抑制I类PI3K增强分子伴侣介导的自噬

Inhibition of class I PI3K enhances chaperone-mediated autophagy.

作者信息S Joseph Endicott, Zachary J Ziemba, Logan J Beckmann, Dennis N Boynton, Richard A Miller
PMID33048163
发布时间2020-12-07
DOI10.1083/jcb.202001031

实验完整度

包含体外细胞实验(NIH3T3、AML12、mIMCD3)和体内小鼠实验(肝脏溶酶体分离)等多层级验证,并利用功能验证(CMA报告基因、底物摄取)和机制验证(GFAP磷酸化、Akt信号通路)。

主要模型

NIH3T3细胞系 AML12小鼠肝细胞 mIMCD3小鼠肾集合管细胞 UM-HET3小鼠(肝脏)

重点核对

药物剂量:NIH3T3细胞中buparlisib 2 µM、pictilisib 500 nM、copanlisib 50 nM 药物处理时间:10小时(CMA报告基因)或24小时(底物丰度) 体内给药:小鼠口服buparlisib 50 mg/kg或pictilisib 100 mg/kg,每日一次连续7天 报告基因:KFERQ-Dendra2荧光报告基因检测CMA活性 检测终点:GFAP磷酸化水平、LC3-II通量、CMA底物(Tau)溶酶体摄取

摘要

Endicott等人报告,抑制I类PI3K可激活培养细胞和小鼠中的分子伴侣介导的自噬(CMA)。选择性抑制III类PI3K不能激活CMA。这项工作厘清了之前对PI3K在CMA调控中作用的误解。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
抑制I类PI3K或III类PI3K对CMA的影响及其机制是否不同?
核心机制
抑制I类PI3K-PDPK1通路可降低溶酶体GFAP的磷酸化,从而激活CMA;抑制III类PI3K(Vps34)不影响Akt和GFAP磷酸化,因此不激活CMA。
主要证据
在NIH3T3、AML12和mIMCD3细胞中,I类PI3K抑制剂(buparlisib、pictilisib、copanlisib)或PDPK1抑制剂增加Dendra2报告基因斑点并降低GFAP磷酸化;小鼠肝脏溶酶体中线粒体摄取CMA底物(Tau、ALDOB、ENOA)增加,且GFAP磷酸化降低。
研究意义
研究表明I类PI3K抑制剂可调节体内CMA,为将其重用于治疗与CMA相关的病理(如神经退行性疾病)提供基础。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

验证I类PI3K抑制剂对CMA的激活作用

检测抑制I类PI3K是否足以激活CMA

使用三种I类PI3K抑制剂(buparlisib、pictilisib、copanlisib)处理NIH3T3细胞,检测Akt、MAPKAP1和GFAP磷酸化,以及Dendra2-CMA报告基因斑点形成和LC3-II通量。

2

验证PDPK1抑制剂对CMA的激活作用

测试抑制PDPK1是否能激活CMA,确认INS信号通路的作用

使用三种PDPK1抑制剂(BX795、BX912、GSK2334470)处理NIH3T3细胞,检测Akt、MAPKAP1、GFAP磷酸化,以及Dendra2报告基因斑点和LC3-II通量。

3

验证III类PI3K(Vps34)抑制对CMA的影响

测试选择性抑制Vps34是否能激活CMA

使用autophinib和VPS34-IN1处理NIH3T3细胞,检测Akt和GFAP磷酸化、Dendra2报告基因斑点和LC3-II通量。

4

验证Atg5敲低对CMA的影响

测试抑制macroautophagy(不依赖Vps34)是否能激活CMA

用siRNA敲低NIH3T3细胞中的Atg5,检测LC3-II转换、GFAP磷酸化、Akt磷酸化和Dendra2报告基因斑点。

5

验证I类PI3K抑制剂在多种细胞类型中的效应

确认I类PI3K抑制激活CMA的普遍性

在AML12和mIMCD3细胞中测试buparlisib、pictilisib和autophinib对CMA和macroautophagy的影响,检测Akt、MAPKAP1、GFAP磷酸化、Dendra2报告基因斑点和LC3-II通量。

6

检测CMA底物蛋白丰度的变化

验证I类PI3K抑制剂促进CMA降解底物蛋白

用pictilisib、copanlisib或autophinib处理NIH3T3细胞24小时,Western blot检测CMA底物CIP2A、ACACA、EIF2A、EIF5、IDH1的蛋白水平。

