检测EZH2抑制剂对HNSCC细胞增殖抑制效果
评估不同EZH2抑制剂对HNSCC细胞系增殖的抑制程度。
用不同浓度的EZH2抑制剂(GSK126、GSK343、EPZ6438)处理多种HNSCC细胞系,通过MTT实验检测细胞活性,计算IC50值。
Targeting epigenetic modulation of cholesterol synthesis as a therapeutic strategy for head and neck squamous cell carcinoma.
结合体外细胞实验、代谢组学、RNA-seq和ChIP-seq等多组学分析,以及异种移植瘤动物模型,涵盖功能验证和机制验证。
CAL27细胞系 HN6细胞系 CAL27异种移植瘤模型 HN6异种移植瘤模型
EZH2抑制剂(EPZ6438)处理浓度和时长 SQLE抑制剂(特比奈芬)给药剂量和联合方案 体外细胞实验的细胞系选择(CAL27、HN6等) 动物实验的给药剂量(EPZ6438 200mg/kg,特比奈芬60mg/kg)和给药方式(口服) 化合物浓度及溶剂对照(如DMSO)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估不同EZH2抑制剂对HNSCC细胞系增殖的抑制程度。
用不同浓度的EZH2抑制剂(GSK126、GSK343、EPZ6438)处理多种HNSCC细胞系,通过MTT实验检测细胞活性,计算IC50值。
揭示EZH2抑制剂对HNSCC细胞转录组和代谢组的影响。
对EPZ6438处理的CAL27细胞进行RNA-seq和非靶向代谢组学分析,鉴定差异表达基因和代谢物,重点分析胆固醇合成通路改变。
验证EZH2是否通过H3K27me3修饰直接调控胆固醇合成基因转录。
使用ChIP-PCR和ChIP-seq检测EZH2抑制剂处理前后H3K27me3在胆固醇合成基因启动子区域的富集变化。
评估EZH2抑制剂和SQLE抑制剂联合使用对细胞增殖的协同效应。
用EZH2抑制剂(EPZ6438)联合SQLE抑制剂(特比奈芬)处理多种HNSCC细胞系,通过MTT、克隆形成、细胞周期和凋亡分析检测细胞增殖变化。
验证联合用药引起的代谢物变化(尤其是角鲨烯积累)是否抑制细胞增殖。
通过外源性补充角鲨烯等代谢物观察克隆形成变化,并通过敲低FDFT1阻断内源性角鲨烯合成,检测细胞对联合用药的反应。
验证EZH2抑制剂与SQLE抑制剂联合用药在体内的抗肿瘤效果及机制。
建立CAL27和HN6细胞异种移植瘤模型,口服给予EPZ6438和特比奈芬,测量肿瘤体积和重量,并分析肿瘤组织中胆固醇合成基因表达、角鲨烯含量和增殖标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM高糖培养基 | Basal Media | L110KJ |
| 胎牛血清 | CellMax | SA311.02 | |
| 青霉素/链霉素 | NCM | C125C5 | |
| 药物处理 | GSK126 | Selleck | S7061 |
| GSK343 | Selleck | S7164 | |
| EPZ6438 | Selleck | S7168 | |
| NB-598 | MCE | HY-16343C | |
| 阿托伐他汀 | MCE | HY-17379 | |
| Ro48-8071 | MCE | HY-18630A | |
| 特比萘芬 | MCE | HY-17395 | |
| 布替萘芬 | MCE | HY-17396 | |
| 代谢物补充 | 胆固醇 | Sigma | C3045 |
| 链甾醇 | Aladdin | H130206 | |
| 角鲨烯 | Sigma | S3626 | |
| 细胞活性检测 | MTT试剂 | Do Jindo | -- |
| 蛋白分析 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| RNA提取 | RNAiso Plus试剂 | TAKARA | -- |
| 反转录 | PrimeScript RT试剂盒 | TAKARA | -- |
| qPCR | TB Green Premix Ex Taq试剂 | TAKARA | -- |
| ChIP | SimpleChIP Plus酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9005S |
| 转染 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen | -- |
| 流式细胞术 | PI/RNase染色缓冲液 | BD Biosciences | 550825 |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 脂质染色 | BODIPY 493/503 | Thermo Fisher | D3922 |
| 酶活性检测 | 角鲨烯单加氧酶活性检测试剂盒 | Haling Biological Technology | GMS50782.1 |
| 显微成像 | AXIO ZEISS显微镜 | ZEISS | -- |
| 蛋白表达 | SQLE表达质粒 | Sino Biological | HG21419-CF |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | HNSCC细胞系的来源和培养条件(如培养基、血清浓度、抗生素浓度) 阅读提示:Methods 细胞培养部分 |
| 药物处理 | EZH2抑制剂(EPZ6438, GSK126, GSK343)和SQLE抑制剂(特比奈芬)的浓度、处理时间及溶剂对照 阅读提示:Methods 细胞生长和存活实验部分 |
| 基因敲低 | siRNA序列和转染试剂(Lipofectamine 3000)的使用条件 阅读提示:Methods RNA干扰和转染部分 |
| 体内实验 | 动物品系(裸鼠)、性别(雄性)、周龄(3周龄)、细胞注射数量、给药剂量和方式 阅读提示:Methods 动物实验部分 |
| 代谢组学 | 样本数量、处理组、检测平台(GC/MS)和数据处理参数 阅读提示:Methods MS分析和GC/MS数据分析部分 |