MG应激与肿瘤免疫微环境的关联
评估MG应激与肿瘤免疫细胞浸润的关系(特别关注g-MDSCs)
使用MMTV-PyMT自发模型,检测MG加合物和CD45+细胞;用肌肽处理,观察g-MDSCs变化;通过Glo1敲低在4T1和67NR模型中诱导MG应激,检测g-MDSCs等免疫细胞。
Turning off methylglyoxal stress: an alternative approach to inhibit MDSC expansion and metastasis in triple-negative breast cancer
包含体外细胞模型、两种临床前小鼠模型(MMTV-PyMT、4T1及67NR)、患者数据集分析及体内联合治疗实验,并进行功能验证和机制验证。
MMTV-PyMT自发乳腺癌小鼠模型 4T1乳腺癌同系小鼠模型 67NR乳腺癌同系小鼠模型 TCGA和METABRIC队列的TNBC患者数据
肌肽给药剂量:100 mg/kg,每周三次,腹腔注射 抗PD-1给药剂量:10 mg/kg,每周一次,腹腔注射 4T1和67NR细胞植入数量:50,000细胞/50 μL PBS,原位注射于乳腺脂肪垫 GLO1敲低(shGlo1)诱导内源性MG应激 统计学方法:使用t检验、ANOVA、Mann-Whitney U检验等
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估MG应激与肿瘤免疫细胞浸润的关系(特别关注g-MDSCs)
使用MMTV-PyMT自发模型,检测MG加合物和CD45+细胞;用肌肽处理,观察g-MDSCs变化;通过Glo1敲低在4T1和67NR模型中诱导MG应激,检测g-MDSCs等免疫细胞。
验证MG应激是否赋予非转移细胞转移能力
在67NR shGlo1肿瘤中,检测脾脏重量、g-MDSC扩增及肺转移形成。
探究MG应激促进转移的转录组机制
对4T1、67NR shnt和shGlo1细胞进行RNA-seq,PCA和GSEA分析,IPA构建网络,RT-qPCR验证候选基因。
评估MG应激特征在患者中的临床相关性
基于MDA-MB-231 GLO1敲低数据建立MG特征,在TCGA和METABRIC TNBC队列中计算MG评分,与MDSC特征和免疫抑制特征相关分析;在黑色素瘤队列(GSE78220)中比较应答者与非应答者的MG评分。
评估肌肽联合抗PD-1对4T1肿瘤生长和转移的影响
4T1荷瘤小鼠接受肌肽、抗PD-1或联合治疗,检测肿瘤重量、肺转移、免疫细胞(g-MDSCs、T细胞)变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Lonza | -- | |
| 嘌呤霉素 | Sigma-Aldrich | P9620 | |
| 药物处理 | L-肌肽 | Sigma-Aldrich | C9625 |
| 抗体 | InVivoPlus抗小鼠PD-1(CD279)克隆RMP1-14 | Bio X Cell | -- |
| 组织固定 | 甲醛 | VWR chemicals | 11699408 |
| IHC | Vectastain ABC试剂盒 | Vector Laboratories | -- |
| 代谢测定 | Seahorse XFp细胞外通量分析仪 | Agilent | -- |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| RNA提取 | NucleoSpin RNA试剂盒 | Macherey-Nagel | -- |
| RT-qPCR | cDNA合成试剂盒 | biotechrabbit | -- |
| Takyon Low ROX SYBR 2X MasterMix blue dTTP中的SYBR Green | Eurogentec | -- | |
| QuantStudio 3实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流式细胞术 | CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| FACSCanto II | BD Biosciences | -- | |
| FACSAria | BD | -- | |
| 细胞分离 | CD11b微珠 | Miltenyi Biotec | -- |
| CD8a+ T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-075 | |
| 细胞增殖检测 | CellTrace Violet | Invitrogen | -- |
| 细胞刺激 | Dynabeads小鼠T细胞激活剂CD3/CD28 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 流式细胞术 | BD LSRFortessa流式细胞仪 | BD | -- |
| MG定量 | MBo荧光探针 | -- | -- |
| 组织消化 | 胶原酶IA | Sigma | C2674 |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma | D4513 | |
| 免疫细胞分选 | MagniSort小鼠CD45阳性选择试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 细胞分选 | LS分离柱 | Miltenyi | -- |
| 细胞裂解 | 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Roche | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- |
| Western blot | 增强化学发光Western blot底物 | Pierce | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、年龄、性别;细胞注射数量和体积;注射部位(乳腺脂肪垫);麻醉剂量(氯胺酮75 mg/kg,甲苯噻嗪10 mg/kg) 阅读提示:Material and methods: In vivo metastatic breast cancer models |
| 药物处理 | 肌肽剂量(100 mg/kg)和频率(每周三次);抗PD-1剂量(10 mg/kg)和频率(每周一次);给药途径(腹腔注射);治疗开始时间(第7天) 阅读提示:Material and methods: In vivo metastatic breast cancer models; Figure 5a |
| 细胞模型 | 细胞系(4T1, 67NR)来源和认证;GLO1敲低(shGlo1)和对照(shnt)的构建;嘌呤霉素筛选浓度(5 μg/mL) 阅读提示:Material and methods: Cell culture and reagents |
| 免疫细胞分析 | 流式细胞术抗体panel和门控策略;组织消化条件(胶原酶IA浓度,DNase I浓度,时间);红细胞裂解条件 阅读提示:Material and methods: Immunophenotyping by flow cytometry; online supplemental table S2 |
| 转录组分析 | RNA-seq平台和数据分析流程(STAR, Salmon, DESeq2);GSEA参数(基因集、排序方法、p值阈值);IPA使用版本 阅读提示:Material and methods: RNA sequencing and gene expression profiling; Gene Set Enrichment analysis; Ingenuity Pathway Analysis |
| 患者数据分析 | MG特征基因列表和权重;TCGA和METABRIC数据获取和处理;MG评分计算方法;GSE78220数据集和响应定义 阅读提示:Material and methods: MG score generation and computation from public databases; online supplemental table S5 |