检测 PTPσ 和 PTPδ 对 Nrxn 介导突触形成的作用
确定 LAR-RPTPs 是否作为 Nrxn 的共受体,影响其突触前组装活性。
在大鼠海马神经元中敲低 PTPσ、PTPδ 或 Nrxn1/2/3,通过异源突触形成实验检测 Nlgn1 或 Slitrk6 诱导的 VGLUT1 和 GAD67 聚集,同时使用 PTPσ 条件敲除小鼠神经元进行验证。
LAR-RPTPs Directly Interact with Neurexins to Coordinate Bidirectional Assembly of Molecular Machineries.
包含分子相互作用测定、细胞表面结合实验、异源突触形成实验、小鼠原代神经元培养及果蝇体内遗传学分析,并包含功能、机制和体内验证。
原代培养的海马神经元 PTPσ 条件敲除小鼠神经元 HEK293T 细胞 果蝇 Dlar 和 Dnrx 突变体幼虫
PTPσ 或 PTPδ 敲低对 Nrxn 介导突触形成的影响 Nrxn1α 与 PTPσ 的 HS 依赖性结合及其剪接调控 Nrxn1α 对 PTPσ 诱导兴奋性突触后分化的抑制作用 Dlar 和 Dnrx 在果蝇 NMJ 上的上位相互作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定 LAR-RPTPs 是否作为 Nrxn 的共受体,影响其突触前组装活性。
在大鼠海马神经元中敲低 PTPσ、PTPδ 或 Nrxn1/2/3,通过异源突触形成实验检测 Nlgn1 或 Slitrk6 诱导的 VGLUT1 和 GAD67 聚集,同时使用 PTPσ 条件敲除小鼠神经元进行验证。
确定哪些突触前胞内蛋白分别或共同参与 Nrxn 和 LAR-RPTP 介导的突触前组装。
针对突触前支架蛋白、信号蛋白和细胞骨架调节因子设计 shRNA,敲低后通过异源突触形成实验检测 Nlgn1 或 Slitrk6 诱导的 VGLUT1 和 GAD67 聚集,并用抗性基因回补实验验证特异性。
测试 Nrxn1 与 PTPσ 等 LAR-RPTP 是否直接结合,并解析其亲和力。
使用细胞表面结合实验、pulldown 实验和共免疫沉淀实验,检测 Ig-Nrxn1 融合蛋白与表达 PTPσ 或 PTPδ 的细胞结合,并计算 Kd 值。
确定硫酸乙酰肝素 (HS) 链是否参与 PTPσ 与 Nrxn1 的结合及功能。
使用 PTPσ 的 HS 结合缺陷突变体 (AAAA) 和 Nrxn1 的 HS 位点突变体 (ΔHS),进行细胞表面结合、pulldown 和异源突触形成实验。
测试 Nrxn1α 是否影响 PTPσ 诱导的突触后分化,并区分兴奋性和抑制性突触。
将表达 PTPσ 剪接变体或共表达 Nrxn1α WT 或 ΔHS 的 HEK293T 细胞与海马神经元共培养,检测 SHANK、GluA1 和 GABAAγ2 的聚集,同时使用 PTPσ 条件敲除神经元验证维持作用。
在体内模型果蝇中,验证 LAR-RPTP 和 Nrxn 的同源物在突触形成和功能中的作用。
使用 Dlar 和 Dnrx 突变体及 transheterozygous,分析 NMJ 的突触末梢数量、突触电流和配对脉冲比,并检测 CSP 蛋白水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM 培养基 | WELGENE | -- |
| 胎牛血清 | Welgene | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 表面生物素化实验 | 磺基-NHS-LC-生物素 | Pierce | -- |
| 链霉亲和素琼脂糖珠 | Pierce | -- | |
| 细胞表面结合实验 | 蛋白 A 琼脂糖珠 | GE Healthcare | -- |
| 亲和力测量 | TMB 底物 | Bio-Rad | -- |
| qRT-PCR | FuGene-6 转染试剂 | Roche Diagnostics | -- |
| 共免疫沉淀 | 蛋白 A 琼脂糖 | Incospharm | -- |
| 成像 | 激光共聚焦显微镜 LSM800 | Carl Zeiss | -- |
| 激光共聚焦显微镜 LSM780 | Carl Zeiss | -- | |
| LSM 700 激光共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 电生理记录 | GeneClamp 500 放大器 | Molecular Devices | -- |
| Axoscope 10.3 | Molecular Devices | -- | |
| 数据分析 | GraphPad Prism7.0 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 异源突触形成实验 | 共培养时间(6、12、24、48、72小时),shRNA 敲低效率,PTPσ 条件敲除使用 ΔCre 和 Cre 重组酶 阅读提示:Methods: Heterologous synapse-formation assays; Figure 1 legend |
| 细胞表面结合实验和亲和力测定 | Ig-Nrxn1 融合蛋白浓度(10 μg/ml),结合时间(2小时),PTPσ 剪接变体,Kd 值(Nrxn1α 31.25 nM) 阅读提示:Methods: Cell-surface binding assays; Affinity measurement; Figure 6 legend |
| 蛋白质相互作用验证 | pulldown 使用裂解液或脑 P2 组分,共免疫沉淀使用 P42 小鼠脑,抗体(anti-PTPσ,anti-Nrxn1) 阅读提示:Methods: Pulldown assays; Coimmunoprecipitation assays; Figure 6 legend |
| HS 突变体实验 | PTPσ AAAA 和 Nrxn1 ΔHS 突变体,细胞表面结合实验和异源突触形成实验中的共培养时间 阅读提示:Results: HS chains attached to PTPσ and Nrxn1...; Figure 9, 11 legends |
| 果蝇 NMJ 实验 | 突变体品系(Dlar5.5, DnrxΔ83, Df(2L)E55),幼虫龄期(三龄),NMJ 节段(6/7),Ca2+ 浓度(2 mM),刺激强度 阅读提示:Methods: Drosophila stocks; Immunohistochemistry and imaging of Drosophila larval neuromuscular junction; Drosophila NMJ recordings; Figure 14 legend |