样本收集与免疫组化/免疫荧光染色
鉴定并定位人胎儿睾丸和附睾中的免疫细胞亚群(CD45+白细胞、CD68+巨噬细胞、CD3+ T细胞、CD66b+中性粒细胞、类胰蛋白酶+/糜酶+肥大细胞)。
使用20例GW14-41的胎儿睾丸(及附睾)石蜡切片,进行IHC和IF染色,使用特异性抗体(表1),并通过明场和荧光显微镜观察,结合DAPI和laminin共染以显示组织结构。
Localisation of immune cell populations during human fetal testicular development
结合免疫组化/免疫荧光(20例胎儿样本)和公开scRNA-seq数据(GW6-16)两个证据层级,包含功能验证(如巨噬细胞在索旁分布)和机制探讨(如免疫细胞起源)。
人胎儿睾丸组织(GW14-41) 人胎儿附睾组织(存在时) 公开scRNA-seq数据(人胚胎和胎儿睾丸,GW6-16)
样本孕周范围:GW14-41,具体分布为GW14/15-20 (n=8), GW21-24 (n=8), GW25 (n=3), GW33-34 (n=3), GW41 (n=1) 固定方式:4% PFA固定 抗体克隆和稀释度(见表1,如CD68克隆PG-M1, 1:250) scRNA-seq数据来源:GEO accession GSE143356 阴性对照:省略一抗
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定并定位人胎儿睾丸和附睾中的免疫细胞亚群(CD45+白细胞、CD68+巨噬细胞、CD3+ T细胞、CD66b+中性粒细胞、类胰蛋白酶+/糜酶+肥大细胞)。
使用20例GW14-41的胎儿睾丸(及附睾)石蜡切片,进行IHC和IF染色,使用特异性抗体(表1),并通过明场和荧光显微镜观察,结合DAPI和laminin共染以显示组织结构。
利用公开scRNA-seq数据(GW6-16)分析免疫细胞的转录特征和发育轨迹。
从GEO(GSE143356)获取Guo等(2021)的10X Chromium数据,使用Seurat包进行聚类和UMAP分析,提取免疫细胞相关标记基因的表达谱。
将蛋白水平(IHC/IF)与转录水平(scRNA-seq)的结果进行整合,比较不同孕周免疫细胞群的变化,并与小鼠数据比较,推断免疫细胞的起源和潜在功能。
对比IHC/IF和scRNA-seq数据中免疫细胞标记的表达,分析巨噬细胞、T细胞、中性粒细胞和肥大细胞在不同发育阶段的丰度和分布,并讨论其可能的发育起源和功能意义。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学/免疫荧光 | 抗CD45抗体 | DAKO | M0701 |
| 抗CD3抗体 | DAKO | 0452 | |
| 抗CD68抗体 | DAKO | M0876 | |
| 抗类胰蛋白酶抗体(DAKO) | DAKO | 7052 | |
| 抗类胰蛋白酶抗体(Abcam) | Abcam | Ab2378 | |
| 抗糜酶抗体 | Abcam | Ab233103 | |
| 抗CD66b抗体 | BioLegend | G10F5 | |
| 抗层粘连蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | L9393 | |
| 兔抗鼠生物素化二抗 | DAKO | E0468 | |
| 山羊抗小鼠HRP偶联二抗 | Dianova | 115-035-003 | |
| 免疫荧光 | 驴抗兔Alexa Fluor 488二抗 | Invitrogen | A21202 |
| 驴抗小鼠Alexa Fluor 555二抗 | Invitrogen | A31572 | |
| 免疫组织化学 | Vectastain Elite ABC试剂盒 | Vector Laboratories | -- |
| DAB显色液 | Agilent Technologies | -- | |
| DPX封片剂 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI染液 | Invitrogen | D3571 |
| ProLong Gold封片剂 | Invitrogen | -- | |
| 免疫组织化学 | 柠檬酸盐缓冲液 | Sigma-Aldrich | -- |
| 过氧化氢 | Merck Millipore | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 驴正常血清 | -- | -- |
| 图像采集 | 奥林巴斯VS120切片扫描仪 | Olympus Life Science | -- |
| 图像分析 | OlyVIA软件 | Olympus Life Science | 2.9.1 |
| scRNA-seq分析 | Seurat(R包) | -- | v4.0 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本收集 | 样本来源:大学萨格勒布医学院组织学与胚胎学系和哥本哈根大学医院;孕周范围和样本量(GW14/15-20 n=8, GW21-24 n=8, GW25 n=3, GW33-34 n=3, GW41 n=1);固定方式:4% PFA 阅读提示:Materials and methods - Samples |
| 免疫组织化学/免疫荧光 | 抗体克隆和稀释度(表1);抗原修复条件(柠檬酸盐缓冲液pH 6.0);阻断条件(5% BSA);一抗孵育(4°C过夜);二抗孵育(RT 1h);检测系统(Vectastain Elite ABC kit和DAB) 阅读提示:Materials and methods - Immunohistochemistry, Immunofluorescence, Table 1 |
| scRNA-seq数据分析 | 数据来源:GEO accession GSE143356;样本孕周:GW6-8, 12, 15, 16;分析软件:Seurat v4.0;聚类参数:基于显著主成分 阅读提示:Materials and methods - Cell type identification and clustering using Seurat |
| 免疫细胞分类 | 分类标准:基于细胞大小、核形态和标志物;定位分类:‘border’和‘inner area’,更细分为间质、睾丸周边、血管内、索周、索内 阅读提示:Materials and methods - Imaging and morphometric analysis |