人类分泌蛋白组文库筛选揭示肽聚糖识别蛋白1在莱姆疏螺旋体病中的作用

A human secretome library screen reveals a role for Peptidoglycan Recognition Protein 1 in Lyme borreliosis.

作者信息Akash Gupta, Gunjan Arora, Connor E Rosen, Zachary Kloos, Yongguo Cao, Jiri Cerny, Andaleeb Sajid, Dieuwertje Hoornstra, Maryna Golovchenko, Natalie Rudenko, Ulrike Munderloh, Joppe W Hovius, Carmen J Booth, Christine Jacobs-Wagner, Noah W Palm, Aaron M Ring, Erol Fikrig
PMID33175909
发布时间2020-11-11
DOI10.1371/journal.ppat.1009030

实验完整度

高

研究包含酵母展示高通量筛选、体外结合与杀伤实验、PGLYRP1敲除小鼠体内感染模型及组织病理、抗体和细胞因子分析,多层级验证。

主要模型

BALB/c小鼠 PGLYRP1-/-小鼠 B. burgdorferi N40菌株 酵母展示文库

重点核对

酵母展示筛选的Borrelia培养温度(33°C和37°C) PGLYRP1与B. burgdorferi结合实验中使用的蛋白浓度(10和40 μg/ml) 体内感染小鼠的B. burgdorferi注射剂量(1x10^6螺旋体,皮下注射) 感染后检测时间点(14和25天) PGLYRP1-/-小鼠品系来源(BALB/c背景)

摘要

莱姆病是北美最常见的媒介传播疾病,由螺旋体伯氏疏螺旋体引起。感染始于蜱叮咬后的皮肤,并可扩散至心脏、关节、神经系统及其他器官。多种宿主反应影响小鼠和人类中伯氏疏螺旋体的感染水平。我们采用系统生物学方法,研究了人类细胞外蛋白和分泌蛋白与伯氏疏螺旋体之间的潜在分子相互作用。一个表达1031种人类细胞外蛋白的酵母展示文库与36株伯氏疏螺旋体(sensu lato)分离株进行了筛选。我们发现人类肽聚糖识别蛋白1(PGLYRP1)能与绝大多数伯氏疏螺旋体分离株相互作用。在随后的实验中,我们证明重组PGLYRP1与纯化的伯氏疏螺旋体肽聚糖相互作用,并具有杀螺旋体活性,这表明脊椎动物宿主可能使用PGLYRP1来识别伯氏疏螺旋体。我们检查了缺乏PGLYRP1的小鼠中的伯氏疏螺旋体感染,观察到心脏和关节中的螺旋体负荷增加,以及脾肿大。缺乏PGLYRP1的小鼠还显示出免疫失调的迹象,包括血清IgG水平降低和IFNγ、CXCL9和CXCL10水平升高。总之,我们的研究结果表明,PGLYRP1在宿主对伯氏疏螺旋体的反应中发挥作用,并进一步证明了广泛的酵母展示筛选在捕获螺旋体与其宿主之间生物学相关相互作用方面的效用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
人类细胞外和分泌蛋白中哪些与伯氏疏螺旋体相互作用,并影响莱姆病的宿主防御?
核心机制
PGLYRP1通过结合B. burgdorferi的肽聚糖并直接杀死螺旋体,同时通过增强抗体反应来控制螺旋体负荷,缺乏PGLYRP1导致Th1型细胞因子(IFN-γ、CXCL9、CXCL10)升高和体液免疫受损。
主要证据
酵母展示筛选鉴定出PGLYRP1,ELISA和流式细胞术验证了其与B. burgdorferi及其肽聚糖的结合及杀菌活性;PGLYRP1-/-小鼠感染后心脏和关节螺旋体负荷增加,血清IgG及亚类降低,IFN-γ等细胞因子升高。
研究意义
发现PGLYRP1在莱姆病宿主防御中的新作用,并展示BASEHIT酵母展示筛选在识别宿主-病原体相互作用中的实用性。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

酵母展示筛选宿主蛋白与Borrelia相互作用

鉴定与B. burgdorferi相互作用的人类细胞外和分泌蛋白

使用BASEHIT技术,将表达1031个人类蛋白的酵母文库与表面生物素化的B. burgdorferi N40(33°C和37°C培养)孵育,通过磁珠分离和下一代测序鉴定结合蛋白。

2

验证PGLYRP1与B. burgdorferi的结合

验证PGLYRP1与B. burgdorferi的直接结合

通过ELISA检测重组人PGLYRP1-Fc与B. burgdorferi全细胞裂解物的结合;通过流式细胞术检测人/鼠PGLYRP1-His与活B. burgdorferi的结合。

