E3泛素连接酶ARIH1通过诱导cGAS的单ISG化修饰和寡聚化促进抗病毒免疫和自身免疫

The E3 ubiquitin ligase ARIH1 promotes antiviral immunity and autoimmunity by inducing mono-ISGylation and oligomerization of cGAS.

作者信息Tian-Chen Xiong, Ming-Cong Wei, Fang-Xu Li, Miao Shi, Hu Gan, Zhen Tang, Hong-Peng Dong, Tianzi Liuyu, Pu Gao, Bo Zhong, Zhi-Dong Zhang, Dandan Lin
PMID36217001
发布时间2022-10-10
DOI10.1038/s41467-022-33671-5

实验完整度

高

研究包含体外细胞实验(HEK293、THP-1、BMDCs等)、体内动物模型(Cre-ER;Arih1fl/fl和Lyz2-Cre;Arih1fl/fl小鼠、Trex1−/−小鼠)以及机制验证(ISGylation、寡聚化、点突变等),具有多层级证据。

主要模型

HEK293细胞 THP-1细胞 小鼠骨髓来源树突状细胞(BMDCs) Cre-ER;Arih1fl/fl和Lyz2-Cre;Arih1fl/fl小鼠

重点核对

细胞系:HEK293、THP-1、BMDCs、MLFs、cGas−/− MEFs HSV-1感染复数(MOI)和感染时间:如MOI=0.5,感染时间0-8小时 DNA转染剂量:如ISD45、HSV60、DNA90等1μg 小鼠模型:Cre-ER;Arih1fl/fl、Lyz2-Cre;Arih1fl/fl、Trex1−/−小鼠,HSV-1感染剂量(1×10^7 PFU腹腔或1×10^6 PFU颅内) 关键分子:cGAS K187(人)和K173(鼠)位点的ISGylation

摘要

胞质DNA传感器环状GMP-AMP合酶(cGAS)在抗病毒免疫和自身免疫中发挥关键作用。cGAS的活性和稳定性通过翻译后修饰精细调控。在这里,我们显示ariadne RBR E3泛素蛋白连接酶1(ARIH1)催化cGAS的单ISG化修饰并诱导其寡聚化,从而促进抗病毒免疫和自身免疫。敲低或敲除ARIH1显著抑制单纯疱疹病毒1型(HSV-1)或胞质DNA诱导的I型干扰素(IFNs)和促炎细胞因子的表达。一致地,他莫昔芬处理的ER-Cre;Arih1fl/fl小鼠和Lyz2-Cre;Arih1fl/fl小鼠与对照相比对HSV-1感染高度敏感。此外,在髓系细胞中缺失ARIH1减轻自身免疫表型,并完全挽救由TREX1缺陷引起的自身免疫致死性。机制上,HSV-1或胞质DNA诱导的cGAS寡聚化和激活通过其K187残基的ISG化修饰增强,该修饰由ARIH1催化。我们的发现揭示了ARIH1在先天抗病毒和自身免疫反应中的重要作用,并为cGAS的翻译后调控提供了见解。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
ARIH1如何调控cGAS的翻译后修饰及其在抗病毒免疫和自身免疫中的作用?
核心机制
ARIH1催化cGAS在K187(人)或K173(鼠)位点发生单ISG化修饰,解除该位点对cGAS寡聚化的抑制,增强cGAS寡聚化和激活,促进I型干扰素和促炎细胞因子表达。
主要证据
通过酵母双杂交筛选发现ARIH1与cGAS相互作用;敲低/敲除ARIH1减弱HSV-1和DNA诱导的免疫反应;体内小鼠对HSV-1感染敏感性增加;ARIH1催化cGAS单ISG化,K187突变增强cGAS寡聚化和活性。
研究意义
揭示cGAS激活的新调控机制,为病毒感染相关疾病和自身免疫病提供潜在治疗靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

筛选cGAS相互作用E3连接酶

鉴定与cGAS相互作用的E3连接酶,以寻找调控cGAS修饰和功能的因子。

使用酵母双杂交筛选,以pGBT9-cGAS为诱饵,筛选约200个pGADT7-E3构建体,鉴定出ARIH1作为cGAS相互作用蛋白。

2

验证ARIH1与cGAS的相互作用

确认ARIH1与cGAS的特异性结合,并确定相互作用的结构域。

通过共免疫沉淀(co-IP)验证外源和內源相互作用,GST pull-down验证直接相互作用,并通过截短突变体进行结构域定位。

3

敲低/敲除ARIH1对细胞抗病毒反应的影响

评估ARIH1在HSV-1和胞质DNA触发的先天免疫信号通路中的作用。

在THP-1细胞中敲低ARIH1,检测HSV-1或DNA转染诱导的ISG表达和IRF3/TBK1/p65磷酸化;在BMDCs中敲除ARIH1,检测细胞因子表达和HSV-1复制。

