AMMECR1基因内缺失的女性携带者的听力损失、腭裂和先天性髋关节发育不良

Hearing loss, cleft palate, and congenital hip dysplasia in female carriers of an intragenic deletion of AMMECR1.

作者信息Saskia Koene, Jeroen Knijnenburg, Mariette J V Hoffer, Fleur Zwanenburg, Monique C Haak, Heiko Locher, Edward S A van Beelen, Gijs W E Santen, Liselotte J C Rotteveel
PMID35084080
发布时间2022-05
DOI10.1002/ajmg.a.62669

实验完整度

包含家系临床表型分析、SNP array、X染色体失活分析和胎儿耳蜗免疫组化,但缺乏功能验证和体内机制验证。

主要模型

人类胎儿内耳组织 X连锁AMMECR1缺失家系

重点核对

AMMECR1基因内缺失的携带状态 纯音听力图结果 X失活模式

摘要

此前,已在六名男性中描述了AMMECR1基因的突变,这些男性表现为发育迟缓、感音神经性听力损失(SNHL)和/或先天性异常,包括胎儿颈部水肿、胎儿心包积液、畸形足、先天性髋关节发育不良、椭圆形红细胞增多症和腭裂。在本报告中,我们报告了一名携带该X连锁基因基因内缺失的男性胎儿的三位女性亲属。这三位女性均报告有听力损失,其中一位出生时患有软腭裂和髋关节发育不良。听力图显示轻至中度SNHL,受影响的频率模式不一。对胎儿耳蜗进行了免疫组织化学分析,证实AMMECR1在人内耳中表达。由于听力损失、腭裂和先天性髋关节发育不良在之前已在男性AMMECR1点突变携带者中有报道,且AMMECR1在胎儿内耳中表达,我们建议女性携带者可能在这种X连锁疾病中表现出部分表型。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
女性携带AMMECR1基因内缺失是否表现出与男性携带者类似的临床表型?
核心机制
AMMECR1缺失导致发育异常,但X连锁疾病中女性携带者因X失活可能表现出部分表型。
主要证据
三位女性携带者均有听力损失,一位有腭裂和髋关节发育不良;胎儿耳蜗免疫组化显示AMMECR1表达;X失活偏斜与表型相关。
研究意义
建议在更大规模的(轻度)SNHL和/或腭裂患者中研究AMMECR1突变和基因内缺失,以评估生殖后果。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

家系遗传分析

确定家系中AMMECR1基因内缺失的携带者

使用SNP array检测到先证者携带基因内缺失,随后对家系成员进行检测,确定三位女性携带者。

2

临床表型评估

描述女性携带者的听力、腭部和髋部表型

对三位女性进行纯音听力图检查,并记录临床病史,包括腭裂和髋关节发育不良。

3

X失活分析

评估X失活模式与表型严重程度的关系

通过检测雄激素受体基因CAG重复的甲基化状态判断X失活模式。

4

胎儿内耳免疫组化

验证AMMECR1在人胎儿内耳中的表达

对W13和W17人胎儿内耳切片进行免疫组化染色,检测AMMECR1表达位置。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证分子表达变化
数据分析与统计

产品清单

实验环节名称品牌货号
Affymetrix CytoScanHD 单核苷酸多态性阵列Affymetrix--
兔抗AMMECR1多克隆抗体Sino Biological#201552-T10
AF488驴抗兔抗体Invitrogen#A-21206
DAPI----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
遗传检测
SNP array检测试剂盒或平台型号
阅读提示:Methods 3.1节
免疫组化
一抗浓度、二抗浓度、孵育时间和温度
阅读提示:Methods 3.3节
X失活分析
CAG重复甲基化检测方法
阅读提示:Methods 3.2节