回顾性队列分析确定参数
评估文献中描述的八种FISH参数在已知MYCN扩增样本中的分布和可靠性。
对11例经qPCR预先验证为MYCN扩增的视网膜母细胞瘤样本进行FISH分析,计数20、50和100个细胞,计算八种参数的均值、中位数、标准差和方差。
Definition of parameters and thresholds to detect MYCN amplification in retinoblastomas
研究包含回顾性队列(n=11)与前瞻性队列(n=33)的验证,并进行统计分析和文献综述,但缺乏体外或动物模型的功能验证。
44例经眼球摘除术治疗的视网膜母细胞瘤临床样本
MYCN扩增检测参数:AVGCN≥10 MYCN/CEN2比值≥3 MYCN-CEN2差异≥8 至少计数50个肿瘤细胞 通过qPCR预先验证的回顾性队列样本
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估文献中描述的八种FISH参数在已知MYCN扩增样本中的分布和可靠性。
对11例经qPCR预先验证为MYCN扩增的视网膜母细胞瘤样本进行FISH分析,计数20、50和100个细胞,计算八种参数的均值、中位数、标准差和方差。
验证所提出的FISH标准在未经选择的临床样本中的适用性和MYCN扩增的患病率。
对33例连续视网膜母细胞瘤样本进行FISH分析,应用AVGCN≥10、MYCN/CEN2比值≥3、MYCN-CEN2差异≥8的阈值进行扩增判定。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| FISH检测 | ZytoLight FISH组织处理试剂盒 | ZytoVision GmbH | -- |
| ZytoLight SPEC MYCN/2q11双色探针 | ZytoVision GmbH | Z-2028-5/-20 | |
| 显微镜观察 | Leica DM6B荧光显微镜 | Leica | -- |
| 统计分析 | IBM SPSS Statistics软件 | IBM | Version 29.0.2.0 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| FISH检测 | 使用ZytoLight SPEC MYCN/2q11 Dual Color Probe;评估100个肿瘤细胞核,从5个不同区域各计数20个连续细胞核;使用63×和100×油浸物镜。 阅读提示:Materials and methods, FISH |
| 数据分析 | 确定MYCN扩增的阈值:AVGCN≥10,MYCN/CEN2比值≥3,MYCN-CEN2差异≥8;至少计数50个细胞。 阅读提示:Results, Definition of FISH parameters based on analyses of the retrospective group |