队列选择与基线评估
为了评估IL-18与心血管结局的关联,在不同人群中建立研究队列。
纳入MDC研究(n=4742)、UK Biobank(n=54219)和SUMMIT VIP(n=1500)的参与者,进行基线血浆IL-18测量和临床数据收集。
Associations of the inflammasome-dependent cytokine IL-18 with risk of coronary heart disease
研究包含多个大规模人群队列的观察性分析,并进行了统计学关联验证,但缺少功能实验和机制验证实验,属于观察性研究。
MDC队列 UK Biobank队列 SUMMIT VIP队列
IL-18血浆水平(NPX值) 随访时间(MDC:23年,UK Biobank:15年) 结局事件定义(MI和CV死亡,基于ICD编码) Cox回归模型调整的混杂因素(年龄、性别、胆固醇、血压、糖尿病、吸烟等)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
为了评估IL-18与心血管结局的关联,在不同人群中建立研究队列。
纳入MDC研究(n=4742)、UK Biobank(n=54219)和SUMMIT VIP(n=1500)的参与者,进行基线血浆IL-18测量和临床数据收集。
为了定量分析血浆IL-18水平。
使用邻位延伸技术(PEA)测量MDC和SUMMIT VIP队列的IL-18水平,UK Biobank使用Olink Explore测定。
为了确定IL-18水平与心肌梗死和心血管死亡风险的关联。
通过瑞典医院出院和国家死因登记(MDC)及ICD-10编码(UK Biobank)记录事件。
为了评估IL-18与动脉粥样硬化严重程度和血管功能障碍的关联。
在SUMMIT VIP队列中对颈动脉IMT和斑块进行超声测量,并使用EndoPAT和PWV评估内皮功能和动脉僵硬度。
为了探讨IL-18与免疫细胞亚群的关联。
在MDC研究中,对527名参与者的外周血单核细胞进行流式细胞术分析,计数单核细胞、T细胞和B细胞亚群。
为了检验IL-18与结局的独立关联并评估风险分层价值。
使用Cox比例风险回归模型和Kaplan-Meier曲线分析IL-18与MI和CV死亡的关系,并计算重分类指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白测量 | Proseek Multiplex CVD96×96 | Olink Bioscience | -- |
| Olink Explore assay | Olink | -- | |
| 细胞分离 | Lymphoprep | Stemcell Technologies | -- |
| 流式细胞术 | CyAn ADP | Beckman Coulter | -- |
| FlowJo | Treestar Inc. | -- | |
| CompBeads | BD Biosciences | -- | |
| 血液计数 | Sysmex K-1000 | -- | -- |
| 内皮功能检测 | EndoPAT | Itamar Medical | -- |
| 动脉僵硬度检测 | SphygmoCor | Atcor Medical | -- |
| 细胞刺激 | PMA | Sigma | -- |
| 离子霉素 | Sigma | -- | |
| 布雷菲德菌素A | Sigma | -- | |
| 流式细胞术 | 抗CD3-PE/Cy7抗体 | BioLegend | -- |
| 抗CD4-PB抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗CD8-AF700抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗CD25-PE抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗FoxP3-APC抗体 | eBioscience | -- | |
| 抗IFN-γ-PE抗体 | 未明确 | -- | |
| 抗CD14-Pacific Blue抗体 | 未明确 | -- | |
| 抗CD16-PE/Cy7抗体 | 未明确 | -- | |
| 抗CD19-FITC抗体 | 未明确 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 队列选择 | MDC队列纳入标准(年龄、地区)、UK Biobank参与者选择标准、SUMMIT VIP队列纳入标准(T2D和CVD状态) 阅读提示:Methods 2.1 |
| IL-18测量 | 血浆样本准备、PEA检测方法、批间和批内变异系数(CV)、分析范围 阅读提示:Methods 2.3 |
| 结局事件定义 | 心肌梗死定义(ICD-9/10编码)、心血管死亡定义、随访时间(MDC至2020年,UK Biobank 15年) 阅读提示:Methods 2.1, 2.2 |
| 统计分析 | Cox回归模型调整的协变量(年龄、性别、胆固醇、血压、糖尿病、吸烟等)、分组方法(三分位数)、数据转换(NPX) 阅读提示:Methods 2.6 |
| 免疫分型 | PBMC分离方法、抗体克隆号、染色方案、流式细胞仪设置、门控策略 阅读提示:Methods 2.5 |