检测AHI1在抑郁状态下的表达变化
验证抑郁是否导致AHI1表达下调
收集MDD患者和健康对照的PBMCs、巨噬细胞、T/B细胞,以及抑郁模型小鼠的PBMCs、巨噬细胞、肺和肝组织,通过RT-qPCR和Western blot检测AHI1 mRNA和蛋白水平。
Depression compromises antiviral innate immunity via the AVP-AHI1-Tyk2 axis.
包含患者样本、动物模型、细胞模型的多个独立证据层级,并进行了分子机制与功能验证,如免疫共沉淀、泛素化分析、病毒滴度测定等。
人外周血巨噬细胞 小鼠腹膜巨噬细胞 Ahi1基因敲除小鼠 抑郁模型小鼠
AHI1在MDD患者PBMCs和巨噬细胞中的表达水平(RT-qPCR、Western blot) AVP对AHI1表达的抑制作用及AVP受体拮抗剂的影响 AHI1与OTUD1、Tyk2的相互作用及OTUD1对Tyk2去泛素化的调控 美普他酚对AHI1表达的促进作用及对IFN-I抗病毒活性的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证抑郁是否导致AHI1表达下调
收集MDD患者和健康对照的PBMCs、巨噬细胞、T/B细胞,以及抑郁模型小鼠的PBMCs、巨噬细胞、肺和肝组织,通过RT-qPCR和Western blot检测AHI1 mRNA和蛋白水平。
检验AHI1减少是否导致抗病毒能力下降
使用Ahi1+/+和Ahi1−/−小鼠腹膜巨噬细胞感染VSV、H1N1和HSV-1,进行RT-qPCR检测病毒RNA;体内感染VSV后测定病毒滴度、组织病毒水平和病理损伤。
明确AHI1是否调控IFN-I信号通路
比较Ahi1+/+和Ahi1−/−巨噬细胞中IFN-I诱导的ISG表达、STAT1磷酸化、IFN-β产生,以及IFN-I诱导的抗病毒活性。
确定AHI1如何稳定Tyk2蛋白
通过免疫共沉淀、质谱分析、泛素化实验、CHX脉冲追踪,检测AHI1与Tyk2、OTUD1的相互作用,以及OTUD1对Tyk2去泛素化的影响。
证实抑郁相关激素AVP是否诱导AHI1减少
用AVP、ACTH、Dex处理巨噬细胞,检测AHI1和Tyk2水平;使用AVP受体拮抗剂验证;测定MDD患者和抑郁模型小鼠血清AVP浓度;体内注射AVP检测AHI1和ISG表达。
寻找增强AHI1表达以恢复抗病毒免疫的药物
筛选临床药物,发现美普他酚促进AHI1表达,并验证其通过AHI1-Tyk2轴增强IFN-I信号及抗病毒活性,在抑郁模型小鼠体内验证效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | GIBCO | -- | |
| 药物处理 | 美普他酚 | Selleck | -- |
| PR-619 | Selleck | -- | |
| 考尼伐坦 | Selleck | -- | |
| 精氨酸加压素 | Sangon Biotech | -- | |
| 地塞米松 | Sangon Biotech | -- | |
| 促肾上腺皮质激素 | Yuanye Biotechnology | -- | |
| 转染 | LongTrans转染试剂 | Ucallm | TF/07 |
| LipoMax转染试剂 | Sudgen | 32011 | |
| GenePORTER2转染试剂 | Genlantis | T202015 | |
| 核转染仪 | Lonza | VCA-1003 | |
| Western blot | AHI1抗体 | Santa Cruz | sc-515382 |
| Tyk2抗体 | Cell Signaling Technology | 14193 | |
| STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9172 | |
| STAT2抗体 | Cell Signaling Technology | D9J7L | |
| IRF9抗体 | Abcam | ab51639 | |
| IFNAR1抗体 | Sino Biological | 13222-H08H | |
| IFNAR2抗体 | Santa Cruz | sc-137209 | |
| OTUD1抗体 | Abcam | ab122481 | |
| Flag抗体 | Sigma | F7425 | |
| HA抗体 | Abcam | ab9110 | |
| Myc抗体 | Abmart | M20002H | |
| pY701-STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9167 | |
| VSV-G抗体 | Santa Cruz | sc-66180 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 微管蛋白抗体 | Proteintech | 66031-1-Ig | |
| 泛素抗体 | Santa Cruz | sc-8017 | |
| K48-泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 8081 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白G琼脂糖珠 | Millipore | #16-266 |
| 质谱分析 | 银染试剂盒 | Beyotime | P0017S |
| Orbitrap Elite质谱仪 | Thermo Fisher | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | TAKARA | -- |
| SYBR Green Supermix | BIO-RAD | -- | |
| StepOne Plus实时荧光定量PCR系统 | Applied Bioscience | -- | |
| ELISA | AVP ELISA试剂盒(小鼠) | Zhenke Biotechnology | 202107 |
| AVP ELISA试剂盒(人) | Zhenke Biotechnology | ZK-1268 | |
| 报告基因实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | #E1910 |
| 细胞分选 | StemSep™人CD14阳性选择试剂盒 | Stemcell | 14758 |
| 细胞分离 | 淋巴细胞分离液 | Da you, DAKEWE | -- |
| 测序 | BGI测序仪 | BGI | -- |
| 流式细胞术 | PE标记抗IFNAR1抗体 | SinoBiological | 50469-R110-P |
| PE标记抗IFNAR2抗体 | R&D Systems | ABVR0220021 | |
| PerCP-Cy5.5标记抗小鼠Ly6G抗体 | BD Bioscience | 560602 | |
| FITC标记抗小鼠CD11b抗体 | BD Bioscience | 553310 | |
| Alexa Fluor 700标记抗小鼠CD45抗体 | BioLegend | 103128 | |
| FITC标记抗人CD3抗体 | eBioscience | 4312299 | |
| Alexa Fluor 488标记抗人CD19抗体 | Biolegend | 302219 | |
| PerCP-Cy5.5标记抗人CD14抗体 | BD Bioscience | 550708 | |
| BD FACS Canto II流式细胞仪 | BD Bioscience | -- | |
| 转染 | QuickChange Lightning定点突变试剂盒 | Stratagene | 210518 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| AHI1表达检测 | MDD患者和健康对照的样本数量、年龄、性别匹配;抑郁模型小鼠的建立方法(空间限制应激)及周期 阅读提示:Methods: Human samples; Establishment of depression mouse model |
| 病毒感染实验 | 病毒株(VSV、H1N1、HSV-1)、感染复数(MOI)、感染时间;体内感染剂量(PFU/g体重)、给药途径(i.p.) 阅读提示:Methods: Viruses and viral infection in vitro; Viral infection in vivo |
| IFN-I信号检测 | IFN-β/IFN-α浓度(IU/mL)、刺激时间;ISG引物序列 阅读提示:Methods: RT-qPCR; Figure legends 2b, 2e |
| Tyk2稳定性测定 | CHX浓度(μg/mL)、处理时间点;Western blot抗体稀释比例 阅读提示:Methods: Cycloheximide (CHX) pulse chase assay; Figure legend 3f |
| AVP处理 | AVP浓度(μM)、处理时间(24h);AVP受体拮抗剂浓度 阅读提示:Methods: Cell culture and reagents; Figure legend 6a-f |
| 美普他酚处理 | 美普他酚浓度(μM)、处理时间(24h);体内剂量(mg/kg)及给药方式 阅读提示:Methods: Meptazinol and AVP administration in vivo; Figure legends 7a-f, 8a-f |