HFHS饮食诱导代谢应激
建立饮食诱导的胰岛素抵抗模型,并评估代谢参数。
WT和DKI小鼠从3-4个月大开始,分别喂食瘦饮食或HFHS饮食,持续至处死。测量体重、空腹血糖和口服葡萄糖耐量。
Insulin resistance alters cortical inhibitory neurons and microglia to exacerbate Alzheimer's knock-in mouse phenotypes
文献包含动物模型(DKI和WT小鼠)、行为学测试(MWM)、组织学(免疫荧光)、单核RNA测序等多层级实验,并包含功能验证(认知行为)和机制验证(转录组和蛋白表达)。
AppNL-G-F/MapthMAPT双敲入(DKI)小鼠 野生型C57BL/6J小鼠 高脂高糖(HFHS)饮食诱导的胰岛素抵抗模型
HFHS饮食开始年龄为3-4个月,持续至处死 MWM测试在10月龄进行 snRNA-seq在11.5月龄进行,每组4个生物学重复 DKI小鼠为纯合AppNL-G-F/MapthMAPT双敲入,WT小鼠为年龄匹配的C57BL/6J
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立饮食诱导的胰岛素抵抗模型,并评估代谢参数。
WT和DKI小鼠从3-4个月大开始,分别喂食瘦饮食或HFHS饮食,持续至处死。测量体重、空腹血糖和口服葡萄糖耐量。
评估空间学习和记忆能力。
在10月龄时进行MWM测试,包括前向训练、探针试验、反向训练和可见平台试验。
评估Aβ沉积、胶质细胞活化、突触密度和Meis2表达。
使用免疫荧光染色和STED显微镜观察皮层L2-3区域的Aβ、Iba1、Cd68、Trem2、GFAP、AT8、pThr217、突触蛋白和Meis2。
解析细胞类型特异性的转录组变化。
从皮层和海马组织分离细胞核,构建cDNA文库,进行snRNA-seq,分析胶质细胞和神经元的转录组。
鉴定小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞和抑制性神经元的差异表达基因和相关通路。
使用Wilcoxon秩和检验识别DEG,通过通路富集分析(ClueGO、STRING、IPA)和PPI网络分析来注释生物学功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 饮食诱导 | Tekland Global 18%蛋白饮食,S2018 | -- | -- |
| Research Diets D12450K | -- | -- | |
| Research Diets D12492 | -- | -- | |
| 血糖测量 | OneTouch Basic血糖仪 | LifeScan, Inc., USA | -- |
| 行为学 | JVC Everio G系列摄像机 | JVCKenwood | -- |
| Panlab Smart软件 | Harvard Bioscience | -- | |
| 组织切片 | Leica VT1000S振动切片机 | Leica | -- |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor™ 488 Tyramide SuperBoost试剂盒,链霉亲和素 | Invitrogen | B40932 |
| Reveal Decloaker缓冲液 | Biocare Medical | RV | |
| 成像 | Stellaris STED 8共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- |
| 成像分析 | Imaris软件 | Bitplane | -- |
| snRNA-seq | Chromium单细胞3'试剂盒v3 | 10x Genomics | -- |
| Illumina NovaSeq 5000测序仪 | Illumina | -- | |
| RNase抑制剂 | Roche | 03335402001 | |
| 组织学 | Superfrost Plus显微镜载玻片 | ThermoFisher Scientific | 22-037-246 |
| Prolong™ Glass封片剂 | ThermoFisher Scientific | P36984 | |
| 数据分析 | GraphPad Prism v9.2.0 | -- | -- |
| Cell Ranger Count流程(v6.1.2) | 10x Genomics | -- | |
| Scanpy v1.9.6 | -- | -- | |
| scvi-tools v0.20.3 | -- | -- | |
| Cytoscape(v3.9.1) | -- | -- | |
| ClueGO(v2.5.9) | -- | -- | |
| STRING(v2.0.0) | -- | -- | |
| Ingenuity Pathway Analysis(IPA) | Qiagen | -- | |
| 免疫荧光 | WFA-FITC | Vector Laboratories | FL-1351-2 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 饮食诱导 | 饮食类型(瘦饮食D12450K vs HFHS D12492)和开始年龄(3-4个月)、持续时间(至处死)。 阅读提示:Methods: HFHS diet paradigm and metabolic assessment |
| 代谢评估 | 血糖测量禁食时间(6小时)、OGTT剂量(2g/kg)和测量时间点(0和30分钟)。 阅读提示:Methods: HFHS diet paradigm and metabolic assessment |
| 行为学 | MWM训练范式(8天:3天前向、1天探针、3天反向、1天探针)、平台位置、水温、试验次数。 阅读提示:Methods: Morris Water Maze |
| 组织学 | 组织固定(4% PFA)、切片厚度(50μm)、抗体浓度(例如Iba1 1:600)、图像获取参数(STED),分析区域(皮层L2-3)。 阅读提示:Methods: Immunolabeling of mouse tissue and Imaging and analysis of mouse tissues |
| snRNA-seq | 组织收集(11.5月龄,皮层和海马合并)、细胞核提取条件、10x Genomics试剂盒版本、测序深度(450M reads/样本)、分析参数(过滤标准、聚类)。 阅读提示:Methods: Single-nuclei RNA sequencing and analysis |