PTEN表达评估
评估肿瘤组织微阵列中PTEN蛋白表达状态。
使用免疫组化染色对TMA核心进行PTEN表达分类,分为完整、降低或缺失。
PTEN status, tumor immune microenvironment, and survival in colorectal cancer
包含两个独立队列(N=2303)的回顾性和前瞻性研究,采用免疫组化、多重免疫组化、生存分析和体外细胞功能验证(实验层级)。
结直肠癌患者队列(两个独立队列,N=2303) 肿瘤组织微阵列(TMA)
PTEN表达状态(完整、降低、缺失)的判读标准 免疫细胞密度分析的多重免疫组化panel 生存分析的多变量Cox回归模型中的协变量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估肿瘤组织微阵列中PTEN蛋白表达状态。
使用免疫组化染色对TMA核心进行PTEN表达分类,分为完整、降低或缺失。
验证TMA-based PTEN表达分类的可靠性。
对队列2的30个样本进行全切片PTEN免疫组化评估,并与TMA-based评分比较。
评估PTEN表达状态与免疫细胞密度和免疫抑制标志物表达的关系。
使用多重免疫组化分析肿瘤上皮和间质区域的免疫细胞密度,包括T细胞、B细胞、浆细胞、巨噬细胞等。
评估PTEN表达状态与结直肠癌患者生存预后的关联。
使用Cox回归和Kaplan-Meier曲线评估CRC特异性生存和总生存。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 徕卡Bond III | Leica | -- |
| PTEN抗体(D4.3)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 9188S | |
| 徕卡Bond抗原修复液 | Leica | AR9640 | |
| 徕卡Bond聚合物精炼检测试剂盒 | Leica | DS9800 | |
| 数据分析 | R Studio | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PTEN免疫组化 | 组织微阵列核心数量(4个1mm核心) 阅读提示:Methods: PTEN immunohistochemistry |
| PTEN免疫组化 | 抗体克隆、稀释度、孵育时间 阅读提示:Methods: PTEN immunohistochemistry |
| 免疫微环境分析 | 多重免疫组化panel包括的细胞类型 阅读提示:Figure 3 legend and Methods: Immune cell analysis |
| 生存分析 | 调整协变量列表 阅读提示:Statistical analysis and Table 2 footnote |