饮食干预与小鼠分组
评估终身Val-R对健康寿命和寿命的影响
将4周龄C57BL/6J小鼠随机分为对照组(CTL)和缬氨酸限制组(Val-R),分别喂食氨基酸定义饮食(Val-R组缬氨酸降低67%),并持续终身。
Lifelong restriction of dietary valine has sex-specific benefits for health and lifespan in mice
包含长期生存实验、代谢表型分析、多组织转录组学、WGCNA网络分析、线粒体呼吸功能测定及衰老标志物检测等多个独立证据层级,且包含功能验证和机制探索。
C57BL/6J小鼠 雄性小鼠(Val-R饮食) 雌性小鼠(Val-R饮食) 小鼠原代肝细胞
小鼠品系为C57BL/6J, diet开始于4周龄 缬氨酸限制饮食(Val-R)中缬氨酸含量降低67% 对照组为含全部20种氨基酸的氨基酸定义饮食 雄性小鼠中位寿命延长23.42% 睾丸激素水平变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估终身Val-R对健康寿命和寿命的影响
将4周龄C57BL/6J小鼠随机分为对照组(CTL)和缬氨酸限制组(Val-R),分别喂食氨基酸定义饮食(Val-R组缬氨酸降低67%),并持续终身。
检测Val-R对体重、身体成分和血糖控制的影响
每月测量体重,每6个月测量身体成分,并进行葡萄糖耐受性测试(GTT)、胰岛素耐受性测试(ITT)和丙氨酸耐受性测试。
评估Val-R对能量消耗和产热的影响
使用代谢笼系统测量O2消耗、CO2产生、食物摄入和活动,分析能量消耗和呼吸交换率;并检测棕色脂肪组织(BAT)和白色脂肪组织的产热基因表达。
探究Val-R的分子机制和组织特异性反应
对肝脏、肌肉和BAT进行转录组测序分析,鉴定差异表达基因和通路;使用WGCNA分析基因模块与表型的关联;并通过Western blot验证关键蛋白表达。
评估Val-R对认知功能和小胶质细胞/星形胶质细胞活化的影响
通过新型物体识别(NOR)测试评估学习和记忆;通过免疫荧光染色检测脑区(ARC、CA3、DG)小胶质细胞(Iba1)和星形胶质细胞(GFAP)的形态和密度。
确定Val-R对寿命和健康寿命的影响
进行生存分析、虚弱指数评分、运动功能测试(转棒、倒挂)、癌症发生率检测,并计算FAMY和GRAIL。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物饲养 | C57BL/6J小鼠 | The Jackson Laboratory | -- |
| 饮食干预 | 对照饮食TD.140711 | Inotiv | -- |
| 缬氨酸限制饮食TD.160735 | Inotiv | -- | |
| 代谢分析 | 拜耳康拓血糖仪 | Bayer | -- |
| 身体成分分析 | EchoMRI身体成分分析仪 | EchoMRI | -- |
| 能量代谢 | Oxymax/CLAMS-HC代谢笼系统 | Columbus Instruments | -- |
| 蛋白检测 | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| FastPrep 24组织匀浆仪 | MP Biomedicals | -- | |
| PVDF膜 | EMD Millipore | -- | |
| pT389-S6K1抗体 (108D2) | Cell Signaling Technologies | 9234 | |
| S6K1抗体 | Cell Signaling Technologies | 9202 | |
| pS240/244-S6抗体 | Cell Signaling Technologies | 2215 | |
| S6抗体 (5G10) | Cell Signaling Technologies | 2217 | |
| pThr37/46 4E-BP1抗体 (236B4) | Cell Signaling Technologies | 2855 | |
| 4E-BP1抗体 (53H11) | Cell Signaling Technologies | 9644 | |
| eIF2α抗体 (D7D3) | Cell Signaling Technologies | 5324 | |
| pS51-eIF2α抗体 (119A11) | Cell Signaling Technologies | 3597 | |
| AMPKα抗体 (D5A2) | Cell Signaling Technologies | 5831 | |
| pAMPKα抗体 (D79.5E) | Cell Signaling Technologies | 4188 | |
| Beclin-1抗体 (D40C5) | Cell Signaling Technologies | 3495 | |
| LC3A/B抗体 (D3U4C) | Cell Signaling Technologies | 12741 | |
| AKT(总)抗体 (C67E7) | Cell Signaling Technologies | 4691 | |
| pAKT S473抗体 (D9E) | Cell Signaling Technologies | 4060L | |
| p44/42 MAPK (Erk1/2)抗体 | Cell Signaling Technologies | 9102 | |
| 磷酸化p44/42 MAPK抗体 (Thr202/Tyr204) | Cell Signaling Technologies | 9101 | |
