SARS-CoV-2的刺突蛋白在斑马鱼中通过Tlr2传导信号

The Spike protein of SARS-CoV-2 signals via Tlr2 in zebrafish.

作者信息Sylwia D Tyrkalska, Alicia Martínez-López, Annamaria Pedoto, Sergio Candel, María L Cayuela, Victoriano Mulero
PMID36587712
发布时间2023-03
DOI10.1016/j.dci.2022.104626

实验完整度

包含基因敲除(CRISPR/Cas9)和突变体(Myd88缺陷)的功能验证,体内成像观察免疫细胞募集,RT-qPCR和Caspase-1活性检测,以及多种转基因报告系,证据层级至少两个。

主要模型

斑马鱼幼虫(Tg(mpx:eGFP)、Tg(lyz:dsRED2)、Tg(mfap4:mCherry)、Tg(NFkB-RE:eGFP)等) 斑马鱼Myd88突变体(myd88hu3668/hu3568) 斑马鱼Tlr2敲低模型(CRISPR/Cas9)

重点核对

S1WT注射浓度0.25 mg/ml,注射部位为48 hpf幼虫后脑室,每只注射1 nl CRISPR/Cas9注射:gRNA浓度250 ng/μl,Cas9 500 ng/μl,注射至1-8细胞期胚胎卵黄囊 观察时间点:3、6、12、24 hpi(免疫细胞募集和Nfkb活性) 基因敲低效率约70%,并通过TIDE确认 使用阴性对照gRNA和阳性质控flagellin

摘要

针对入侵病原体(包括病毒)最深入研究的防御机制之一是Toll样受体(TLRs)。其中,TLR3、TLR7、TLR8和TLR9在内体区室中检测不同形式的病毒核酸,而TLR2和TLR4在细胞外识别病毒结构蛋白和非结构蛋白。尽管许多不同的TLR已被证明参与SARS-CoV-2感染和不同结构蛋白的识别,但大多数研究在体外进行,获得的结果相当矛盾。在本研究中,我们利用斑马鱼模型在体内成像和基因编辑方面的独特优势,报道了来自武汉株的刺突蛋白S1结构域(S1WT)通过Tlr2/Myd88信号通路诱导斑马鱼幼虫的过度炎症,且不依赖白细胞介素-1β的产生。此外,S1WT还触发了紧急髓系造血,但在这种情况下通过Tlr2/Myd88非依赖性信号通路。这些结果揭示了鱼类宿主对病毒蛋白反应的机制。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
SARS-CoV-2刺突蛋白S1结构域在斑马鱼中是否通过Tlr2/Myd88信号通路诱导过度炎症和紧急髓系造血?
核心机制
S1WT通过Tlr2/Myd88信号通路诱导过度炎症,但不依赖Il1b产生;紧急髓系造血则独立于Tlr2/Myd88信号通路。
主要证据
在Myd88缺陷和Tlr2敲低斑马鱼幼虫中,S1WT诱导的免疫细胞募集、Nfkb活性和炎症因子表达均降低,而髓系细胞数量不受影响;Il1b缺失不影响炎症反应。
研究意义
本研究提供了斑马鱼模型,用于研究SARS-CoV-2刺突蛋白引起的炎症和造血反应,有助于理解COVID-19相关细胞因子风暴和紧急造血的机制。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

Myd88在S1WT诱导过度炎症和紧急髓系造血中的作用

确定Myd88是否介导S1WT诱导的炎症和造血反应

将S1WT或flagellin注射至Myd88缺陷和野生型斑马鱼幼虫后脑室,在6、12、24 hpi观察免疫细胞募集和总数,并在12 hpi检测炎症基因表达和24 hpi检测caspase-1活性。

2

Il1b在S1WT诱导过度炎症中的作用

测试Il1b是否参与S1WT诱导的炎症反应

通过CRISPR/Cas9敲除il1b基因,然后注射S1WT,观察免疫细胞募集、Nfkb活性、炎症基因表达和caspase-1活性。

3

Tlr2在S1WT诱导过度炎症中的作用

确定Tlr2是否介导S1WT诱导的炎症反应

检测S1WT注射后tlr2等基因表达变化,并通过CRISPR/Cas9敲低tlr2,观察免疫细胞募集、Nfkb活性和炎症基因表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

基因编辑
基因表达分析
体内成像
酶活性检测

产品清单

实验环节名称品牌货号
TRIzol试剂Invitrogen--
SuperScript IV RNase H逆转录酶Invitrogen--
SYBR Green PCR核心试剂Applied Biosystems--
ABIPRISM 7500Applied Biosystems--
Cas9核酸酶V3IDT1081058
阴性对照crRNAIDT1072544
重组His标签刺突S1野生型蛋白Sino Biological40591-V08B1
鞭毛蛋白Invivogen--
Z-YVAD-AFCCalbiochem--
Leica MZ16F荧光体视显微镜Leica--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
斑马鱼品系与饲养
所用转基因和突变体品系的具体来源及饲养条件,如Tg(mpx:eGFP)、Tg(lyz:dsRED2)、Tg(mfap4:mCherry)、Tg(NFkB-RE:eGFP)和myd88突变体等。
阅读提示:Methods部分‘Animals’小节
CRISPR/Cas9基因敲除
crRNA序列、浓度、注射量和胚胎期,以及敲除效率确认方法。
阅读提示:Methods部分‘CRISPR and recombinant protein injections’小节及补充表S2
S1WT注射与剂量
S1WT蛋白浓度0.25 mg/ml,注射体积1 nl,注射部位为48 hpf幼虫后脑室。
阅读提示:Methods部分‘CRISPR and recombinant protein injections’小节
体内成像与细胞计数
成像时间点(3、6、12、24 hpi),使用的荧光显微镜型号,以及细胞计数方法(视觉计数和ImageJ分析)。
阅读提示:Methods部分‘In vivo imaging’小节
基因表达分析
RNA提取方法、逆转录条件、实时PCR所用仪器和试剂,以及内参基因rps11。
阅读提示:Methods部分‘Analysis of gene expression’小节