7

体内验证I类PI3K抑制剂对肝脏CMA的影响

测试口服I类PI3K抑制剂是否能激活小鼠肝脏CMA

小鼠口服buparlisib或pictilisib连续7天,分离肝脏溶酶体,进行Tau底物摄取实验、检测GFAP磷酸化、HSPA8水平,以及内源性底物(ALDOB、ENOA)的摄取。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Gibco11965092
胎牛血清Corning35-016-CV
青霉素-链霉素Gibco15070063
DMEM:F12培养基Gibco11320033
胰岛素-硒-转铁蛋白Gibco51500-056
地塞米松Sigma-AldrichD4902
布帕利昔SelleckChemS2247
皮克替昔SelleckChemS1065
科普利昔SelleckChemS2802
BX795SelleckChemS1274
BX912SelleckChemS1275
GSK2334470Tocris4143
巴弗洛霉素ASigma-AldrichSML1661
3-甲基腺嘌呤SelleckChemS2767
自噬抑制素SelleckChemS8596
VPS34-IN1SelleckChem7980
二甲基亚砜Sigma-AldrichD2650
布帕利昔MedChem ExpressHY-70063
皮克替昔MedChem ExpressHY-50094
亮肽素Sigma-Aldrich108976
KFERQ-Dendra2质粒----
Hoechst染液Sigma-Aldrich94403
荧光蛋白封片剂GBI LabsE18-18
裂解缓冲液Thermo Fisher Scientific89839
OptiPrep密度梯度介质Sigma-AldrichD1556
超速离心管Beckman Coulter344057
55Ti-SW转头Beckman Coulter342194
L-70超速离心机Beckman Coulter--
重组HSPA8蛋白AbCamab78431
重组Tau蛋白Sino Biological10058-H07E
蛋白酶抑制剂Sigma-Aldrich11836153001
BCA蛋白定量试剂盒Thermo Fisher Scientific23225
ACACA/ACC1抗体Cell Signaling Technology4190S
ACTB/β-Actin抗体Cell Signaling Technology8457L
AKT抗体Cell Signaling Technology4691S
pT308 AKT抗体Cell Signaling Technology13038S
pS473 AKT抗体Cell Signaling Technology4060S
ATG5抗体Cell Signaling Technology12994S
CIP2A抗体Santa Cruzsc-80659
CTSD/组织蛋白酶D抗体AbCam75852
EIF2A抗体Cell Signaling Technology9722S
EIF5抗体Cell Signaling Technology13894S
ENO1抗体Cell Signaling Technology3810S
GAPDH抗体Cell Signaling Technology2118S
GSK3β抗体Cell Signaling Technology12456S
pS9 GSK3β抗体Cell Signaling Technology9323S
GFAP抗体AbCam7260
pS8 GFAP抗体Thermo Fisher ScientificPA5-12991
HSPA8/Hsc70抗体AbCam154415
IDH1抗体AbCam172964
IRS1抗体Cell Signaling Technology2382S
LAMP1抗体AbCam24170
LAMP2A抗体AbCam125068
MAP1LC3B/LC3抗体Cell Signaling Technology2775S
MAPKAP1/mSIN1抗体AbCam64188
pT86 MAPKAP1/mSIN1抗体Cell Signaling Technology14716S
MAPT/Tau抗体Cell Signaling Technology46687S
OXPHOS抗体鸡尾酒AbCam110413
PPID/亲环蛋白40抗体AbCam181983
SQSTM1/p62抗体Cell Signaling Technology5114S
Lipofectamine RNAi MAX转染试剂Invitrogen56532
OptiMEM培养基Gibco31985-062
Zeiss Axioplan2显微镜Zeiss--
Zeiss ApoTome光切模块Zeiss--
Zeiss AxioCam MRm相机Zeiss--
Zeiss Plan-NEOFLUAR 40x物镜Zeiss--
Nightsea DFP-VR灯Nightsea--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
细胞系(NIH3T3、AML12、mIMCD3)来源、培养基配方、血清浓度、CO2浓度、传代次数和支原体检测
阅读提示:Materials and methods: Cell culture
药物处理
药物剂量、处理时间、溶剂对照(DMSO或TFA)
阅读提示:Materials and methods: Drugs for cell culture experiments; Figure legends S1–S4
CMA报告基因检测
KFERQ-Dendra2报告基因构建、病毒转导、光转化条件、处理时间(10小时)、细胞固定和封片条件
阅读提示:Materials and methods: Fluorescent CMA reporter; Image analysis
溶酶体分离和CMA活性测定
小鼠品系、年龄、给药方案(口服,7天),溶酶体分离方法(密度梯度离心),底物(Tau)摄取实验条件(时间、温度、ATP、HSPA8等)
阅读提示:Materials and methods: Lysosome isolation and CMA evaluation; Figure legends 6 and 7
体内实验
小鼠性别、体重、给药体积、药物溶解溶剂(NMP/PEG300)、leupeptin剂量和给药途径
阅读提示:Materials and methods: Drugs for mouse experiments; Mouse stocks and husbandry
Western blot
抗体信息(货号、稀释比例)、蛋白上样量、内参(ACTB、H3)选择
阅读提示:Materials and methods: Antibodies