临床样本中HMGB1表达与预后相关性分析
评估HMGB1在前列腺癌组织中的表达水平及其与临床病理特征和生化复发无进展生存的关系。
使用免疫组化检测BPH、低、中、高风险PCa及癌旁正常组织中的HMGB1表达,统计分析其与病理分期、Gleason评分、神经周围侵犯等的关系,并通过Kaplan-Meier分析评估BCR-free survival。
HMGB1 promotes tumor progression and invasion through HMGB1/TNFR1/NF-κB axis in castration-resistant prostate cancer.
包含患者组织样本的免疫组化分析、细胞系功能实验(增殖、侵袭、细胞周期)、机制验证(蛋白质芯片、Co-IP、过表达回补)等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
前列腺癌患者组织样本(含BPH及低、中、高风险PCa) 前列腺癌细胞系DU145、PC3 正常前列腺上皮细胞系RWPE-1 HEK293细胞(用于Co-IP)
HMGB1表达水平与PCa风险及生化复发无进展生存的相关性(韩国队列,n=127) siRNA介导的HMGB1敲低效率及对细胞增殖和侵袭的影响(DU145和PC3) HMGB1敲低后NF-κB通路蛋白(p65、IKK-β)的变化(蛋白质芯片和Western blot) HMGB1与TNFR1的物理相互作用(Co-IP实验) TNFR1过表达对HMGB1敲低效应的逆转作用(p65表达和细胞增殖)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估HMGB1在前列腺癌组织中的表达水平及其与临床病理特征和生化复发无进展生存的关系。
使用免疫组化检测BPH、低、中、高风险PCa及癌旁正常组织中的HMGB1表达,统计分析其与病理分期、Gleason评分、神经周围侵犯等的关系,并通过Kaplan-Meier分析评估BCR-free survival。
验证HMGB1在前列腺癌细胞系中的表达是否高于正常前列腺上皮细胞。
通过Western blot检测RWPE-1、LNCaP、DU145和PC3细胞中HMGB1蛋白水平。
验证抑制HMGB1表达是否影响前列腺癌细胞的增殖和侵袭能力。
使用siRNA和esiRNA敲低DU145和PC3细胞中HMGB1表达,通过EZ-CYTOX assay检测细胞活力,Transwell实验检测侵袭能力,流式细胞术检测细胞周期。
探究HMGB1是否参与调控前列腺癌细胞中的NF-κB信号通路。
使用人类NF-κB通路蛋白质芯片检测HMGB1敲低后通路相关蛋白的变化,并通过Western blot验证关键蛋白p65和IKK-β的表达。
确定HMGB1与哪种TNFR受体发生物理相互作用。
在HEK293细胞中共转染Flag-HMGB1及HA-TNFR1、TNFR3、TNFR5质粒,进行Co-IP实验检测HMGB1与TNFR的结合。
验证HMGB1是否通过TNFR1发挥其促进细胞增殖和NF-κB活化的作用。
在DU145和PC3细胞中共同转染HMGB1 siRNA和TNFR1表达质粒,检测p65表达变化和细胞增殖。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 抗HMGB1抗体 | Abcam | -- |
| HRP标记的二抗 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 角质细胞无血清培养基 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | -- |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 表皮生长因子 | -- | -- | |
| 牛垂体提取物 | -- | -- | |
| 转染 | HMGB1 siRNA | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 对照siRNA | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| 人HMGB1 esiRNA | Sigma-Aldrich | -- | |
| 对照esiRNA | Sigma-Aldrich | -- | |
| Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- | |
| Lipofectamine 3000 | Invitrogen | -- | |
| 人HMGB1-Flag质粒 | Sino Biological | HG10326-CF | |
| TNFR1-HA质粒 | Sino Biological | HG10872-CY | |
| TNFR3-HA质粒 | Sino Biological | HG10581-CY | |
| TNFR5-HA质粒 | Sino Biological | HG10872-CY | |
| pCMV3阴性对照 | Sino Biological | CV013 | |
| 细胞活力检测 | EZ-CYTOX试剂盒 | Daeil Lab Service | -- |
| 细胞侵袭实验 | Matrigel基质胶 | Corning | -- |
| Transwell小室(8 µm) | Corning | -- | |
