基因祖先揭示了真核生物发生过程中的多样化微生物关联

真核生物的起源仍然是生物学中的一个核心谜团。持续的争论一致认为α变形菌与Asgard古菌之间的共生关系起着关键作用。然而，其他潜在细菌伙伴的性质、时间和贡献以及病毒相互作用的角色仍然存在争议。为了解决这些问题，我们使用了先进的系统发育基因组学方法和涵盖细胞生命和病毒已知多样性的全面数据集。我们的分析提供了对最后真核共同祖先（LECA）蛋白质组的修订重建，并追踪了每个蛋白质家族的系统发育起源。我们发现了来自多样化细菌供体的多波水平基因转移的有力证据，其中一些可能先于线粒体内共生。我们推断出了主要供体的可能特征及其对LECA的功能贡献。我们的发现支持水平基因转移对LECA之前祖先蛋白质组的塑造作用，并暗示核质病毒门（Nucleocytoviricota）病毒起到了促进作用。总之，我们的结果表明，古代真核生物可能在复杂的微生物生态系统中通过一系列多样化的关联而起源，这些关联留下了水平转移基因的足迹。