临床样本分析
评估SLE患者和健康对照中CD8CD38high T细胞的频率,并分析其与感染事件和疾病活动度的关联。
通过流式细胞术检测外周血CD4和CD8 T细胞中CD38的表达,并根据CD38表达将患者分为CD8CD38high和CD8CD38low两组,回顾性记录感染事件,分析CD38与感染的关系。
The CD38/NAD/SIRTUIN1/EZH2 Axis Mitigates Cytotoxic CD8 T Cell Function and Identifies Patients with SLE Prone to Infections.
包含患者样本、细胞系、原代细胞实验;涉及功能验证(细胞毒性、脱粒)和机制验证(NAD+、SIRT1/EZH2通路、ATAC-seq)等。
SLE患者外周血CD8 T细胞 健康供者CD8 T细胞 Jurkat细胞系(CD38KO和CD38WT) TALL104细胞系
患者感染事件的记录(6个月内)及CD8CD38high百分比阈值28.4% CD8 T细胞脱粒(CD107a)检测和细胞毒性实验(P815靶细胞) NAD+水平测量和乙酰化EZH2检测 EZH2抑制剂GSK126处理后细胞毒性恢复效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估SLE患者和健康对照中CD8CD38high T细胞的频率,并分析其与感染事件和疾病活动度的关联。
通过流式细胞术检测外周血CD4和CD8 T细胞中CD38的表达,并根据CD38表达将患者分为CD8CD38high和CD8CD38low两组,回顾性记录感染事件,分析CD38与感染的关系。
验证CD8CD38high T细胞是否具有较差的细胞毒性功能。
通过流式细胞术检测CD8CD38low和CD8CD38high T细胞的脱粒能力(CD107a表达)和细胞毒性(与P815靶细胞共培养),并比较细胞毒性分子和转录因子的表达。
阐明CD38通过NAD+/Sirtuin1/EZH2轴调控CD8 T细胞细胞毒性的分子机制。
测量CD8CD38high和CD8CD38low T细胞中NAD+水平,检测蛋白乙酰化水平,通过免疫共沉淀检测EZH2乙酰化,并利用CD38KO Jurkat细胞或SIRT1抑制剂研究CD38对SIRT1/EZH2的影响。
探究抑制EZH2是否能恢复CD8CD38high T细胞的细胞毒性功能。
使用EZH2抑制剂GSK126处理CD8 T细胞,检测RUNX3表达、脱粒能力和细胞毒性分子的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 流式分析 | CD38抗体(PE/Cy7抗人CD38) | Biolegend | 303516 |
| CD107a抗体(PE抗人CD107a) | Biolegend | 328608 | |
| 蛋白质检测 | 抗乙酰赖氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | 9441S |
| 抗EZH2抗体 | Cell Signaling Technology | 3147S | |
| 药物处理 | GSK126 | Cayman Chemical | 15415 |
| EX527 | Sigma-Aldrich | E7034 | |
| NAD+测量 | NAD+/NADH定量试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK037-1KT |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | SLE患者和健康对照的CD38表达,感染事件的定义和记录时间窗口 阅读提示:Methods部分“Human samples”和“RESULTS”第一段 |
| 细胞功能检测 | 脱粒实验的刺激条件(CD3/CD28抗体浓度、刺激时间),细胞毒性实验的靶细胞(P815)和效应靶比例 阅读提示:Methods部分“Degranulation assay”和“In vitro cytotoxicity assay” |
| 机制探究 | NAD+测量方法(细胞数、试剂盒),SIRT1抑制剂EX527浓度和孵育时间,EZH2乙酰化检测(IP和WB) 阅读提示:Methods部分“Western blotting, Immunoprecipitation, and NAD+ measurements”和“Inhibitors” |
| ATAC-seq | CD8CD38low和high细胞分选后的细胞数(50000),测序平台和读长,差异分析参数(FDR < 0.05, |log2FC| > 1) 阅读提示:Methods部分“Omni-ATAC-seq” |