| 结晶紫溶液 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| 核糖核酸酶 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Cell Signaling Technology | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | -- | -- | |
| BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 抗ERK抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗Akt抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗磷酸化Akt抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗Ikkβ抗体 | Abcam | -- | |
| 抗cleaved-caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗p65抗体 | Abcam | -- | |
| 抗β-actin抗体 | Santa Cruz | -- | |
| HRP标记的二抗 | -- | -- | |
| 化学发光试剂 | Amersham | -- | |
| RT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript™ RT试剂盒 | Takara Bio | -- | |
| Gel Doc XR+凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 蛋白质芯片 | Proteome Profiler™ 人NF-κB通路芯片 | R&D Systems | -- |
| 免疫共沉淀 | Dynabead Protein G磁珠 | Invitrogen | -- |
| 抗Flag抗体 | Abcam | -- | |
| 抗HA抗体 | Abcam | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本收集与分组 | 样本来源:韩国前列腺银行,BPH(n=28),低危PCa(n=22),中危PCa(n=41),高危PCa(n=36),分组标准NCCN风险分组;随访时间中位38个月(6-55个月)。 阅读提示:Methods: Patient samples |
| 免疫组化 | HMGB1抗体浓度(文中未明确说明),染色条件(4°C过夜),二抗浓度(未明确),HMGB1阳性面积定量方法。 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry; Figure 1 legend |
| 细胞培养 | 细胞系来源:RWPE1(ATCC),DU145、PC3、LNCaP、HEK293(韩国细胞库);培养基和添加剂(浓度);培养条件(37°C, 5% CO2)。 阅读提示:Methods: Cell lines and culture |
| 转染 | siRNA和esiRNA序列(未提供),转染试剂(Lipofectamine 2000/3000),质粒用量(未明确)。 阅读提示:Methods: Transfection |
| 细胞活力测定 | 细胞接种密度:DU145 8×10^3/孔,PC3 1×10^4/孔;检测时间点:0,24,48,72小时;EZ-CYTOX试剂用量(未明确)。 阅读提示:Methods: Cell viability |
| 细胞侵袭实验 | 细胞密度5×10^4/孔;Matrigel浓度25 µg/ml;下室20% FBS;孵育48小时;结晶紫染色及570nm比色。 阅读提示:Methods: Cell invasion assay |
| 细胞周期分析 | PI浓度10 µg/ml;RNase浓度10 mg/ml;染色时间30分钟;FACS分析仪器(BD FACS Canto II)。 阅读提示:Methods: Flow cytometry; Figure 2E legend |
| Western blot | 蛋白裂解:RIPA缓冲液和蛋白酶抑制剂;抗体浓度(未明确);二抗浓度(未明确);化学发光检测条件。 阅读提示:Methods: Western blotting |
| RT-PCR | RNA提取:TRIzol;RT试剂盒:PrimeScript RT;PCR引物序列见表1;PCR循环条件(未提供)。 阅读提示:Methods: Reverse transcription-polymerase chain reaction; Table 1 |
| 蛋白质芯片 | 样本用量500 µg;孵育条件4°C过夜;检测抗体混合物和链霉亲和素-HRP浓度(未明确);膜曝光时间(未明确)。 阅读提示:Methods: Proteome profiling |
| 免疫共沉淀 | 质粒转染量(未明确);细胞裂解液量(未明确);抗体偶联磁珠用量(未明确);洗脱和上样缓冲液。 阅读提示:Methods: Co-immunoprecipitation |
| 统计分析 | 统计软件:GraphPad Prism v5和SPSS 24.0;检验方法:t检验、单因素方差分析和卡方检验;生存分析:Kaplan-Meier和对数秩检验;显著性水平P<0.05。 阅读提示:Methods: Statistical analysis |