细胞模型和病毒感染
评估不同CFTR状态细胞对SARS-CoV-2感染的敏感性。
使用CFBE41o-(WT和ΔF)、16HBE14o-(WT和KO)和MucilAir™(wt/wt和F508del/F508del)细胞,以MOI=1感染SARS-CoV-2,并在感染后0-72小时收集样本。
CFTR Modulation Reduces SARS-CoV-2 Infection in Human Bronchial Epithelial Cells.
研究包含体外细胞系模型、3D原代上皮模型、基因敲除、药理学干预、病毒载量检测、ACE-2表达及功能验证,涵盖了多层级实验验证。
CFBE41o-细胞系(野生型CFTR和F508del-CFTR) 16HBE14o-细胞系(野生型和CFTR敲除) MucilAir™人支气管上皮3D模型(健康供体和CF患者)
CFTR状态:野生型、F508del突变、CRISPR-Cas9敲除 SARS-CoV-2感染复数(MOI=1)及感染后时间点(0-72小时) CFTR抑制剂IOWH-032(10 μM)处理野生型CFTR细胞 CFTR调节剂VX-661(3 μM)和VX-445(2 μM)处理F508del细胞 病毒载量检测:RT-PCR(ORF1ab基因)和S蛋白表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估不同CFTR状态细胞对SARS-CoV-2感染的敏感性。
使用CFBE41o-(WT和ΔF)、16HBE14o-(WT和KO)和MucilAir™(wt/wt和F508del/F508del)细胞,以MOI=1感染SARS-CoV-2,并在感染后0-72小时收集样本。
定量比较不同细胞中SARS-CoV-2复制水平。
通过实时RT-PCR检测上清液和细胞裂解物中的病毒RNA(ORF1ab基因),以及Western blot检测S蛋白表达。
探究ACE-2表达水平与病毒复制差异的关系。
通过流式细胞术、Western blot和免疫荧光检测ACE-2在细胞膜和细胞内的表达及分布。
验证CFTR功能对病毒复制的影响。
在wt-CFTR细胞中用IOWH-032抑制CFTR,在F508del细胞中用VX-661+VX-445纠正功能,随后感染病毒并检测病毒载量和TEER。
评估病毒感染对上皮屏障功能的影响。
测量MucilAir™模型的跨上皮电阻(TEER)以反映上皮完整性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma | -- |
| 胎牛血清 | Euroclone | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco, Thermo Fisher | -- | |
| MEM培养基 | Gibco, Thermo Fisher | -- | |
| GlutaMAX | Gibco, Thermo Fisher | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| MucilAir™ | Epithelix Sàrl | -- | |
| 病毒培养 | OptiMEM培养基 | Gibco, Thermo Fisher | -- |
| 病毒载量检测 | Allplex 2019-nCoV检测试剂盒 | Seegene | -- |
| Western blot | 抗ACE-2抗体 | Abcam | ab15348 |
| 抗SARS-CoV-2刺突蛋白抗体 | Sino Biological | 40591-MM42 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling | 4970 | |
| 流式细胞术 | ACE-2抗体 | Bioss | bs-1004R |
| Alexa Fluor 488偶联二抗 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | α-ACE-2抗体 | Abcam | ab15348 |
| Cy3标记的山羊抗兔抗体 | Jackson Laboratory | -- | |
| TO-PRO 3 | Life Technologies, Thermo Fisher | -- | |
| TEER测量 | EVOM2上皮电压电阻仪 | World Precision Instruments | -- |
| STX 2电极 | World Precision Instruments | -- | |
| 药物处理 | IOWH-032 | MedChemExpress LLC | -- |
| VX-661 | -- | -- | |
| VX-445 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和病毒准备 | 细胞系来源、CFTR状态、病毒株、MOI 阅读提示:见方法2.1和2.2 |
| 病毒感染 | 感染时间、MOI、温度、CO2浓度 阅读提示:见方法2.2 |
| 病毒载量检测 | RT-PCR靶基因、引物序列、定量方法 阅读提示:见方法2.3和表1 |
| ACE-2表达分析 | 抗体、稀释倍数、检测方法 阅读提示:见方法2.4、2.5和2.6 |
| CFTR药物处理 | 药物浓度、处理时间、给药方式 阅读提示:见方法2.2细胞处理部分 |
| TEER测量 | 测量时间点、电极类型、计算公式 阅读提示:见方法2.7 |