TC-EVs的分离与表征
获得并验证肿瘤细胞来源的细胞外囊泡。
通过差速超速离心和尺寸排阻色谱从PANC-1、MiaPaCa-2和HPDE细胞条件培养基中分离EVs,并通过纳米颗粒跟踪分析、电子显微镜和Western blot验证EV特征。
Tumor cell-derived extracellular vesicles foster the immunosuppressive landscape of pancreatic cancer
包含体外细胞实验(单核细胞分化、T细胞功能)、蛋白质组学、临床队列分析、单细胞RNA测序等多个独立证据层级,并有功能验证。
人骨髓来源单核细胞 PANC-1和MiaPaCa-2胰腺癌细胞系 人原代胰腺癌相关成纤维细胞(CAFs) 人PDAC临床队列及单细胞RNA测序数据
TC-EVs的分离方法:差速超速离心结合尺寸排阻色谱 单核细胞处理条件:500,000个单核细胞与TC-EVs(2:1比例)处理2天 T细胞共培养比例及时间:巨噬细胞与T细胞1:1共培养72小时 CAF处理条件:100,000个CAFs与TC-EVs(2:1比例)处理8天 ECM上单核细胞分化及T细胞功能检测流程
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得并验证肿瘤细胞来源的细胞外囊泡。
通过差速超速离心和尺寸排阻色谱从PANC-1、MiaPaCa-2和HPDE细胞条件培养基中分离EVs,并通过纳米颗粒跟踪分析、电子显微镜和Western blot验证EV特征。
评估TC-EVs对健康供体单核细胞分化的直接影响。
从健康供体分离CD14+单核细胞,用TC1-EVs或TC2-EVs处理2天,培养5天后分析细胞表型、分泌谱和吞噬功能。
评估TC-EV分化巨噬细胞对T细胞增殖、活化和细胞毒性的影响。
将TC-EV分化的巨噬细胞与同供体活化T细胞共培养72小时,检测T细胞增殖、活化标志物表达及对肿瘤细胞的杀伤能力。
鉴定TC-EV分化巨噬细胞的特异性蛋白表达谱。
对TC1、TC2和HPDE EV分化的巨噬细胞进行质谱分析,筛选差异表达蛋白,并通过通路富集和STRING分析。
评估TC-EV分化巨噬细胞蛋白标志物与PDAC患者预后的相关性。
利用包含1,248个样本的PDAC元队列,分析12个共同差异表达蛋白基因的mRNA表达与临床特征和生存期的关联。
评估TC-EVs对CAFs产生的ECM结构的影响。
用TC1或TC2-EVs处理人原代CAFs 8天,脱细胞后通过免疫荧光和TWOMBLI分析纤维连接蛋白纤维的结构特征。
鉴定TC-EV处理CAFs后ECM蛋白组成的变化。
对TC1-EV处理或未处理的CAF-ECM进行质谱分析,筛选差异蛋白,并关注WNT通路相关蛋白。
验证SFRP1富集的ECM对单核细胞分化及T细胞功能的影响。
将单核细胞培养在TC-EV处理的CAF-ECM或补充重组SFRP1的ECM上,5天后检测巨噬细胞标志物,并与T细胞共培养评估其细胞毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM Glutamax培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Biosera | -- | |
| 抗生素-抗真菌剂 | Gibco | -- | |
| 角质细胞无血清培养基 | Gibco | -- | |
| DMEM F-12培养基 | Gibco | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | -- | |
| StemPro 细胞解离试剂 | Gibco | -- | |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | -- | |
| 细胞分离 | Ficoll-Paque密度梯度分离液 | Cytiva | -- |
| CD14磁珠 | Miltenyi Biotec | -- | |
| Pan T细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- | |
| autoMacs Pro磁性分离器 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 细胞培养 | T细胞活化试剂 | Miltenyi Biotec | -- |
| 白细胞介素-2 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 支原体检测试剂盒 | Lonza | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EV分离与表征 | TC-EVs的分离方法:差速超速离心和尺寸排阻色谱的具体参数 阅读提示:Methods: EVs' isolation and characterization |
| 单核细胞分化 | 单核细胞来源(健康供体)、处理剂量(EV比例)和时间 阅读提示:Methods: Treatment of monocytes with EVs and cocultures |
| T细胞功能实验 | T细胞活化方式、与巨噬细胞共培养的比例和时间 阅读提示:Methods: Treatment of monocytes with EVs and cocultures |
| CAF处理及ECM制备 | CAFs的来源、处理剂量和时间、ECM脱细胞方法 阅读提示:Methods: Primary PDAC CAFs' isolation and culture |
| SFRP1功能实验 | rSFRP1的浓度、ECM上单核细胞培养时间 阅读提示:Results: SFRP1 in TC-EV-treated CAF-derived ECM |