建立基因工程小鼠模型
模拟人类cSCC的遗传背景和自发肿瘤形成。
使用K14-Cre介导的p53R172H表达和Cdkn2a缺失,监测小鼠自发肿瘤发生。
Development of an immunocompetent cutaneous squamous cell carcinoma model identifies VISTA and CTLA-4 as targetable immune checkpoints
包含基因工程小鼠模型、同基因细胞系、多组学分析、体外功能实验、体内免疫治疗试验及人类样本验证,证据层级多样且具有功能机制验证。
p53-GOF; Cdkn2a-LOF 基因工程小鼠模型 ROCSkin-1、ROCSkin-2、ROCSkin-5 同基因小鼠细胞系 C57BL/6J 小鼠皮下移植瘤模型 人类cSCC组织微阵列
p53和Cdkn2a的突变状态及表达水平 同基因细胞系的基因组和转录组特征 不同ROCSkin模型的免疫微环境组成 STING激动剂和免疫检查点阻断的治疗方案及剂量 人类cSCC组织中VISTA的表达水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟人类cSCC的遗传背景和自发肿瘤形成。
使用K14-Cre介导的p53R172H表达和Cdkn2a缺失,监测小鼠自发肿瘤发生。
获得可移植的cSCC细胞系,用于体外和体内研究。
从自发肿瘤中分离细胞,建立ROCSkin系列细胞系,并进行全外显子组测序、RNA测序和核型分析。
描述不同模型的免疫细胞组成和免疫检查点表达。
通过流式细胞术和多重免疫组化分析肿瘤浸润免疫细胞。
评估不同治疗方案在ROCSkin模型中的疗效。
皮下接种肿瘤细胞后,给予抗PD-1、STING激动剂、抗CTLA-4、抗VISTA抗体及其组合。
评估VISTA在人类cSCC中的临床相关性。
对人cSCC组织微阵列进行VISTA免疫组化染色,并量化表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 测序 | 血液和细胞培养DNA小量提取试剂盒 | Qiagen | 13323 |
| RNA小量提取试剂盒 | Zymo Research | -- | |
| 免疫组化 | 抗细胞角蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 83957 |
| 抗波形蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 5741 | |
| 抗p53抗体 | Leica Biosystems | NCL-L-p53-CM5p | |
| 抗VISTA抗体 | Cell Signaling Technology | 54979 | |
| 蛋白质印迹 | 抗p53抗体 | Cell Signaling Technology | 32532 |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc81178 | |
| 定量PCR | RNeasy小量提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| SuperScript III反转录试剂盒 | Life Technologies | -- | |
| SsoAdvanced通用SYBR Green预混液 | Bio-Rad | -- | |
| 流式细胞术 | 胶原酶I | -- | -- |
| 胶原酶IV | -- | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | -- | -- | |
| 免疫治疗 | 抗小鼠PD-1抗体 | Bio X Cell | BP0146 |
| 抗CTLA-4抗体 | Bio X Cell | BE0131 | |
| 抗VISTA抗体 | Bio X Cell | BE0310 | |
| STING激动剂c-di-GMP | InvivoGen | tlrl-nacdg |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 基因型(p53-GOF; Cdkn2a-LOF)、Cre介导的等位基因激活/缺失、小鼠品系(C57BL/6J背景) 阅读提示:Methods: Mice |
| 细胞系建立 | 肿瘤来源、细胞系名称(ROCSkin-1, -2, -3, -5)、培养基成分、培养条件 阅读提示:Methods: Establishment of syngeneic mouse cSCC cell lines |
| 测序分析 | 测序平台(NovaSeqX+150 PE)、比对参考基因组(mm10) 阅读提示:Methods: Next generation sequencing |
| 免疫表型分析 | 抗体克隆、稀释度、染色方案 阅读提示:Methods: Flow cytometric analysis |
| 免疫治疗 | 抗体剂量、给药途径、治疗时间点 阅读提示:Methods: Immunotherapy |