中性粒细胞成熟阶段分析
描述不同心血管疾病状态下循环中性粒细胞的成熟谱,并量化未成熟细胞的动员程度。
通过光谱流式细胞术,基于CD10和CD16表达将中性粒细胞分为11个成熟阶段,比较HC、HF、卒中、NSTEMI、STEMI、ACP和STEMI随访组中的相对丰度。
Depth of neutrophil mobilization stratifies survival in ST-elevation myocardial infarction
包含多中心临床队列(探索性、衍生性、验证性队列)和体外细胞表型分析(流式、分选、染色、增殖检测),并进行了功能验证和机制关联分析。
STEMI患者队列 心力衰竭患者队列 缺血性卒中患者队列 急性胸痛患者队列
细胞因子谱(多个细胞因子水平) 未成熟粒细胞计数(IG) 30天生存状态 Killip分级
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
描述不同心血管疾病状态下循环中性粒细胞的成熟谱,并量化未成熟细胞的动员程度。
通过光谱流式细胞术,基于CD10和CD16表达将中性粒细胞分为11个成熟阶段,比较HC、HF、卒中、NSTEMI、STEMI、ACP和STEMI随访组中的相对丰度。
确认最不成熟的中性粒细胞群体是否为preNeus。
通过EdU掺入检测增殖能力,通过FACS分选和Giemsa染色观察细胞核形态。
探究系统性炎症反应与中性粒细胞动员深度之间的关联。
使用Olink Target 48 Cytokine panel测量血浆中43种细胞因子,通过相关分析和LASSO回归确定与各成熟阶段相关的细胞因子特征。
验证常规血常规中的未成熟粒细胞计数能否反映preNeus水平。
将流式细胞术测定的preNeu计数与自动血细胞分析仪报告的IG计数进行相关性分析,并通过细胞分选和血细胞分析仪验证IG特异识别preNeus。
评估IG计数对STEMI患者30天死亡率的预测能力。
在探索性、衍生性和验证性队列中,使用交叉验证AUC评估IG及其他生物标志物的判别能力,并通过多变量模型和Kaplan-Meier分析评估独立预后价值。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 流式分析 | Cytek Aurora | Cytek Biosciences | -- |
| 细胞分选 | FACS Aria III | BD | -- |
| 临床血细胞分析 | Sysmex XN-9000 | SYSMEX EUROPE SE | -- |
| Sysmex XN-9100 | SYSMEX EUROPE SE | -- | |
| Sysmex XN-1000 | SYSMEX EUROPE SE | -- | |
| 血浆细胞因子检测 | Olink Target 48 细胞因子panel | -- | -- |
| 增殖检测 | EdU (5-乙炔基-2'-脱氧尿苷) | Baseclick | -- |
| 抗体封闭 | Human TruStain FcX | BioLegend | -- |
| 细胞染色缓冲液 | 细胞染色缓冲液 | BioLegend | -- |
| 红细胞裂解 | 红细胞裂解液 | BioLegend | -- |
| 细胞分选 | REAlease试剂 | Miltenyi Biotec | -- |
| 免疫染色 | 抗CD66b (FITC) | Miltenyi Biotec | -- |
| 抗CD10 (APC) | Miltenyi Biotec | -- | |
| 抗CD16 (PerCP) | Miltenyi Biotec | -- | |
| 细胞培养 | RPMI培养基 | Gibco | -- |
| 吉姆萨染色 | 吉姆萨染色 | Sigma-Aldrich | -- |
| 离心涂片 | Cellspin III离心机 | Thermac | -- |
| 数据分析 | FlowJo v.10.10.0 | BD Bioscience | -- |
| GraphPad Prism 10 | GraphPad Software | -- | |
| R | -- | -- | |
| glmnet | -- | -- | |
| pROC | -- | -- | |
| Python | -- | -- | |
| NumPy | -- | -- | |
| pandas | -- | -- | |
| scikit-learn | -- | -- | |
| statsmodels | -- | -- | |
| patsy | -- | -- | |
| SciPy | -- | -- | |
| Matplotlib | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 流式细胞术 | 抗体克隆和稀释度、红细胞裂解时间、染色孵育时间 阅读提示:Methods - Spectral flow cytometry |
| 血浆细胞因子检测 | 使用的检测平台和panel,以及数据预处理步骤(log转换、缺失值插补) 阅读提示:Methods - Targeted plasma proteomics |
| 统计分析 | AUC计算采用五折交叉验证的out-of-fold预测,LASSO回归的lambda选择方法 阅读提示:Methods - Cross-validated receiver operating characteristic analysis and multivariate analysis, LASSO regression |
| 临床队列 | 各队列的纳入排除标准、STEMI的诊断标准、血液采集时间点(入院时、血运重建前) 阅读提示:Methods - Ethics of flow cytometry patient groups, Details on derivation STEMI cohort, Details on validation STEMI cohort (SYSTEMI) |
| 未成熟粒细胞计数 | 血细胞分析仪型号、IG计数的检测方法,以及IG的界定标准 阅读提示:Methods - Clinical blood test, Cell sorting of granulocyte subsets and blood counter analysis |