体内验证SASP对扩散的影响
确定顺铂诱导的SASP是否足以增加HGSOC体内扩散。
将增殖的KPCA.B细胞单独或与衰老细胞共注射到小鼠腹腔,或注射条件培养基;4周后计数腹腔肿瘤结节并分析转移部位。
The chemotherapy-induced senescence-associated secretome promotes cell detachment and metastatic dissemination through metabolic reprogramming
包括体外细胞系实验、体内小鼠模型、CRISPR筛选、转录组和代谢组分析等多个独立证据层级,且包含明确的功能验证和机制验证。
KPCA.B HGSOC细胞系 Ovcar8 HGSOC细胞系 C57BL/6J小鼠腹腔移植瘤模型 IMR90人成纤维细胞(复制性衰老及化疗诱导衰老) YUMM5.2黑色素瘤细胞系;Capan-1胰腺导管腺癌细胞系
KPCA.B和Ovcar8细胞系用于体外衰老诱导和条件培养基实验,浓度为顺铂2 µM(见补充表11)。 体内实验中,6-8周龄雌性C57BL/6J小鼠,腹腔注射1×10^6个增殖细胞,与1×10^6个衰老细胞共注射或每周三次注射200 µL条件培养基。 高果糖饮食实验中,小鼠饮用含30% w/v果糖的水,持续10天再植入细胞并持续整个实验。 受控胰蛋白酶实验使用0.25%胰蛋白酶处理90秒,用于评估细胞脱离。 CRISPR敲除筛选使用代谢聚焦的sgRNA文库,感染复数<0.3,筛选约350倍覆盖度。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定顺铂诱导的SASP是否足以增加HGSOC体内扩散。
将增殖的KPCA.B细胞单独或与衰老细胞共注射到小鼠腹腔,或注射条件培养基;4周后计数腹腔肿瘤结节并分析转移部位。
检测SASP是否促进旁观者细胞脱离并排除蛋白质作用。
使用活细胞成像和受控胰蛋白酶实验,比较PCM和SCM处理下细胞脱离率,并检测热灭活和<3 kDa滤过SCM的效果。
筛选促进SASP介导脱离的代谢相关基因。
用代谢sgRNA文库转导Ovcar8细胞,在SCM中培养72小时,分离脱落和贴壁细胞进行测序,通过MAGeCK分析差异基因。
验证复合物I活性及NDUFA5对脱离和体内扩散的必要性。
使用复合物I抑制剂鱼藤酮处理,敲低或敲除NDUFA5后检测脱离率、呼吸率及体内扩散。
确定复合物I下游通过NAD+、SIRT和SREBP1调控胆固醇合成促进脱离。
补充烟酸或过表达LbNOX恢复NAD+水平,使用SIRT抑制剂和SREBP抑制剂处理,检测脱离率、SREBP1定位和胆固醇含量。
确定SASP中果糖是否驱动脱离及果糖代谢途径。
通过LC-MS检测条件培养基中果糖和葡萄糖水平;补充果糖或敲低KHK、ALDOB、SLC2A5后检测脱离率;体内给予高果糖饮食并敲低Khk或Ndufa5观察扩散。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Corning | 10-040-CV |
| 杜氏改良Eagle培养基 | Fisher Scientific | 12430047 | |
| 胎牛血清 | BioWest | S1620 | |
| 人表皮生长因子 | Sigma | E9644 | |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒 | Fisher Scientific | 41400-045 | |
| L-谷氨酰胺 | Corning | 25-015-CI | |
| 青霉素/链霉素 | Fisher Scientific | 15-140-122 | |
| 胰蛋白酶 | Corning | MT25053CI | |
| 嘌呤霉素 | Thermo Fisher | A1113802 | |
| 杀稻瘟菌素 | InvivoGen | ant-bl-05 | |
| 病毒包装 | Opti-MEM培养基 | Gibco | 31985070 |
| 脂质体转染试剂 | Invitrogen | 11668019 | |
| 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | H9268 | |
| 衰老检测 | 结晶紫 | Sigma-Aldrich | -- |
| X-gal | -- | -- | |
| 增殖检测 | IncuCyte S3活细胞成像系统 | Sartorius | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Ambion | 15596018 |
| Zymo离心柱 | Zymo Research | R1013 | |
| RT-qPCR | 高效cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368814 |
| PowerUp SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | A25742 | |
| CFX Connect实时PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | Bradford蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | 5000006 |
| SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Fisher | -- | |
| 细胞因子检测 | 人细胞因子抗体芯片C1000 | RayBio | AAH-CYT-1000-2 |
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | Jackson Laboratories | 2498079-86 |
