验证GPR133切割与信号强度的关联
确定WT与不可切割突变体H543R在cAMP信号上的差异
在HEK293T和患者来源GBM细胞中过表达WT或H543R GPR133,通过HTRF测定cAMP水平,并使用ELISA确认表达水平一致。
Functional impact of intramolecular cleavage and dissociation of adhesion G protein-coupled receptor GPR133 (ADGRD1) on canonical signaling.
包含体外细胞模型(HEK293T和患者来源GBM细胞)、亚细胞分离、Western blot、HTRF、ELISA、免疫荧光、融合蛋白系统及功能验证。
HEK293T细胞 患者来源胶质母细胞瘤(GBM)培养细胞 融合蛋白PAR1–GPR133(ΔTN)
GPR133 WT与H543R突变体在HEK293T和GBM细胞中的cAMP信号差异 亚细胞分离验证GPR133在质膜的分布 cycloheximide处理验证蛋白质合成阻断对未切割形式的影响 BFA处理验证ER-高尔基体运输阻断对成熟糖基化的影响 凝血酶诱导的融合蛋白NTF脱落与cAMP水平变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定WT与不可切割突变体H543R在cAMP信号上的差异
在HEK293T和患者来源GBM细胞中过表达WT或H543R GPR133,通过HTRF测定cAMP水平,并使用ELISA确认表达水平一致。
确认WT GPR133是否几乎完全切割,并鉴定切割产物
通过Western blot分析过表达WT或H543R的细胞裂解物,使用抗CTF和抗NTF抗体检测切割产物。
确定切割是否影响受体运输至质膜,并分析糖基化成熟过程
使用亚细胞分离获得细胞质/ER、核/ER/高尔基体和质膜部分,Western blot检测GPR133片段分布,并用糖苷酶处理分析糖基化状态。
证明NTF和CTF在分泌途径中结合,在质膜上解离
通过亲和纯化结合亚细胞分离,比较不同细胞部分中NTF/CTF的比例;检测细胞培养上清中的可溶性NTF,并进行蛋白质半衰期分析。
直接证明NTF解离增加GPR133的经典信号
构建PAR1–GPR133融合蛋白,用凝血酶诱导NTF脱落,通过HTRF检测cAMP水平,并用表面ELISA确认NTF脱落。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Accutase | Innovative Cell Technologies | AT104 |
| 多聚-L-鸟氨酸 | Sigma | P4957 | |
| 层粘连蛋白 | Thermo Fisher | 23017015 | |
| Neurobasal培养基 | Gibco | 21103049 | |
| N2添加剂 | Gibco | 17-502-049 | |
| B27添加剂 | Gibco | 12587010 | |
| 非必需氨基酸 | Gibco | 11140050 | |
| GlutaMax添加剂 | Gibco | 35050061 | |
| 表皮生长因子 | R&D | 236-EG-01M | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | R&D | 233-FB-01M | |
| DMEM培养基 | Gibco | 11965-118 | |
| 胎牛血清 | Peak Serum | PS-FB2 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668-019 |
| Lipofectamine 2000 Stem转染试剂 | Thermo Fisher | STEM00008 | |
| 信号检测 | cAMP Gs动态检测试剂盒 | CisBio | 62AM4PEC |
| FlexStation 3多功能酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| Bright-Glo荧光素酶检测系统 | Promega | E2650 | |
| BioTek Synergy H1酶标仪 | BioTek | -- | |
| 蛋白质分析 | RIPA裂解缓冲液 | Thermo | 89900 |
| Halt蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo | 78429 | |
| 正十二烷基-β-D-麦芽糖苷 | Thermo | BN2005 | |
| DC蛋白定量试剂盒II | Bio-Rad | 5000112 | |
| Laemmli缓冲液 | Bio-Rad | 1610747 | |
| 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | 1620112 | |
| iBright FL1000成像系统 | Invitrogen | -- | |
| ImageJ软件 | -- | -- | |
| 亚细胞分离 | 质膜提取试剂盒 | Abcam | ab65400 |
| Bioruptor水浴超声仪 | Diagenode | UCD-300 | |
| 去糖基化 | 蛋白质去糖基化混合物II | NEB | P6044 |
| 内切糖苷酶Hf | NEB | P0703 | |
| 亲和纯化 | Strep-Tactin琼脂糖树脂 | IBA | 2-1201-002 |
| Buffer W洗液 | IBA | 2-1003-100 | |
| BioLock生物素阻断液 | IBA | 2-0205-250 | |
| Buffer E洗脱液 | IBA | 2-1000-025 | |
| 脱硫生物素 | IBA | 2-1000-001 | |
| 药物处理 | 布雷菲德菌素A溶液 | Invitrogen | 00-4506-51 |
| 3-异丁基-1-甲基黄嘌呤 | Sigma-Aldrich | I7018-100MG | |
| 免疫荧光 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | -- | -- |
| Zeiss LSM700共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| ELISA | TMB稳定显色底物 | Thermo Fisher | SB02 |
| 终止液 | Thermo Fisher | SS04 | |
| 质粒构建 | pLVX-EF1alpha-mCherry-N1载体 | Takara | 631986 |
| 凝血酶受体cDNA ORF克隆 | Sino Biological | HG13535-NM | |
| 信号检测 | 凝血酶 | Sigma-Aldrich | T9326-150UN |
| 蛋白质分析 | 抗GPR133-CTF抗体 | Sigma-Aldrich | HPA042395 |
| 抗GPR133-NTF抗体 | 不适用 | 克隆8E3E8 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Thermo Fisher | AM4302 | |
| 抗GAPDH抗体 | Thermo Fisher | PA1-9046 | |
| 抗mCherry抗体 | Abcam | ab205402 | |
| 抗钙联蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2433S | |
| 抗钙网蛋白抗体 | Abcam | ab92516 | |
| 抗GM130抗体 | Abcam | ab52649 | |
| 抗泛钙黏蛋白抗体 | Abcam | ab51034 | |
| 抗组蛋白H2A抗体 | Cell Signaling Technology | 3636S | |
| 抗ATP1A3抗体 | Thermo Fisher | MA3-915 | |
| 抗Myc标签抗体 | Cell Signaling | 2276S | |
| 抗FLAG标签抗体 | Sigma-Aldrich | F7425 | |
| 抗HA标签抗体 | Sigma-Aldrich | H3663 | |
| 二抗 | Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 患者来源GBM细胞的培养条件(培养基、基质、氧浓度) 阅读提示:Experimental procedures - Cell culture |
| 信号检测 | cAMP检测的细胞密度、IBMX浓度和孵育时间 阅读提示:Experimental procedures - HTRF signaling assays |
| 蛋白质分析 | Western blot裂解缓冲液、样品处理和抗体 阅读提示:Experimental procedures - Western blot analysis |
| 亚细胞分离 | 亚细胞分离试剂盒和方法 阅读提示:Experimental procedures - Subcellular fractionation |
| 药物处理 | cycloheximide和BFA的浓度及处理时间 阅读提示:Experimental procedures - Chemical drug treatments |