4

敲除ARIH1对小鼠HSV-1感染敏感性的影响

评价ARIH1在体内抗病毒免疫中的作用。

使用他莫昔芬诱导的Cre-ER;Arih1fl/fl和Lyz2-Cre;Arih1fl/fl小鼠,腹腔或颅内感染HSV-1,监测存活率、细胞因子产生、病毒载量和组织病理。

5

验证ARIH1的酶活性对抗病毒信号的重要性

确定ARIH1的E3连接酶活性是否是其促进抗病毒免疫所必需的。

在ARIH1缺陷细胞中回补野生型ARIH1或催化失活突变体ARIH1C357S,检测抗病毒反应。

6

检测ARIH1对cGAMP产生和cGAS寡聚化的影响

揭示ARIH1作用机制是否在cGAS水平影响cGAMP产生和寡聚化。

利用cGAMP活性测定评估ARIH1缺陷细胞中DNA转染后cGAMP产生;通过SDD-AGE分析HSV-1感染后cGAS寡聚化。

7

敲除ARIH1对Trex1−/−小鼠自身免疫的影响

评估ARIH1在自身DNA触发的自身免疫中的作用。

在Trex1−/−背景下髓系敲除ARIH1,观察自身免疫表型是否减轻或挽救致死性。

8

验证ARIH1催化cGAS的单ISG化修饰

确定ARIH1是否作为E3连接酶催化cGAS的ISGylation,并鉴定修饰位点。

在HEK293细胞中过表达ARIH1和ISG化系统组分,检测cGAS的ISGylation;体外ISG化实验确认直接催化;通过LC-MS鉴定修饰位点并验证突变。

9

鉴定cGAS ISG化的关键赖氨酸残基及其功能

确定cGAS上ISG化位点对抗病毒反应的影响。

通过LC-MS鉴定cGAS ISG化位点为K187,构建突变体,在细胞和体外实验中验证其对cGAS激活和寡聚化的影响。

10

探究K187位点对cGAS寡聚化和活化的抑制作用

理解ISG化修饰如何通过调节K187影响cGAS功能。

比较野生型cGAS与K187突变体(R、S、D、G、F)在DNA刺激下的寡聚化和活性,确认K187抑制cGAS激活,而ISG化解除此抑制。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基----
胎牛血清----
粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子PeproTech500-P65
巨噬细胞集落刺激因子PeproTech500-P62G
I型胶原酶Worthington--
脱氧核糖核酸酶ISigma-Aldrich--
他莫昔芬SigmaT5648
4-羟基他莫昔芬SigmaH6278
MLN4924MedChemExpressHY-70062
PEI转染试剂Polysciences Inc24765-1
谷胱甘肽-琼脂糖基质Transgen Biotech--
Ni-NTA琼脂糖QIAGEN--
TNT快速偶联转录/翻译系统试剂盒Promega--
TRIzol试剂Life Technologies--
All-in-One cDNA合成SuperMixAidlab Biotechnologies--
SYBR Green快速qPCR预混液Yeasen Biotechnology--
IFN-β ELISA试剂盒Biolegend--
IL-6 ELISA试剂盒Biolegend--
TNF ELISA试剂盒Biolegend--
CCL5 ELISA试剂盒4A Biotech--
UBE1L蛋白Sino Biological11990-H20B
UBCH8蛋白Enzo Life SciencesBML-UW9135
Phusion聚合酶----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞模型
细胞类型:HEK293、THP-1、BMDCs、MLFs、cGas−/− MEFs、L929和HFF细胞;需确认来源和培养条件。
阅读提示:Methods: Cell culture
动物模型
小鼠品系:Cre-ER;Arih1fl/fl和Lyz2-Cre;Arih1fl/fl;他莫昔芬注射剂量和方案(80mg/kg,连续5天);HSV-1感染途径和剂量(腹腔1×10^7 PFU,颅内1×10^6 PFU)。
阅读提示:Methods: Mice, Tamoxifen-mediated deletion, Viral infection
病毒和转染
HSV-1毒株(H129-G4或野生型),MOI和感染时间;dsDNA配体(ISD45, HSV60, DNA90)浓度(1μg);转染试剂PEI使用比例。
阅读提示:Methods: Transfection of DNA ligands, poly(I:C) and cGAMP, Viral infection
蛋白修饰检测
ISGylation检测需共转染UBE1L、UBCH8、ISG15和ARIH1;变性IP洗涤缓冲液成分;体外ISG化反应条件(各组分浓度,37°C 2小时)。
阅读提示:Methods: Denature-IP and ISGylation assays, In vitro ISGylation assay
cGAS寡聚化检测
SDD-AGE凝胶浓度和电泳条件(2%琼脂糖,100V,4°C);体外DNA结合实验使用ISD45(2μM),孵育条件。
阅读提示:Methods: SDD-AGE, Analysis of in vitro oligomerization of cGAS
敲除验证
Arih1fl/+小鼠构建使用CRISPR/Cas9,loxP位点位于第3外显子;Cre品系:Lyz2-Cre、Cre-ER、Trex1+/−;基因分型引物序列。
阅读提示:Methods: Mice, Tamoxifen-mediated deletion