iPSC分化为cINs和谷氨酸能神经元
获得高纯度的发育中皮层中间神经元和谷氨酸能神经元,用于研究疾病相关细胞类型。
按照既定方案从健康对照和精神分裂症患者的iPSCs分化cINs和谷氨酸能神经元,并通过免疫细胞化学和细胞计数验证细胞身份和纯度。
Activated microglia cause metabolic disruptions in developmental cortical interneurons that persist in interneurons from individuals with schizophrenia
包含iPSC分化模型、小胶质细胞共培养、转录组分析、Seahorse线粒体功能检测、形态学和突触分析、GABA释放检测以及基因过表达/敲低功能验证等多个独立证据层级。
iPSC来源的皮层中间神经元(cINs) iPSC来源的谷氨酸能神经元 小鼠小胶质细胞系BV2 人胎小胶质细胞系HMC3
共培养或条件培养基中小胶质细胞的激活状态(LPS和polyI:C处理) SCZ和HC iPSC系的来源及分化批次 Seahorse分析中的细胞密度和测定条件(如基础呼吸、最大呼吸) CTGF和THBS1的过表达和敲低验证 延迟期实验中去除条件培养基后的培养时间(7天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得高纯度的发育中皮层中间神经元和谷氨酸能神经元,用于研究疾病相关细胞类型。
按照既定方案从健康对照和精神分裂症患者的iPSCs分化cINs和谷氨酸能神经元,并通过免疫细胞化学和细胞计数验证细胞身份和纯度。
模拟胎儿脑中的炎症环境,研究其对cINs的影响。
用LPS和polyI:C处理小胶质细胞(BV2或HMC3),通过transwell小室共培养或转移条件培养基处理cINs,然后进行转录组和功能分析。
无偏地鉴定激活小胶质细胞引起的cINs基因表达变化。
提取RNA进行RNA-seq,分析差异表达基因和通路富集。
评估cINs的线粒体功能是否受损。
使用Seahorse XFp8分析仪测量基础呼吸、最大呼吸、ATP产生和糖酵解。
评估cINs的树突分支和突触形成是否受损。
通过GFP慢病毒感染标记cINs,使用ImageJ分析树突分支;通过免疫染色和Imaris软件分析抑制性突触。
评估激活小胶质细胞处理后cINs的突触GABA释放是否受影响。
用高钾刺激cINs,通过ELISA检测培养上清中的GABA释放量,并用TTX处理确定动作电位依赖性释放。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Matrigel | BD | -- |
| Essential 8培养基 | Invitrogen | -- | |
| 细胞分化 | LDN193189 | Stemgent | -- |
| SB431542 | Tocris Cookson | -- | |
| IWP2 | EMD Millipore | -- | |
| SAG | EMD Millipore | -- | |
| FGF8 | Peprotech | -- | |
| GDNF | Peprotech | -- | |
| BDNF | Peprotech | -- | |
| 小胶质细胞激活 | 脂多糖 | Sigma | -- |
| 聚肌胞苷酸 | Sigma | -- | |
| ELISA | 小鼠IL-1β DuoSet ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| 人IL-6 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| qPCR | QuantStudio 3实时PCR系统 | ThermoFisher | -- |
| RNA-seq | TruSeq链式HT或LT mRNA试剂盒 | Illumina | -- |
| NextSeq 550 | Illumina | -- | |
| Seahorse | Seahorse XFp8分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent | -- | |
| 转染 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences, Inc. | -- |
| pMax-GFP | Lonza | -- | |
| 过表达 | CTGF表达载体 | Sino Biological | HG13612-NF |
| THBS1表达载体 | Sino Biological | HG10508-NF | |
| 敲低 | CTGF siRNA | ThermoFisher | 4390824 |
| THBS1 siRNA | ThermoFisher | 4392420 | |
| 阴性对照siRNA | Ambion | 4611G | |
| Western blot | 一抗 | -- | -- |
| ELISA | 人GABA ELISA试剂盒 | BioVision | -- |
| 突触分析 | Imaris软件 | Bitplane | -- |
| 细胞培养 | HMC3细胞系 | ATCC | CRL-3304 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| iPSC分化为cINs和谷氨酸能神经元 | 所用iPSC系的数量、来源和基因型(HC/SCZ),分化方案中的因子浓度和持续时间,以及cINs的成熟程度(分化天数)。 阅读提示:Methods部分“Differentiation of iPSCs and microglia coculture”和“Extended Data Fig.1B” |
| 小胶质细胞激活与共培养 | 小胶质细胞类型(BV2或HMC3),激活剂LPS和polyI:C的浓度及处理时间,共培养或条件培养基的制备方法,以及处理持续时间(急性期和延迟期)。 阅读提示:Methods部分“Differentiation of iPSCs and microglia coculture” |
| 转录组分析 | RNA-seq的建库方法、测序平台和数据分析流程,差异表达基因的筛选阈。 阅读提示:Methods部分“RNA-seq analysis” |
| 线粒体功能检测 | 细胞密度、Seahorse分析仪型号、所用试剂盒及药物注射浓度,以及数据处理方式。 阅读提示:Methods部分“Seahorse assay” |
| 形态和突触分析 | GFP慢病毒的MOI、图像分析软件和方法,突触分析中抗体的使用和参数设置。 阅读提示:Methods部分“Immunocytochemistry/Arborization analysis/Synapse analysis” |
| GABA释放检测 | KCl刺激浓度和时间,TTX浓度,ELISA试剂盒和使用方法。 阅读提示:Methods部分“Synaptic GABA release assay” |