转录组筛选
鉴定在成骨和成血管分化过程中的共同差异表达基因
对hDPSCs进行成骨诱导(第0、7、14天)和成血管诱导(第0、7天),收集细胞裂解物进行RNA测序,分析差异表达基因并进行GO和KEGG富集。
The Role of SERPINE1 in Coordinating Osteogenesis and Angiogenesis of hDPSCs for Bone Regeneration
包含体外细胞模型(hDPSCs、HUVECs)、体内动物模型(大鼠颅骨缺损、裸鼠Matrigel plug),并进行了功能获得/缺失验证、外源蛋白处理、组织学及影像学分析。
人牙髓干细胞(hDPSCs) 人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 大鼠临界尺寸颅骨缺损模型 裸鼠Matrigel plug模型
SERPINE1过表达和敲低的效率(qRT-PCR验证) 重组SERPINE1蛋白处理浓度(50和100 ng/mL) HA/CS微球的SERPINE1释放曲线(21天) 大鼠颅骨缺损模型中SERPINE1-DPSCs/MS组的骨再生效果(4周)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定在成骨和成血管分化过程中的共同差异表达基因
对hDPSCs进行成骨诱导(第0、7、14天)和成血管诱导(第0、7天),收集细胞裂解物进行RNA测序,分析差异表达基因并进行GO和KEGG富集。
验证SERPINE1对hDPSCs成骨和成血管分化及HUVEC管形成的影响
构建SERPINE1过表达和敲低的稳定细胞系,进行成骨诱导(ALP、ARS染色、Western blot、qRT-PCR)和成血管诱导(VEGFR2、CD31表达检测);收集条件培养基或直接添加重组SERPINE1蛋白处理HUVEC,进行管形成实验。
制备并表征负载SERPINE1的HA/CS微球,评估其理化性质和释放特性
通过乳化法制备HA/CS微球,采用SEM、AFM、EDS、XRD、TGA表征微球形态、元素分布和机械性能;评估细胞粘附效率;测定SERPINE1的体外释放曲线。
评估SERPINE1及其微球递送系统的体内促血管生成作用
将HUVECs、Matrigel和不同处理(对照、SERPINE1蛋白、SERPINE1+微球)混合皮下注射于裸鼠腋窝区,7天后取出栓体,通过免疫荧光检测CD31评估血管生成。
评估SERPINE1-DPSCs/MS复合材料在临界尺寸颅骨缺损中的血管化骨再生效果
构建大鼠颅骨5mm临界缺损模型,植入不同材料(空白、MS、SERPINE1、DPSCs/MS、SERPINE1-DPSCs/MS),4周后通过micro-CT、组织学染色和免疫荧光评估骨再生和血管新生。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | HyClone | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青链霉素 | HyClone | -- | |
| 内皮细胞生长培养基-2 | -- | -- | |
| 成骨分化 | β-甘油磷酸 | -- | -- |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| 抗坏血酸 | -- | -- | |
| 慢病毒感染 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript逆转录试剂盒 | TaKaRa | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| Millipore ECL试剂盒 | Millipore | -- | |
| RUNX2抗体 | Abcam | ab76956 | |
| SERPINE1抗体 | Abcam | ab317604 | |
| ALP抗体 | Abcam | ab229126 | |
| OPN抗体 | Abcam | ab166709 | |
| VEGFR2抗体 | Abcam | ab315238 | |
| I型胶原抗体 | Abcam | ab255809 | |
| ALP染色 | BCIP/NBT染色试剂盒 | Beyotime | -- |
| ALP活性检测 | ALP活性检测试剂盒 | Beyotime | C3206 |
| ARS染色 | 茜素红S溶液 | ServiceBio | -- |
| 氯化十六烷基吡啶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞增殖 | CCK-8试剂 | MCE | -- |
| 管形成实验 | Matrigel基质胶 | Corning | 356231 |
| 微球表征 | 壳聚糖粉末 | -- | -- |
| 纳米羟基磷灰石 | -- | -- | |
| 司盘-80 | -- | -- | |
| 环己烷 | -- | -- | |
| SERPINE1 ELISA试剂盒 | Abcam | ab269373 | |
| 免疫荧光 | CD31抗体(人特异性) | HUABIO | ET1608-48 |
| EMCN抗体 | Abcam | ab106100 | |
| FITC标记的山羊抗小鼠IgG | HUABIO | HA1003 | |
| FITC标记的山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00003-11 | |
| Alexa Fluor 488标记的抗小鼠IgG | Sangon Biotech | D110090 | |
| Alexa Fluor 594标记的抗兔IgG | Sangon Biotech | bs-0295G-AF594 | |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| 动物实验 | 青霉素 | -- | -- |
| micro-CT | SkyScan 1176显微CT扫描仪 | Bruker | -- |
| 流式细胞术 | BD FACSCanto II流式细胞仪 | BD | -- |
| 显微成像 | DM6B光学显微镜 | Leica | -- |
| Gemini 500扫描电子显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | hDPSCs使用α-MEM(含10% FBS、1%青链霉素)在37°C、5% CO2培养;成骨诱导培养基成分(DMEM/F12高糖、10mM β-甘油磷酸、10^-7 M地塞米松、50μg/mL抗坏血酸);成血管诱导培养基(EGM-2添加VEGF、bFGF、EGF) 阅读提示:2.1 细胞培养 |
| SERPINE1过表达/敲低 | 慢病毒感染复数(MOI=50),嘌呤霉素筛选浓度(2.5 μg/mL初始,随后1/3浓度维持),载体及病毒编号(OE: CON335,KD: CON313) 阅读提示:2.3 慢病毒的构建与转染 |
| 成骨分化检测 | ALP检测时间(7天),ARS检测时间(14天和21天),检测方法(BCIP/NBT染色、ALP活性试剂盒、1% ARS溶液) 阅读提示:2.6 碱性磷酸酶和茜素红S染色 |
| 成血管分化检测 | 成血管诱导时间(7天),VEGFR2和CD31表达检测(Western blot、qRT-PCR) 阅读提示:3.4 结果部分和图4 |
| 管形成实验 | HUVEC接种密度(10,000细胞/孔),Matrigel包被体积(50 μL),处理因素(条件培养基、重组SERPINE1浓度50和100 ng/mL),孵育时间(8小时) 阅读提示:2.8 管形成实验 |
| HA/CS微球制备 | 壳聚糖浓度(2% w/v),纳米羟基磷灰石用量(1.0 g),乳化转速和时间(1200 rpm,15分钟),交联剂和冻干条件 阅读提示:2.9 HA/CS MS的制备与表征 |
| 体内血管生成(Matrigel plug) | 裸鼠品系、性别、数量(雄性BALB/c,21只,每组7只),HUVEC数量(3×10^6),Matrigel体积(300 μL),皮下注射部位(腋窝),取材时间(7天) 阅读提示:2.10 裸鼠Matrigel plug实验 |
| 体内骨再生(大鼠颅骨缺损) | 大鼠品系、性别、年龄、体重(雄性SD,8周龄,250g),每组数量(6只),缺损直径(5mm),植入物组成(1×10^6细胞+1mL微球,50μL注入),观察时间(4周) 阅读提示:2.11 大鼠临界尺寸颅骨缺损模型 |
| micro-CT分析 | 扫描参数(90 kV,分辨率9 μm),分析参数(BMD、BV/TV、BS/TV、Tb.Th) 阅读提示:2.12 颅骨CT分析、组织学评估和免疫组织化学染色 |