| p-FoxO1 (Thr24)/FoxO3a (Thr32)抗体 | Cell Signaling Technologies | 9464 | |
| VDAC抗体 | Cell Signaling Technologies | 4866 | |
| GAPDH抗体 (14C10) | Cell Signaling Technologies | 2118 | |
| β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technologies | 2146 | |
| p62抗体 | American Research Products | 03-GP62-C | |
| 总OXPHOS啮齿动物抗体混合物 | Abcam | ab110413 | |
| RNA提取 | TRI试剂 | -- | -- |
| PureLink RNA小量提取试剂盒 | Invitrogen | 12183025 | |
| DNA酶 | Invitrogen | 12185010 | |
| RT-qPCR | SuperScript III逆转录酶 | Invitrogen | -- |
| SYBR Green PCR预混液 | Invitrogen | -- | |
| StepOne Plus实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| ELISA | 小鼠/大鼠FGF-21 Quantikine ELISA试剂盒 | R&D Systems | MF2100 |
| 超灵敏小鼠胰岛素ELISA试剂盒 | Crystal Chem | 90080 | |
| 血脂检测 | 甘油三酯比色法检测试剂盒 | Cayman Chemical Company | 10010303 |
| RNA测序 | NEBNext Ultra II定向RNA文库制备试剂盒 | New England Biolabs | -- |
| Illumina NovaSeq X Plus测序仪 | Illumina | -- | |
| 线粒体呼吸分析 | Seahorse XFe96分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| 细胞染色 | 油红O | -- | -- |
| SA-β-Gal染色液 | -- | -- | |
| 免疫组化 | 抗GFAP抗体 | Millipore | ab5804 |
| 抗Iba1抗体 | Abcam | ab5076 | |
| AlexaFluor偶联二抗 | Invitrogen | -- | |
| 成像 | EVOS显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 奥林巴斯FluoView 500共聚焦显微镜 | Olympus | -- | |
| 蔡司LSM 800激光扫描共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 多光子激光扫描显微镜 (LSM 800) | Zeiss | -- | |
| μCT | SkyScan 1172微型CT | Bruker | -- |
| NRecon软件 | Bruker | -- | |
| CTAn软件 | Bruker | -- | |
| CT Vox软件 | Bruker | -- | |
| 图像分析 | VoidWhizzard软件 | -- | -- |
| 行为分析 | Bio-Rad ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白定量 | Bradford试剂 | Pierce Biotechnology | -- |
| 代谢分析 | 胰岛素 | -- | -- |
| 葡萄糖 | -- | -- | |
| 丙氨酸 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 饮食干预 | 饮食配方:对照组为TD.140711,缬氨酸限制组为TD.160735,其中缬氨酸含量降低67%;饮食应等热量,脂肪和碳水化合物含量相同,缺失的缬氨酸由非必需氨基酸补充 阅读提示:参见Methods 'Animal care, housing and diet'及补充表1 |
| 动物模型 | 小鼠品系:C57BL/6J;起始年龄:4周龄;饲养条件:SPF环境,12:12小时光暗循环,温度约22°C,每笼2-3只,自由采食和饮水 阅读提示:参见Methods 'Animal care, housing and diet' |
| 代谢表型分析 | 葡萄糖耐受性测试(GTT)前禁食16小时,胰岛素耐受性测试(ITT)和丙氨酸耐受性测试前禁食4小时;葡萄糖剂量1 g/kg,胰岛素0.75 U/kg,丙氨酸2 g/kg,腹腔注射;血糖测量时间点和频率 阅读提示:参见Methods 'Metabolic phenotyping' |
| 线粒体呼吸功能 | 线粒体提取和呼吸测定条件:使用Seahorse XFe96分析仪,底物包括NADH(复合物I)、琥珀酸/鱼藤酮(复合物II)、抗坏血酸(复合物IV),抑制剂浓度等 阅读提示:参见Methods 'Mitochondrial respiratory analysis' |
| 转录组分析 | RNA提取方法(PureLink RNA mini kit),测序平台(Illumina NovaSeq X Plus),参考基因组(GRCm39),差异表达分析工具和阈值 阅读提示:参见Methods 'Transcriptomics' |