患者队列构建
纳入接受胚系检测的HGSOC患者,为分析年龄相关gPV提供样本。
纳入2015年1月1日至2022年11月15日期间经病理确诊的HGSOC患者,所有患者均接受了MSK-IMPACT≥76基因胚系测序。
Germline landscape of high grade serous ovarian cancer across age groups: Is age just a number?
本研究为回顾性队列分析,基于MSK-IMPACT测序和临床数据,包含统计建模,但缺乏前瞻性实验或功能性验证。
HGSOC患者队列(1231例)
年龄分组(≤49岁、50-69岁、≥70岁) ≥76基因胚系测序(MSK-IMPACT) gPV判定标准(ACMG/AMP) 多变量逻辑回归校正遗传祖先和NCI合并症指数
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
纳入接受胚系检测的HGSOC患者,为分析年龄相关gPV提供样本。
纳入2015年1月1日至2022年11月15日期间经病理确诊的HGSOC患者,所有患者均接受了MSK-IMPACT≥76基因胚系测序。
鉴定gPV并分类为与OC相关或非相关。
使用ACMG/AMP标准独立评估胚系变异,致病性和可能致病性变异报告为gPV;OC相关基因包括BRCA1等11个基因。
评估年龄与gPV之间的关联,并校正潜在混杂因素。
使用逻辑回归模型,以gPV为结局,年龄分组为主要预测变量,校正遗传祖先和NCI合并症指数。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因检测 | MSK-IMPACT | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者选择 | 病理确诊的HGSOC,接受≥76基因胚系测序,时间范围2015/1/1-2022/11/15 阅读提示:Materials & Methods: Patient Selection |
| 胚系变异分析 | 变异分类标准(ACMG/AMP),OC相关基因列表 阅读提示:Materials & Methods: Germline Analysis and Protocol for Genetic Counseling |
| 统计分析 | 年龄分组(≤49、50-69、≥70),校正变量(遗传祖先、NCI合并症指数),多变量逻辑回归模型 阅读提示:Materials & Methods: Statistical Analysis, Results: Table 2 |