 质粒DNA量(ADAMTS6: 2.4μg, CCN2: 1.8μg, ADAMTS10: 2.4μg),转染试剂(PEI或Lipofectamine 2000),检测时间(3天) 阅读提示:Methods: Cell-based secretion assays |
| 质谱分析 | 蛋白酶(胰蛋白酶或胰凝乳蛋白酶),质谱仪(Q-Exactive),数据库(ADAMTS6: D3Z1A5, ADAMTS10: Q9H324, CCN2: P29268) 阅读提示:Methods: Mass Spectral Analysis |