单细胞转录组分析
鉴定脊髓中响应浅表损伤和神经损伤的细胞类型
对SI和SNI小鼠14天后的腰椎脊髓进行Drop-seq单细胞RNA测序,聚类分析鉴定细胞类型并比较细胞比例。
Spinal macrophages resolve nociceptive hypersensitivity after peripheral injury.
包含scRNAseq转录组分析、巨噬细胞耗竭/过表达的功能验证、组织学与行为学评估等多个独立证据层级。
C57Bl/6小鼠 浅表损伤(SI)模型 spared nerve injury(SNI)模型
小鼠品系:3-4月龄雄性C57Bl/6 损伤模型:SNI和SI手术,左侧后肢 巨噬细胞耗竭:鞘内注射甘露糖化脂质体包被氯膦酸盐(Lip-C) CD163过表达:鞘内注射mPEI纳米颗粒包裹Cd163质粒 行为学测试:von Frey机械痛阈和Hargreaves热痛阈
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定脊髓中响应浅表损伤和神经损伤的细胞类型
对SI和SNI小鼠14天后的腰椎脊髓进行Drop-seq单细胞RNA测序,聚类分析鉴定细胞类型并比较细胞比例。
评估损伤后脊髓巨噬细胞数量和增殖的变化
通过免疫组化定量不同时间点MRC1+巨噬细胞数量和EdU掺入。
验证脊髓巨噬细胞在疼痛消退中的作用
在SI动物中鞘内注射甘露糖化脂质体包被氯膦酸盐(Lip-C)耗尽巨噬细胞,检测机械痛阈和小胶质细胞反应。
验证增强脊髓巨噬细胞CD163表达能否缓解神经病理性疼痛
在SNI动物中鞘内注射mPEI纳米颗粒包裹Cd163质粒,检测CD163表达、IL-10水平、胶质增生和疼痛行为。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 组织学 | 山羊多克隆抗MRC1/CD206抗体 | R&D Systems | AF2535 |
| 兔单克隆抗CD163抗体 | Abcam | ab182422 | |
| 兔多克隆抗IBA1抗体 | WAKO | 019-19741 | |
| 鸡多克隆抗GFAP抗体 | Novus Biologicals | NBP1-05198 | |
| 行为测试 | von Frey纤维丝 | -- | -- |
| 足底测试仪 | IITC | -- | |
| 细胞增殖检测 | 5-乙炔基-2‘-脱氧尿苷 | Cayman Chemicals | 20518 |
| 巨噬细胞耗竭 | 甘露糖化巨噬细胞耗竭试剂盒 | Encapsula Nano Sciences | CLD-8914 |
| 巨噬细胞转染 | 体内转染试剂mPEI | Polyplus Transfection | 203-10G |
| 单细胞测序 | Nextera XT DNA文库制备试剂盒 | Illumina | FC-131-1096 |
| 原位杂交 | RNAscope荧光多标记检测试剂盒 | Advanced Cell Diagnostics | 320851 |
| RNAscope探针-Mm-Mrc1-C3 | ACDBio | 437511-C3 | |
| RNAscope探针-Mm-Il10 | ACDBio | 317261 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | 小鼠品系、性别、年龄:3-4月龄雄性C57Bl/6 阅读提示:STAR Methods - Mice and Behavior |
| 手术模型 | SNI手术:结扎并切断腓总神经和腓肠神经;SI手术:仅暴露神经 阅读提示:STAR Methods - Neuropathic pain model |
| 巨噬细胞耗竭 | 鞘内注射Lip-C剂量和方案:10 μL 阅读提示:STAR Methods - Intrathecal injections and dosing |
| CD163过表达 | mPEI-DNA复合物剂量和比例:pDNA总量、N/P比、注射体积 阅读提示:STAR Methods - Intrathecal injections and dosing |
| 行为学测试 | von Frey和热痛测试的设备、刺激时间、测量次数和统计方法 阅读提示:STAR Methods - Mouse Behavior |
| 组织学分析 | 切片厚度、抗体浓度、成像和定量分析参数 阅读提示:STAR Methods - Histology 和 Image analysis/quantification |