剪切差异:流动类型决定三维打印体外模型中内皮细胞流动响应基因程序

Shear Difference: Flow Type Dictates Endothelial Flow-Responsive Gene Programs in a 3-Dimensional-Printed In Vitro Model

作者信息Nasir A Shah, Kerry-Anne Rye, Zoltan H Endre, Tracie J Barber, Jonathan H Erlich, Blake J Cochran
PMID42466497
发布时间2026-07-21
DOI10.1161/JAHA.125.049901

实验完整度

包含体外细胞模型(HMEC-1)和转录组学(RNA-seq)证据,并进行了形态学和功能验证,具备至少两个独立证据层级。

主要模型

HMEC-1细胞系

重点核对

细胞系:HMEC-1(ATCC CRL-3243) 模型:三维打印PVA核心浇铸PDMS管腔,表面包被10 μg/mL纤连蛋白 流速:连续流和脉动流平均约100 mL/min,持续24小时 波形:脉动流基于动静脉瘘超声数据,周期0.84秒,PI约0.25 统计:形态学采用精确置换检验,RNA-seq使用DESeq2(FDR<0.05)

摘要

背景:内皮细胞具有机械敏感性,并响应血流动力学力而呈现不同表型。这些响应在常规体外平台中难以研究,因为后者很少再现血管尺度的几何结构或临床相关的血流。我们的目标是确定在一个三维宏观流体模型中血流如何影响内皮形态和转录活性。方法:使用水溶性聚乙烯醇三维打印理想化血管,并浇铸聚二甲基硅氧烷。核心溶解后,在管腔上培养人微血管内皮细胞系-1细胞,并在静态、连续或脉动流下灌注24小时。脉动波形来源于动静脉瘘多普勒谱,并缩放以匹配平均体积流量(约100 mL/min)和时均壁面剪切应力(约1.5 dyn/cm²)与连续流。使用免疫荧光评估形态。进行批量RNA测序和基因集富集分析。结果:相对于静态培养,连续流增加了细胞偏心率(0.74 对 0.48;P<0.0001)并降低了方向变异性(Δ=−47.1°,P<0.0001)。差异基因表达广泛(连续流对静态:2103个基因;脉动流对静态:2643个基因;脉动流对连续流:384个基因)。相对于静态,连续流降低了干扰素信号和Hallmark炎症反应程序,而肿瘤坏死因子-α/核因子-κB信号增加。在匹配的平均剪切力下,脉动流富集了细胞周期/检查点程序。相反,连续流富集了氧化磷酸化和p53通路。转化生长因子-β信号在脉动流中富集。结论:在匹配的平均剪切力下,脉动流和连续流与不同的内皮形态和转录特征相关。该宏观流体平台提供了一个经过验证的、波形控制的机制和转化研究的试验台。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
流动形式(连续流和脉动流)如何影响内皮细胞的形态和转录活性,特别是在匹配平均剪切力下?
核心机制
脉动流富集细胞周期/检查点、TGF-β信号,连续流富集氧化磷酸化和p53通路,表明波形本身调控内皮状态,而非仅依赖平均剪切力。
主要证据
在3D打印PDMS宏观流体模型中培养HMEC-1细胞,施加连续或脉动流24小时,通过免疫荧光评估形态、批量RNA-seq和基因集富集分析。结果显示连续流和脉动流诱导不同的基因表达谱。
研究意义
该平台提供了一种波形可控的试验台,用于机制和转化研究,可能有助于理解血流动力学对内皮功能的影响,并用于测试医疗器械、药物洗脱策略等。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

模型制备与验证

构建支持内皮细胞生长的三维血管模型,并验证其表面处理和支持细胞活性的能力。

3D打印PVA核心,浇铸PDMS并溶解核心形成管腔;筛选表面涂层(纤连蛋白等),接种HMEC-1细胞,使用Live/Dead染色和TNF-α刺激验证细胞活力和功能响应。

2

流动条件设置与表征

生成并量化连续流和脉动流,确保平均流速和平均剪切力匹配。

使用可编程蠕动泵产生连续和脉动流,脉动波形基于动静脉瘘超声数据编程,用超声波流量计监测。计算WSS、Re、PI和Womersley数。

3

细胞形态评估

评估流动条件对细胞形态和细胞骨架的影响。

固定和染色(鬼笔环肽和DAPI),共聚焦显微镜成像,分析细胞偏心率和方向变异性。

4

转录组分析

全面分析流动条件引起的基因表达变化和通路富集。

提取RNA,RNA-seq,差异表达分析(DESeq2),基因集富集分析(GSEA)等。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
SolidWorks 2023Dassault Systèmes--
Prusa i3 MK3SPrusa Research--
eSUN PVAShenzhen eSUN Industrial Co., Ltd.--
Keyence VK-X200Keyence Corporation--
Sylgard 184Dow Corning--
纤连蛋白Sigma-AldrichF0895-5MG
人微血管内皮细胞系-1ATCCCRL-3243
MCDB-131完全培养基Gibco10372019
人表皮生长因子Sigma-AldrichE9644
氢化可的松Sigma-AldrichH-4001
L-谷氨酰胺Gibco25030-081
胎牛血清Gibco10099-141
MACS GMP细胞分化袋Miltenyi Biotec170-076-400
NE-9000New Era Pump Systems Inc--
Sonoflow CO.55Sonotec GmbH--
鬼笔环肽-Atto-565Merck94072
DAPIThermo Fisher ScientificD1306
Zeiss LSM 880Carl Zeiss--
RNeasy Plus Mini试剂盒QIAGEN74134
Agilent TapeStationAgilent Technologies--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
模型制备
PDMS混合比例、固化时间、PVA溶解时间、表面平滑处理(30秒水浸)、表面涂层浓度(10 μg/mL纤连蛋白)
阅读提示:Methods: Additive Manufacturing and Polydimethylsiloxane Casting of Idealized Vessel Geometries; Extracellular Matrix Surface Coating and Endothelial Monolayer Formation
细胞培养
HMEC-1细胞系、培养基成分、生长因子浓度、接种密度(3.75×10^4 cells/cm²)、培养条件(37°C、5% CO2)
阅读提示:Methods: Extracellular Matrix Surface Coating and Endothelial Monolayer Formation
流动系统
连续流和脉动流平均流速(约100 mL/min)、脉动波形参数(基于AVF超声)、泵品牌型号、管路连接、灌注时间(24小时)
阅读提示:Methods: Manufacturing of Flow System and Generation of Flow
形态学评估
固定和染色方案、成像设备、分析方法(Fiji)、统计方法(精确置换检验、样本量)
阅读提示:Methods: Morphologic Assessment by Fluorescence Microscopy; Statistical Analysis; Figure 3 legend
RNA-seq
RNA提取试剂盒、建库方法、测序平台、分析流程(fastp、Rsubread、featureCounts、DESeq2、fgsea)、差异表达阈值
阅读提示:Methods: Bulk RNA Sequencing; Figure 2 legend