制备抗原探针
生成用于检测SARS-CoV-2刺突蛋白特异性B细胞的荧光标记抗原探针。
将生物素化的刺突蛋白亚基S1、S2和RBD与荧光标记的链霉亲和素按1:4的摩尔比混合,在4°C孵育60分钟。
Flow cytometric protocol to characterize human memory B cells directed against SARS-CoV-2 spike protein antigens.
方案提供了详细的染色、采集和设门步骤,并展示了四名供体的示例结果,但缺少机制验证或功能验证。
冷冻保存的人外周血单个核细胞 SARS-CoV-2疫苗免疫的健康供体
使用抗CD3、CD14、CD56抗体排除T细胞、单核细胞和NK细胞,CD19和/或CD20鉴定B细胞 用荧光标记的链霉亲和素和生物素化刺突蛋白制备抗原探针(S1、S2、RBD) 双重抗原探针(S1、S2)或单一探针(RBD)用于鉴定抗原特异性B细胞,并以链霉亲和素诱饵探针排除非特异性结合 使用LIVE/DEAD™可固定蓝死细胞染色试剂盒排除死细胞 在5激光Cytek Aurora光谱流式细胞仪上采集,使用单染参照对照进行光谱拆分
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
生成用于检测SARS-CoV-2刺突蛋白特异性B细胞的荧光标记抗原探针。
将生物素化的刺突蛋白亚基S1、S2和RBD与荧光标记的链霉亲和素按1:4的摩尔比混合,在4°C孵育60分钟。
获得用于流式染色的有活力的外周血单个核细胞。
在37°C水浴中快速解冻冷冻保存的PBMCs,用冷染色缓冲液洗涤并计数。
通过三步染色和固定,标记死细胞、抗原特异性B细胞及表面标志物。
首先用LIVE/DEAD™可固定蓝死细胞染色试剂盒和FcR阻断试剂孵育;然后加入抗原探针和链霉亲和素诱饵探针进行抗原特异性染色;随后加入抗体混合物进行表面标志物染色;最后用4%多聚甲醛固定。
为光谱流式细胞仪的光谱拆分提供每个荧光素的参照光谱。
使用杀死的PBMCs(热激)和补偿微球(UltraComp eBeads)制备单染对照,包括抗体单染和抗原探针单染。
获得用于后续流式数据分析的原始数据文件。
启动Cytek Aurora,运行QC,设置实验,采集参照对照和样本,导出未混合的fcs文件。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞染色 | LIVE/DEAD™可固定蓝死细胞染色试剂盒 | Thermo Fisher | L23105 |
| FcR阻断试剂 | Miltenyi Biotec | 130-059-901 | |
| 抗原探针制备 | SARS-CoV-2刺突S1-His重组蛋白,生物素化 | Sino Biological | 40591-V08H-B |
| SARS-CoV-2刺突S2 ECD-His重组蛋白,生物素化 | Sino Biological | 40590-V08B-B | |
| SARS-CoV刺突/RBD蛋白(RBD,His标签),生物素化 | Sino Biological | 40150-V08B2-B | |
| PE-Cy5.5链霉亲和素 | Thermo Fisher | SA1018 | |
| AF647链霉亲和素 | Biolegend | 405237 | |
| PE-Cy7链霉亲和素 | Biolegend | 405206 | |
| PE链霉亲和素 | Biolegend | 405203 | |
| BV711链霉亲和素 | Biolegend | 405241 | |
| BV421链霉亲和素 | Biolegend | 405225 | |
| BIO200 - BIO-200生物素溶液 | Avidity | BIO200 | |
| 细胞染色 | Brilliant染色缓冲液 | BD | 566349 |
| 单染对照制备 | UltraComp eBeads™补偿微球 | Thermo Fisher | 01-2222-41 |
| 采集 | SpectroFlo® QC微球 | Cytek Biosciences | SKU |
| 流式采集 | Cytek Aurora光谱流式细胞仪 | Cytek Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 制备抗原探针 | 链霉亲和素与抗原的摩尔比(1:4),各抗原用量(S1: 90 ng,S2: 75 ng,RBD: 33 ng),孵育时间(60分钟)和温度(4°C) 阅读提示:步骤1-3,Table 1 |
| 解冻PBMCs | PBMCs数量(5-10百万),解冻温度(37°C水浴),洗涤条件(600g,8分钟,4°C) 阅读提示:步骤4-7 |
| 细胞染色 | 染色混合液1、2、3的组成及体积,孵育时间(15分钟、60分钟、30分钟)和温度(4°C),固定条件(4% PFA,15分钟,20-25°C) 阅读提示:步骤8-17,Table 2 |
| 单染对照制备 | 杀死PBMCs条件(65°C,10分钟),补偿微球使用,单染抗体及抗原探针的用量(PBMCs 2.5 μL,微球 1 μL) 阅读提示:步骤18-27,Table 3 |
| 采集 | Cytek Aurora启动和QC条件,激光预热时间(>45分钟),QC微球(SpectroFlo® QC Beads),采集阈值(1,000,000事件) 阅读提示:步骤28-31 |