化学合成HDO和GSH-HDO
制备HDO标准品及GSH-HDO加合物以用于定量分析。
通过DMDO氧化DMF合成HDO,并通过HDO与GSH反应合成GSH-HDO,使用NMR和质谱确认结构。
In vitro formation kinetics of two 2,5-dimethylfuran phase-I metabolites: cis-3-hexene-2,5-dione and 5-methylfurfuryl alcohol
文献包含体外微粒体孵育、重组CYP同工酶实验,并进行了动力学参数拟合,但缺乏体内或细胞水平验证。
人肝微粒体 重组人CYP同工酶系统(CYP1A2、CYP2B6、CYP2E1、CYP2D6、CYP3A4)
人肝微粒体来源(20名男性供体混合) CYP同工酶种类及浓度(100 pmol CYP/ml) DMF浓度范围和孵育时间(30分钟,20分钟) GSH浓度(4 mM) NADPH再生系统组成
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
制备HDO标准品及GSH-HDO加合物以用于定量分析。
通过DMDO氧化DMF合成HDO,并通过HDO与GSH反应合成GSH-HDO,使用NMR和质谱确认结构。
测定DMF在人肝微粒体中HDO和MFA的形成动力学。
将不同浓度DMF与人肝微粒体、NADPH再生系统、GSH共孵育,通过HPLC–ESI–MS/MS定量GSH-HDO,GC–MS定量MFA。
鉴定催化DMF代谢活化和MFA形成的CYP亚型及其动力学。
使用五种重组人CYP同工酶(CYP1A2、CYP2B6、CYP2E1、CYP2D6、CYP3A4)和对照,进行类似孵育,定量HDO和MFA形成。
计算HDO和MFA形成反应的Michaelis–Menten动力学参数。
将测得的代谢物形成速率对DMF浓度进行非线性拟合,获得Km和Vmax。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 化学合成 | cis-3-己烯-2,5-二酮 | -- | -- |
| 还原型L-谷胱甘肽 | -- | -- | |
| Synergi Polar-RP色谱柱 | Phenomenex | -- | |
| timsTOF Pro质谱仪 | Bruker | -- | |
| Synergi Hydro-RP色谱柱 | Phenomenex | -- | |
| 微粒体孵育 | 混合人肝微粒体 | Sigma Aldrich | -- |
| 重组CYP孵育 | Baculosome™ Plus试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| MFA定量 | 安捷伦7890A气相色谱系统 | Agilent Technologies | -- |
| 安捷伦5975C质谱仪 | Agilent Technologies | -- | |
| HP-5-MS熔融石英毛细管柱 | Agilent Technologies | -- | |
| GSH-HDO定量 | 安捷伦1200高效液相色谱系统 | Agilent Technologies | -- |
| API 3200三重四极杆质谱仪 | AB SCIEX | -- | |
| Synergi Hydro-RP色谱柱(150 × 3 mm) | Phenomenex | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 微粒体孵育 | 人肝微粒体来源(混合性别、供体数)、蛋白浓度(1 mg/ml)、NADPH再生系统组成(NADP+, G6P, G6PDH浓度)、GSH浓度(4 mM)、DMF浓度范围、孵育时间和温度(37°C,30分钟)、终止方法(20% TCA或饱和硫酸铵) 阅读提示:见Materials and methods中的Microsomal incubations部分 |
| 重组CYP孵育 | CYP同工酶种类、酶浓度(100 pmol CYP/ml)、NADPH再生系统组成(1.3 mM NADP+, 3.3 mM G6P, 0.4 U/ml G6PDH)、GSH浓度(4 mM)、DMF浓度范围、孵育时间(20分钟) 阅读提示:见Materials and methods中的Incubations with recombinant human CYP-isoenzyme systems部分 |
| GSH-HDO定量 | HPLC条件(色谱柱、流动相、梯度)、MS参数(MRM、离子对)、标准曲线范围(0.05–100 µM)、内标浓度(2 µM) 阅读提示:见Materials and methods中的Quantification of GSH-HDO by HPLC–ESI–MS/MS部分 |
| MFA定量 | GC–MS条件(色谱柱、温度程序、SIM离子)、内标(d5-FFA)浓度 阅读提示:见Materials and methods中的Sample preparation and quantification of MFA by GC–MS部分 |