| 免疫组化 | 柠檬酸盐缓冲液 | Sigma-Aldrich | C9999 |
| 小鼠和兔特异性HRP/DAB(ABC)检测免疫组化试剂盒 | Abcam | 64264 | |
| Mayer氏苏木素溶液 | Sigma-Aldrich | MHS16 | |
| Cytoseal封片剂 | Sigma-Aldrich | 23-244257 | |
| 细胞脱离实验 | 溴化乙锭二聚体 | Sigma Aldrich | 46043 |
| 超低吸附板 | Corning | 7007; 3474; 3471 | |
| CRISPR筛选 | CRISPR敲除文库 | Addgene | 110066 |
| Ex Taq DNA聚合酶 | Takara | RR001A | |
| PCR扩增子纯化试剂盒 | Promega | A9282 | |
| 能量代谢分析 | 安捷伦Seahorse XFp代谢分析仪 | Agilent | S7802A |
| XFp传感器探针板 | Agilent | 103022-100 | |
| XFp基础培养基 | Agilent | 103576-100 | |
| 谷氨酰胺 | Agilent | 103579-100 | |
| 葡萄糖溶液 | Agilent | 103577-100 | |
| 免疫荧光 | 多聚-L-鸟氨酸 | Sigma | P4957 |
| CellMask深红色染料 | Thermo Fisher Scientific | C10046 | |
| 菲律宾菌素III | Cayman Chemicals | 70440 | |
| 溴脱氧尿苷 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 甘油 | Fisher Scientific | BP229-1 | |
| 尼康ECLIPSE Ti2显微镜 | Nikon | -- | |
| ORCA-Fusion C14440相机 | Hamamatsu | -- | |
| TIRF成像 | 尼康Ti-E显微镜 | Nikon | -- |
| Prime 95B相机 | Photometrics | -- | |
| ChIP | 蛋白G磁珠 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | P8340 | |
| 代谢物测量 | 同位素标记TCA循环混合物 | Cambridge Isotope Laboratories | MSK-TCA-A |
| 丙酰-L-肉碱-(N-甲基-d3) | Sigma Aldrich | 52941 | |
| ZIC-pHILIC色谱柱 | EMD Millipore | -- | |
| Vanquish Duo超高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Q Exactive Plus质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 胆固醇测量 | 13C5-胆固醇 | Cambridge Isotope Laboratories | -- |
| Accucore C30色谱柱 | Thermo Fisher Scientific | 27826-152130 | |
| Exploris 480质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 药物处理 | 顺铂 | -- | -- |
| 卡铂 | -- | -- | |
| 吉西他滨 | -- | -- | |
| 那维托克(ABT-263) | -- | -- | |
| 鱼藤酮 | -- | -- | |
| 烟酸 | -- | -- | |
| N-乙酰半胱氨酸 | -- | -- | |
| 法托司他 | -- | -- | |
| 甲基-β-环糊精 | -- | -- | |
| 洛伐他汀 | -- | -- | |
| 美伐他汀 | -- | -- | |
| 胆固醇 | -- | -- | |
| 果糖 | -- | -- | |
| 葡萄糖 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 衰老诱导 | 细胞系、顺铂等药物浓度(见补充表11)、处理48小时、药物移除后新鲜培养24小时、再条件化培养基48小时 阅读提示:Methods:Senescence induction and conditioned media generation |
| 条件培养基处理 | PCM和SCM的制备、处理时间(72小时)、抑制剂或补充剂的浓度(见补充表11) 阅读提示:Methods:Control trypsin assay、Senescence induction and conditioned media generation |
| 细胞脱离检测 | 细胞接种密度、培养时间、胰蛋白酶浓度和处理时间(90秒) 阅读提示:Methods:Control trypsin assay、Non-adherent culture and imaging |
| 体内扩散模型 | 小鼠品系和年龄、细胞数量(1×10^6)、共注射比例(1:1)、条件培养基注射体积和频率(200μL每周三次)、终点时间(第4周) 阅读提示:Methods:Murine ovarian cancer in vivo models、Figure legends for Figures 1, 2, and 6 |
| 饮食干预 | 果糖或葡萄糖浓度(30% w/v)、开始时间(细胞植入前10天)、持续时间 阅读提示:Methods:Murine ovarian cancer in vivo models、Figure 6 legends |