AT2细胞的分离、培养与鉴定
获取原代AT2细胞并确认其纯度,用于后续牵张实验。
从140只新生小鼠肺组织中分离AT2细胞,通过差速贴壁法纯化,并利用形态学和免疫荧光(LAMP和ABCA3)鉴定。
SOX11 and FAK participate in the stretch‑induced mechanical injury to alveolar type 2 epithelial cells.
文献包含多个证据层级:体外原代AT2细胞模型、细胞功能实验(迁移、粘附、侵袭、凋亡)、分子机制验证(RT-qPCR、Western blot、Co-IP、荧光素酶报告实验)以及SOX11过表达/敲低和FAK拮抗的功能验证。
原代培养的小鼠肺泡2型上皮(AT2)细胞 293T细胞(用于荧光素酶报告实验)
细胞牵张(CS)参数:频率0.5 Hz,时间比1:1,振幅20%,30次/分钟,持续4小时 SOX11过表达质粒浓度:50 nM,转染后72小时进行CS;siRNA浓度:40 nM FAK拮抗剂PF562271浓度:1.5 mM,溶解于DMSO AT2细胞分离:140只新生小鼠,经3%戊巴比妥钠(150 mg/kg)处死,胰蛋白酶和胶原酶I消化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取原代AT2细胞并确认其纯度,用于后续牵张实验。
从140只新生小鼠肺组织中分离AT2细胞,通过差速贴壁法纯化,并利用形态学和免疫荧光(LAMP和ABCA3)鉴定。
模拟呼吸机导致肺泡过度牵张的剪切力,观察其对AT2细胞的影响。
使用Flexercell FX-4000T细胞牵张系统对AT2细胞施加周期性牵张(振幅20%,频率0.5Hz,持续4小时)。
验证SOX11在CS诱导的AT2细胞损伤中的功能作用。
通过转染SOX11质粒或siRNA分别实现SOX11过表达或敲低,随后进行CS处理。
验证FAK是否为SOX11下游效应分子。
在SOX11过表达的基础上,加入FAK拮抗剂PF562271处理,观察对SOX11保护作用的影响。
评估CS及各处理对AT2细胞迁移、粘附、侵袭和凋亡的影响。
通过划痕愈合实验、细胞粘附实验、Transwell侵袭实验和流式细胞术分别检测迁移、粘附、侵袭和凋亡。
分析CS及SOX11改变对SOX11、FAK、Akt、caspase-3/8、p65、MMP7表达的影响。
使用RT-qPCR检测SOX11和FAK mRNA水平,使用Western blot检测各蛋白水平。
验证SOX11与FAK之间的物理结合及转录调控。
通过Co-IP验证SOX11与FAK结合,通过荧光素酶报告实验验证SOX11对FAK启动子的转录激活。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞牵张 | Flexercell FX-4000T细胞牵张系统 | Flexcell International | -- |
| FAK拮抗剂处理 | PF562271 | Glpbio Technology, Inc. | GC12174 |
| SOX11过表达 | poly plus转染试剂 | Polyplus-transfection SA | -- |
| SOX11敲低 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Gemini Bio Products | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 细胞粘附实验 | 纤连蛋白 | -- | -- |
| WST-1检测试剂盒 | Roche Diagnostics | -- | |
| 细胞侵袭实验 | 基质胶 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 结晶紫 | Biotopped | 548-82-9 | |
| Transwell小室 | Corning Co. | -- | |
| 凋亡检测 | 膜联蛋白V-FITC | Bio-Rad Laboratories, Inc. | -- |
| 碘化丙啶 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | -- | |
| FACScan流式细胞仪 | Cyto-Flex Beckman | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy试剂盒 | Qiagen, Inc. | -- |
| SuperScript | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| RT-qPCR系统 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | K2622 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | EMD Millipore | -- | |
| SOX11抗体 | Cusabio | CSB-PA899716 | |
| FAK抗体 | Abcam | ab40794 | |
| caspase-3抗体 | Affinity Biosciences | AF6311 | |
| caspase-8抗体 | Affinity Biosciences | AF6442 | |
| Akt抗体 | Affinity Biosciences | AF6261 | |
| 磷酸化Akt抗体 | Epitomics; Abcam | 1085-1 | |
| MMP7抗体 | ABclonal Biotech Co., Ltd. | A0695 | |
| p65抗体 | GeneTex | GTX61793 | |
| β-actin抗体 | ABclonal Biotech Co., Ltd. | AC026 | |
| 抗兔IgG | KPL, Inc. | 074-1506 | |
| 抗小鼠IgG | Sino Biological Inc. | H013FE2708 | |
| Western Bright ECL试剂盒 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | -- | |
| AlphaImager 2200成像系统 | Alpha Technologies | -- | |
| Co-IP | SOX11抗体(ab170916) | Abcam | ab170916 |
| 蛋白A琼脂糖珠 | EMD Millipore | IP05 | |
| 荧光素酶实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega Corporation | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞牵张(CS) | 牵张参数:振幅20%,频率0.5 Hz,时间比1:1,循环每分钟30次,持续4小时 阅读提示:Methods: CS部分 |
| AT2细胞分离 | 小鼠数量和年龄,麻醉剂量,消化酶浓度和时间 阅读提示:Methods: AT2 cell isolation and culture |
| SOX11过表达/敲低 | 质粒/siRNA浓度,转染试剂,转染后时间(72小时) 阅读提示:Methods: SOX11 overexpression and knockdown |
| FAK拮抗剂处理 | FAK抑制剂浓度(1.5 mM)和溶解溶剂(DMSO) 阅读提示:Methods: Experimental grouping and protocols |
| 细胞功能检测 | 划痕愈合时间(72小时),粘附细胞数(50,000/孔),侵袭时间(36小时),凋亡染色抗体用量 阅读提示:Methods: Wound healing assay, Cell adhesion assay, Cell invasion experiments, Apoptosis assay |
| 分子表达检测 | 上样蛋白量(20 μg),抗体稀释比例,内参(β-actin) 阅读提示:Methods: Western blot analysis, RT-qPCR |
| Co-IP | 抗体使用,孵育时间,洗涤次数 阅读提示:Methods: Co-immunoprecipitation |
| 荧光素酶实验 | 共转染质粒组合,转染试剂,检测时间点(48小时) 阅读提示:Methods: Luciferase assay |