非侵入性头皮胶带剥离RNA测序捕获斑秃的疾病活动性和治疗反应特征

背景：胶带剥离RNA测序能够对炎症性皮肤病进行非侵入性的分子分析。然而，其捕获斑秃（AA）——一种以毛囊为中心的自身免疫性疾病——的免疫活性、疾病严重程度和治疗反应的能力，尚未在毛囊免疫活性和治疗反应的关联中进行系统评估。目的：确定头皮胶带剥离RNA测序是否捕获与AA疾病严重程度和治疗反应相关的免疫通路，并评估其与匹配头皮活检的一致性。方法：我们分析了61个RNA-seq图谱，包括46个头皮胶带剥离样本（19个健康对照，17个活动性AA，10个巴瑞替尼治疗后样本——5个应答者和5个无应答者）和15个皮损头皮活检。其中9对胶带剥离-活检样本来自同一头皮区域。使用协变量校正的线性模型和基因集富集分析对批次校正后的表达数据进行分析，探讨免疫、细胞毒性和毛囊上皮程序。结果：胶带剥离RNA测序稳健地重现了已确立的AA相关免疫特征，包括干扰素/JAK-STAT信号传导和细胞毒性T/NK细胞通路的激活，以及毛囊上皮程序的抑制。疾病严重程度的增加与进行性免疫激活和上皮丧失相关。巴瑞替尼应答者显示炎症信号的正常化部分，而无应答者持续存在免疫激活，与分子无应答一致。协变量校正模型鉴定了治疗反应特异性的转录变化。胶带剥离和活检转录组显示出高度一致性。结论：头皮胶带剥离RNA测序捕获了斑秃中临床相关的免疫和治疗反应性分子特征，并代表了一个用于毛囊中心性自身免疫病纵向免疫监测和基于生物标志物的治疗反应分层的很有前景的平台。