单平台上野生型和奥密克戎变异株SARS-CoV-2核衣壳蛋白的鉴别性电化学生物传感

Discriminative electrochemical biosensing of wildtype and omicron variant of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein with single platform.

作者信息Lokman Liv, Aysu Baş
PMID36100035
发布时间2022-11-15
DOI10.1016/j.ab.2022.114898

实验完整度

包含体外表征(CV、SEM、EDX、XPS)、优化研究、临床样本验证及交叉反应性互换性测试,多个证据层级。

主要模型

鼻咽拭子样本 野生型SARS-CoV-2核衣壳抗原蛋白 奥密克戎变异株SARS-CoV-2核衣壳抗原蛋白

重点核对

用于检测野生型和奥密克戎的鼻咽拭子样本分别有30对和25对(阳性和阴性) 阈值电流增加:野生型1.3 μA,奥密克戎9.1 μA 抗体浓度:20 μg/mL,孵育时间30分钟 抗原孵育时间:45分钟 EDC/NHS比例:野生型6 μL/14 μL,奥密克戎16 μL/4 μL;活化时间1.5小时和30分钟

摘要

通过使用功能化的氧化石墨烯以及野生型和奥密克戎型SARS-CoV-2核衣壳抗体修饰的玻碳电极,制备了用于测定鼻咽拭子样本中野生型和奥密克戎变异株严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)核衣壳抗原的电化学生物传感器。所开发的生物传感器通过循环伏安法、扫描电子显微镜、能量色散X射线光谱和X射线光电子能谱进行表征,能够检测0.76和0.24 ag/mL的野生型和奥密克戎SARS-CoV-2核衣壳抗原蛋白,线性范围分别为1 ag/mL至100 fg/mL和1 ag/mL至10 fg/mL。比较了两种生物传感器在含有野生型和奥密克戎变异株SARS-CoV-2的鼻咽拭子样本中的性能,并评估了它们是否可以互换使用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
能否在同一平台上通过电化学生物传感器区分并检测野生型和奥密克戎变异株的SARS-CoV-2核衣壳蛋白,以及这两种传感器是否可以互换使用?
核心机制
核衣壳抗体与抗原蛋白的相互作用导致电容电流按比例增加,该过程受吸附控制。
主要证据
开发的生物传感器在缓冲液中检测限为0.76和0.24 ag/mL,在临床样本中展现出90%和96%的灵敏度以及87%和92%的特异性,且每种平台能区分野生型和奥密克戎核衣壳蛋白。
研究意义
这是首个在真实样本中同时且区别检测野生型和奥密克戎变异株SARS-CoV-2核衣壳蛋白的电化学比较研究,为其他病毒突变株的检测提供了新方法。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

生物传感平台制备与表征

验证修饰电极表面的成功制备及各步骤的修饰效果。

通过将GO滴涂在GCE上,经EDC/NHS活化,然后固定抗体并用BSA封闭,制备了BSA/wAB/aGO/GCE和BSA/oAB/aGO/GCE,并用CV、SEM、EDX、XPS进行表征。

2

优化研究

确定影响传感器性能的关键参数的最优值。

在1 fg/mL抗原存在下,逐一优化了GO浓度、抗体浓度、EDC/NHS比例、孵育时间等参数。

3

分析性能验证

评估传感器的检测限、线性范围和重复性。

通过SWV测量不同浓度的抗原,建立校准曲线,计算检测限和相对标准偏差。

4

临床样本分析

验证传感器在实际鼻咽拭子样本中的诊断性能。

使用RT-PCR确认的阳性/阴性样本进行检测,设定阈值,计算灵敏度、特异性,并评估交叉反应性。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
玻碳电极BASiMF-2012
氧化石墨烯Sigma-Aldrich796034
N-羟基琥珀酰亚胺Sigma-Aldrich130672
N-(3-二甲氨基丙基)-N'-乙基碳二亚胺盐酸盐Sigma-Aldrich03450
牛血清白蛋白Sigma-Aldrich05470
HiPPR去垢剂去除离心柱试剂盒Thermo Scientific88305
Metrohm Autolab PGSTAT 128 N恒电位仪/恒电流仪Metrohm Autolab--
Ag/AgCl/3 M NaCl参比电极BASiMF-2052
铂丝对电极BASiMW-1032
Biorad CFX Connect实时PCR系统Biorad--
Hitachi Schottky SU5000场发射扫描电子显微镜Hitachi--
FEI牛津仪器7260型能量色散X射线光谱仪FEI Oxford Instruments--
Thermo Fisher K-Alpha X射线光电子能谱仪Thermo Fisher--
Eppendorf protein LoBind管Eppendorf--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
生物传感平台制备
GO浓度、抗体浓度、EDC/NHS比例、孵育时间
阅读提示:材料与方法2.2节
电化学测量
SWV参数(电位范围、步幅、频率、脉冲幅度)、支持电解质、测量环境
阅读提示:材料与方法2.3节
临床样本处理
样本预处理步骤(去垢剂去除)、离心时间、温度
阅读提示:材料与方法2.5节
临床样本分析
样本数量、阈值、灵敏度、特异性、交叉反应性测试
阅读提示:结果与讨论3.4节