菌株构建与hVISA表型确认
验证qacA基因转化能否使VSSA转化为hVISA,并排除细胞壁增厚和生物膜因素的影响。
将pOS1-qacA质粒转化入ST5临床菌株S1-2-62,通过PAP-AUC法确认hVISA表型,并用TEM观察细胞壁厚度,结晶紫染色测定生物膜。
The efflux pump QacA mediates the transition to vancomycin heteroresistance in sequence type 5 methicillin-resistant Staphylococcus aureus via membrane lipid reprogramming
包含体外模型(ST5临床菌株及qacA转化株)、功能验证(膜流动性、FRAP、共聚焦)、机制验证(脂质组学、RT-qPCR)及协同杀菌实验。
ST5临床菌株S1-2-62(qacA阴性VSSA)及其qacA转化株 ST5临床菌株S1-2-32(验证株)
qacA基因是否携带(pOS1-qacA质粒转化) 万古霉素浓度(2 μg/mL)及处理时间(30分钟至24小时) 膜流动性及FRAP分析结果 脂质组学分析(二不饱和甘油磷脂富集) 长链不饱和脂肪酸协同杀菌效应(如γ-亚麻酸、α-亚麻酸)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证qacA基因转化能否使VSSA转化为hVISA,并排除细胞壁增厚和生物膜因素的影响。
将pOS1-qacA质粒转化入ST5临床菌株S1-2-62,通过PAP-AUC法确认hVISA表型,并用TEM观察细胞壁厚度,结晶紫染色测定生物膜。
检测qacA是否影响膜流动性及膜电位。
利用DPH荧光偏振法测量膜流动性,DiSC3(5)荧光探针监测膜电位变化。
观察qacA对万古霉素与细胞结合的影响。
使用FITC标记的万古霉素进行共聚焦显微镜动态成像,比较qacA菌株与空载体菌株的荧光强度差异。
识别qacA引起的膜脂组成变化,解释膜流动性增强的分子基础。
对qacA菌株和空载体菌株在万古霉素存在与否情况下进行脂质组学分析,提取总脂质,UPLC-MS/MS检测,比较差异脂质。
验证外源不饱和脂肪酸能否破坏qacA介导的膜适应,增强万古霉素杀菌活性。
将万古霉素与不同脂肪酸(γ-亚麻酸、α-亚麻酸、花生四烯酸、油酸、癸酸、辛酸、月桂酸)联合处理菌株,测定CFU变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | 胰蛋白胨大豆肉汤 | Oxoid | -- |
| 脑心浸液琼脂 | Oxoid | -- | |
| 药物处理 | 万古霉素 | National Institutes for Food and Drug Control, China | -- |
| 氯己定 | -- | -- | |
| TEM制样 | Epon 812树脂 | SPI | -- |
| 醋酸铀 | SPI | -- | |
| 柠檬酸铅 | Sigma | -- | |
| 生物膜染色 | 结晶紫 | Solarbio | -- |
| 共聚焦显微镜 | FITC-万古霉素 | Delta | -- |
| 碘化丙啶 | Solarbio | -- | |
| DAPI | MedChemExpress | -- | |
| 膜流动性 | DPH探针 | MedChemExpress | -- |
| 膜电位 | DiSC3(5) | MedChemExpress | -- |
| 膜脂质组学 | 溶葡萄球菌酶 | -- | -- |
| AVESTIN Emulsiflex高压均质机 | Beckman Coulter | -- | |
| 超高效液相色谱-串联质谱系统 | SCIEX | -- | |
| Thermo Accucore C30色谱柱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量 | ThermoFisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | RNA提取试剂盒 | Accurate Biotechnology | -- |
| cDNA逆转录试剂盒 | Vazyme | -- | |
| SYBR Green | Vazyme | -- | |
| QuantStudio 1实时PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 协同实验 | γ-亚麻酸 | MedChemExpress | HY-N7140 |
| α-亚麻酸 | MedChemExpress | HY-N0728 | |
| 花生四烯酸 | MedChemExpress | HY-109590 | |
| 油酸 | MedChemExpress | HY-N1446 | |
| 癸酸 | MedChemExpress | HY-W015309 | |
| 辛酸 | MedChemExpress | HY-41417R | |
| 月桂酸 | MedChemExpress | HY-Y0366R | |
| 槲皮素 | Macklin | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 菌株构建 | 质粒pOS1-qacA的构建方法及转化效率;qacA表达水平 阅读提示:Materials and methods 中的 Bacterial strains and culture conditions |
| hVISA表型检测 | 万古霉素浓度梯度(0.5-8 μg/mL)、BHIA培养基、Mu3对照菌株、AUC比值标准(0.9-1.3) 阅读提示:Materials and methods 中的 Susceptibility testing and hVISA detection |
| 膜流动性检测 | DPH探针浓度、荧光偏振测量条件、万古霉素处理浓度和时间 阅读提示:Materials and methods 中的 Membrane fluidity and potential |
| 脂质组学分析 | 细菌培养条件(OD600=0.6,万古霉素2 μg/mL处理30分钟)、脂质提取方法、UPLC-MS/MS参数(色谱柱、流动相、梯度) 阅读提示:Materials and methods 中的 Cell membrane lipidomics |
| 协同杀菌实验 | 脂肪酸种类及浓度(GLA 32 μg/mL、ALA 64 μg/mL、AA 32 μg/mL、OLA 32 μg/mL、DA 128 μg/mL、OCA 128 μg/mL、LA 32 μg/mL)、万古霉素2 μg/mL、处理时间6小时 阅读提示:Materials and methods 中的 Synergy assays 及 Figure 6 图注 |