3

检测PGLYRP1的杀螺旋体活性

评估PGLYRP1是否直接杀死B. burgdorferi

将B. burgdorferi(1x10^5)与不同浓度的人PGLYRP1-His8(0-66.7 ng/μl)在微需氧条件下33°C共培养48小时,通过BacTiter-Glo检测活力。

4

验证PGLYRP1与肽聚糖的结合

确定PGLYRP1是否特异结合B. burgdorferi肽聚糖

通过ELISA检测PGLYRP1与纯化PG的结合;通过流式细胞术进行竞争实验,将PGLYRP1与PG预孵育后再加入B. burgdorferi。

5

体内感染实验评估PGLYRP1的作用

评估PGLYRP1缺失对B. burgdorferi感染的影响

用B. burgdorferi N40皮下感染WT和PGLYRP1-/- BALB/c小鼠,在14和25天取耳组织,25天取心脏和关节,通过qPCR检测螺旋体负荷,测量脾脏重量,并评估组织病理。

6

评估抗体和细胞因子反应

检查PGLYRP1缺失对适应性免疫的影响

通过ELISA检测血清中B. burgdorferi特异性IgM、IgG及亚型(IgG1、IgG2a、IgG2b、IgG3);通过31-plex细胞因子阵列检测血清细胞因子水平。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
磺基-NHS-LC-生物素BioVision2326-50
链霉亲和素微粒SpherotechSVM-025-5H
Zymoprep酵母质粒小提试剂盒Zymo Research--
山羊抗人IgG HRP偶联二抗Sigma-AldrichAP309P
KPL Sureblue TMB微孔过氧化物酶底物Seracare5120-0077
人PGLYRP1R&D Systems2590-PGB
6X-His标签多克隆抗体,HRPInvitrogenMA1-135-A488
1-Step Ultra TMB-ELISA底物溶液Seracare52-00-03
BacTiter-GloPromega--
重组小鼠PGLYRP1(带6X-His标签)Sino Biological50115-M08H
抗6X-His单克隆抗体偶联Alexa Fluor 488ThermoFisherMA1-21315-488
SA3800光谱分析仪Sony Biotechnology--
eBioscience细胞增殖染料eFluor 670ThermoFisher65-0840-85
Qiagen DNeasy血液和组织试剂盒Qiagen--
iQ-SYBR Green SupermixBio-Rad--
山羊抗小鼠IgM HRP偶联抗体ThermoFisher62-6840
兔抗小鼠IgG HRP偶联抗体ThermoFisher61-6520
山羊抗小鼠IgG1/IgG2a/IgG2b/IgG3 HRPAbcamab97240,
小鼠细胞因子/趋化因子31重阵列(MD-31)Eve Technologies--
Expi293细胞ThermoFisherA14527
ExpiFectamine 293转染试剂盒ThermoFisherA14524

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
酵母展示筛选
Borrelia培养温度(33°C和37°C);Borrelia表面生物素化条件(5 μM Sulfo-NHS-LC-Biotin,37°C 30分钟);酵母诱导条件(30°C 24小时);筛选使用的Borrelia分离株和数量
阅读提示:Methods: Yeast library screening
ELISA验证PGLYRP1结合
PGLYRP1浓度范围(1-100 ng);B. burgdorferi裂解物包被量(100 ng/孔);孵育时间(1小时,37°C);二抗稀释度(1:5000)
阅读提示:Methods: ELISA for analysis of B. burgdorferi interaction with human PGLYRP1
流式结合实验
PGLYRP1浓度(10和40 μg/ml);CD55阴性对照浓度(40 μg/ml);孵育时间(1小时,室温);PG竞争实验中的PGLYRP1和PG浓度(1 μg/mL和10 μg/mL)
阅读提示:Methods: Flow cytometry based PGLYRP1 and PG binding assay
杀螺旋体实验
B. burgdorferi数量(1x10^5);PGLYRP1浓度(0-66.7 ng/μl);孵育时间(48小时)和温度(33°C)
阅读提示:Methods: Borreliacidal assay
体内感染实验
小鼠品系(BALB/c)和基因型;小鼠周龄(6-8周);B. burgdorferi注射剂量(1x10^6螺旋体,皮下);检测时间点(14和25天);每组小鼠数量(7-9只)
阅读提示:Methods: In vivo infection of mice
qPCR检测螺旋体负荷
靶基因(flaB)和内参基因(β-actin);组织样本类型(心脏、关节、耳);DNA提取试剂盒;qPCR试剂(iQ-SYBR Green Supermix)
阅读提示:Methods: Quantification of Borrelia burden
抗体和细胞因子检测
血清稀释范围(1:200-1:200,000);检测时间点(25 dpi);IgG亚型检测方法;细胞因子阵列类型(31-plex)
阅读提示:Methods: Antibody titers against B. burgdorferi; Cytokine profile